吉林省流感流行趨勢預(yù)測及流感病毒遺傳變異分析
發(fā)布時間:2021-07-28 14:14
目的:研究旨在了解吉林省2009年5月至2016年12月流感的流行趨勢,并建立ARIMA預(yù)測模型,運用模型預(yù)測吉林省2017年1-3月的流感門診發(fā)病率,并用真實門診發(fā)病率進行擬合檢驗,確認(rèn)ARIMA模型是否建立合適。研究2013-2017年吉林省H3N2亞型與B型Yamagata系流感病毒HA和NA基因遺傳變異,了解吉林省流感病毒的進化情況,為吉林省流感防控工作提供科學(xué)依據(jù)。方法:收集吉林省流感監(jiān)測系統(tǒng)上2009年5月到2017年3月的監(jiān)測數(shù)據(jù),運用Excel、SPSS24.0軟件整理流感監(jiān)測數(shù)據(jù),使用RStudio3.4.3軟件中的“tseries”與“forecast”包建立ARIMA預(yù)測模型。獲取吉林省疾病預(yù)防控制中心的H3N2亞型流感病毒毒株46株,B型Yamagata系流感病毒毒株24株,通過RT-PCR和測序方法獲得HA、NA基因片段,運用Sequencher5.3軟件進行基因片段拼接,使用MEGA6.0.6軟件將流感毒株序列與選取的參考株序列進行遺傳變異分析。結(jié)果:1.流感監(jiān)測數(shù)據(jù)建立的ARIMA模型為ARIMA(1,0,0)(1,0,0)12,該模...
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
流感流行趨勢預(yù)測分析路線
流感病毒遺傳變異分析技術(shù)路線圖
吉林省2009年5月~2016年12月流感門診發(fā)病率時間序列及分解圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2013-2014年南寧市A(H3N2)亞型流感病毒病原學(xué)特征分析[J]. 秦劍秋,王亮,劉海燕,黃莉. 中國病原生物學(xué)雜志. 2017(06)
[2]2015—2016年南通地區(qū)流感病毒流行特征及變異規(guī)律研究[J]. 劉源,熊海平,吳鉑,王昱凱,徐申亞,莊勛. 中國校醫(yī). 2017(06)
[3]ARIMA模型預(yù)測深圳寶安區(qū)流感樣病例發(fā)病率的可行性[J]. 鄧偉中,張浩洋,李苑. 疾病監(jiān)測與控制. 2017(06)
[4]2010-2015年湖北省H3N2亞型流感病毒抗原漂移分析[J]. 方斌,余曉,李翔,葉國軍,劉琳琳. 疾病監(jiān)測. 2017(05)
[5]哈爾濱市2015年H3N2型流感病毒分子特性及耐藥性研究[J]. 懷清杰,王宇,梁爽,杜溪喬,范榮軍,王建. 中國衛(wèi)生檢驗雜志. 2017(10)
[6]自回歸求和移動平均模型在流感發(fā)病預(yù)測中的應(yīng)用[J]. 李廣智,劉峰,王維華,朱妮,邱琳. 中國熱帶醫(yī)學(xué). 2016(12)
[7]ARIMA模型在新疆流感樣病例占門急診病例百分比預(yù)測中的應(yīng)用[J]. 趙俊,劉萬里,李新蘭,毋躍文,張璇,郜振國,劉紅斌,王希江. 職業(yè)與健康. 2016(21)
[8]重慶市2009~2014年甲型H1N1流感病毒分離株HA基因變異分析[J]. 葉盛,喻臻,陳爽,凌華,熊宇,李勤. 重慶醫(yī)學(xué). 2016(30)
[9]吉林省2012-2014年流感病原學(xué)監(jiān)測分析[J]. 楊成程,鄧立權(quán),欒博,盧欣榮,孫平輝,白冰. 實用預(yù)防醫(yī)學(xué). 2016(10)
[10]2009-2015年中國甲型H1N1流感病毒血凝素基因進化分析[J]. 顏文娟,郭艷,李小杉,李偉,宣楊,宋玥,方坤,衛(wèi)平民. 微生物學(xué)通報. 2017(02)
博士論文
[1]基于社會網(wǎng)絡(luò)理論的流感傳播特征及防控措施效果評價[D]. 黃淑瓊.華中科技大學(xué) 2010
