采集吉林省延邊州1例輸入性登革熱疑似病例全血樣本,通過實時熒光RT-qPCR方法進(jìn)行實驗室確診,再通過基因擴(kuò)增和測序,鑒定其基因型,分析病毒溯源。結(jié)果顯示,該病例全血樣本登革病毒核酸檢測陽性,確診為登革熱,經(jīng)基因擴(kuò)增和序列分析,其病毒基因序列與引起2017年越南登革熱暴發(fā)疫情的登革病毒Ⅰ型基因序列同源性為99%。經(jīng)系統(tǒng)進(jìn)化分析,該基因序列與越南登革病毒株101-TN-056和111-HD-004基因序列處于同一個分枝。結(jié)果表明,該病例為輸入性登革熱病例,為登革病毒Ⅰ型感染,病毒來源于越南。 

【文章來源】：寄生蟲與醫(yī)學(xué)昆蟲學(xué)報. 2020,27(02)

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吉林延邊州1例輸入性登革熱病例登革病毒基因序列系統(tǒng)進(jìn)化分析

表1 登革病毒型特異性引物Tab.1 Specific primers for dengue virus 引物Primers 序列Sequence(5′-3′) 靶序列(基因)Gene 片段Size (bp) DV-1 GGACTGCGTATGGAGTTTTG E-NS1 490 ATGGGTTGTGGCCTAATCAG DV-2 GTTCCTCTGCAAACACTCCA E 230 GTGTTATTTTGAGTTTCCTTG DV-3 GTGCTTACACAGCCCTGTTT E-NS1 320 TCCATTCTCCCAATCTCCTG DV-4 CCATTATGGCTGTGTTGTTT NS2a-NS2b 398 CTTCATCCTGCTTCACTTCT圖2 吉林延邊州1例輸入性登革熱病例登革病毒基因序列系統(tǒng)進(jìn)化分析


本文編號：3342161