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尖銳濕疣患者環(huán)狀RNA芯片的差異表達

發(fā)布時間:2021-08-13 20:15
  目的分析尖銳濕疣患者皮損組織環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)芯片的差異表達。方法采用環(huán)狀RNA微陣列芯片技術(shù)對4例尖銳濕疣患者和3例正常對照進行circRNA初步研究,挑選出6個顯著差異表達的circRNAs,并利用定量實時逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)進行驗證。結(jié)果與對照組相比,尖銳濕疣組患者表達異常的circRNAs共有378個,其中142個circRNAs表達上調(diào),236個circRNAs表達下調(diào)(fold change≥1. 5,P <0. 05)。生物學(xué)信息分析顯示差異表達的circRNA與miRNA有關(guān),下調(diào)表達的hsacircRNA104121可能通過調(diào)控hsa-miR-143-3p影響上皮細胞生物學(xué)行為。結(jié)論尖銳濕疣組織存在多個差異表達的circRNAs,后者通過與相應(yīng)的miRNA結(jié)合在尖銳濕疣的發(fā)病過程中發(fā)揮重要作用,涉及細胞增殖、凋亡等多個方面,值得進一步探討。 

【文章來源】:中國皮膚性病學(xué)雜志. 2020,34(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 對象和標本
    1.2 微陣列芯片分析
    1.3 RNA標記和擴增
    1.4 RT-PCR
    1.5 生物信息學(xué)分析
    1.6 統(tǒng)計學(xué)處理
    1.7 數(shù)據(jù)挖掘和miRNA反應(yīng)元件的序列分析
2 結(jié)果
    2.1 circRNA芯片檢測結(jié)果
    2.2 尖銳濕疣組織circRNA芯片的差異表達
    2.3 circRNA和可能的靶miRNA之間的關(guān)系
3 討論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]甲型流感病毒感染小鼠肺組織中環(huán)狀RNA的表達變化及其靶基因功能分析[J]. 謝琿,張歡歡,馬月,俞文英,余陳歡.  國際流行病學(xué)傳染病學(xué)雜志. 2016 (06)



本文編號:3341070

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