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肝泡型包蟲病侵及膽道患者膽汁外泌體microRNA的檢測及生物信息學分析

發(fā)布時間:2021-09-05 13:00
  目的檢測肝泡型包蟲病侵及膽道患者膽汁中外泌體microRNA(miRNA)的表達情況,探索差異miRNA對靶基因的調(diào)控機制。方法收集自2017年8月-2018年10月就診于青海大學附屬醫(yī)院的12例肝泡型包蟲病患者膽汁樣本,觀察組(有膽道受侵表現(xiàn))與對照組(無膽道受侵表現(xiàn))各6例。經(jīng)超速離心法提取、Western Blot鑒定兩組膽汁中的外泌體結(jié)構(gòu),采用Trizol法提取外泌體總RNA,再經(jīng)miRNA表達譜芯片實驗檢測并尋找差異表達的miRNA。根據(jù)差異miRNA預測膽道侵犯靶基因,并進行通路富集分析。結(jié)果觀察組與對照組比較,共有74個差異表達的miRNAs,其中9個表達上調(diào),65個表達下調(diào)(|Fold Change|> 2)。經(jīng)Pathway分析,靶基因主要富集在腫瘤發(fā)生、磷脂酰肌醇信號系統(tǒng)、PTEN等通路中(FDR <0.05)。經(jīng)GO注釋及富集分析,靶基因主要富集在基因抑制的正向調(diào)控、調(diào)控細胞分化等生物過程(FDR <0.05)。結(jié)論建立肝泡型包蟲病合并膽道侵犯膽汁中外泌體差異miRNA表達譜,可作為泡型包蟲病侵及膽道的生物學標志物,初步闡釋了肝泡型包蟲病侵及膽道... 

【文章來源】:臨床肝膽病雜志. 2020,36(09)北大核心

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

肝泡型包蟲病侵及膽道患者膽汁外泌體microRNA的檢測及生物信息學分析


Western Blot檢測外泌體特異性蛋白結(jié)果

分布曲線,強度,信號,分布曲線


各樣本信號強度分布曲線

線圖,線圖,對數(shù),信號


各樣本相對對數(shù)信號強度箱線圖

【參考文獻】:
期刊論文
[1]Exosome及其他胞外囊泡在病原微生物中的研究進展[J]. 賀平,袁東亞,吳忠道.  中國病原生物學雜志. 2017(04)
[2]原發(fā)性肝癌侵犯膽道的ERCP特征[J]. 王錦波,何振平,陳維亮.  實用醫(yī)藥雜志. 2004(11)



本文編號:3385395

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