[2]上海地區(qū)人甲型流感病毒基因變異與季節(jié)性流行關(guān)系的研究[D]. 施強.復(fù)旦大學(xué) 2010
碩士論文
[1]山東省H3N2亞型流感病毒的分子流行病學(xué)研究[D]. 亓倩.山東大學(xué) 2017
[2]云南省2009-2014年流感樣病例監(jiān)測及分離毒株變異研究[D]. 李芫苑.昆明醫(yī)科大學(xué) 2015
[3]2007-2011年深圳市流感H3N2亞型HA、NA基因的分子進化研究[D]. 張梅娟.南方醫(yī)科大學(xué) 2014
[4]廣西H3N2亞型和H1N1亞型寵物犬流感病毒的分子流行病學(xué)調(diào)查及其遺傳進化分析[D]. 莫彥寧.廣西大學(xué) 2014
[5]B型流感病毒的遺傳特性分析與感染性克隆的構(gòu)建[D]. 岳秀芳.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]長春地區(qū)H1N1流感病毒HA、NA基因分析及抗原性變異研究[D]. 忻悅.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[7]2006~2011年長春市流感監(jiān)測情況分析[D]. 陰媛.吉林大學(xué) 2012
[8]2005-2010年濟南市季節(jié)性流感及新甲型H1N1流感監(jiān)測數(shù)據(jù)分析[D]. 李戰(zhàn).山東大學(xué) 2011
[9]1998-2009年浙江省流感主要流行株H3N2的全基因組特性研究[D]. 趙斐斐.寧波大學(xué) 2011
[10]上海地區(qū)流感流行與甲型流感病毒變異情況的研究[D]. 呂錫宏.復(fù)旦大學(xué) 2010
本文編號:3308067
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
流感流行趨勢預(yù)測分析路線
流感病毒遺傳變異分析技術(shù)路線圖
吉林省2009年5月~2016年12月流感門診發(fā)病率時間序列及分解圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2013-2014年南寧市A(H3N2)亞型流感病毒病原學(xué)特征分析[J]. 秦劍秋,王亮,劉海燕,黃莉. 中國病原生物學(xué)雜志. 2017(06)
[2]2015—2016年南通地區(qū)流感病毒流行特征及變異規(guī)律研究[J]. 劉源,熊海平,吳鉑,王昱凱,徐申亞,莊勛. 中國校醫(yī). 2017(06)
[3]ARIMA模型預(yù)測深圳寶安區(qū)流感樣病例發(fā)病率的可行性[J]. 鄧偉中,張浩洋,李苑. 疾病監(jiān)測與控制. 2017(06)
[4]2010-2015年湖北省H3N2亞型流感病毒抗原漂移分析[J]. 方斌,余曉,李翔,葉國軍,劉琳琳. 疾病監(jiān)測. 2017(05)
[5]哈爾濱市2015年H3N2型流感病毒分子特性及耐藥性研究[J]. 懷清杰,王宇,梁爽,杜溪喬,范榮軍,王建. 中國衛(wèi)生檢驗雜志. 2017(10)
[6]自回歸求和移動平均模型在流感發(fā)病預(yù)測中的應(yīng)用[J]. 李廣智,劉峰,王維華,朱妮,邱琳. 中國熱帶醫(yī)學(xué). 2016(12)
[7]ARIMA模型在新疆流感樣病例占門急診病例百分比預(yù)測中的應(yīng)用[J]. 趙俊,劉萬里,李新蘭,毋躍文,張璇,郜振國,劉紅斌,王希江. 職業(yè)與健康. 2016(21)
[8]重慶市2009~2014年甲型H1N1流感病毒分離株HA基因變異分析[J]. 葉盛,喻臻,陳爽,凌華,熊宇,李勤. 重慶醫(yī)學(xué). 2016(30)
[9]吉林省2012-2014年流感病原學(xué)監(jiān)測分析[J]. 楊成程,鄧立權(quán),欒博,盧欣榮,孫平輝,白冰. 實用預(yù)防醫(yī)學(xué). 2016(10)
[10]2009-2015年中國甲型H1N1流感病毒血凝素基因進化分析[J]. 顏文娟,郭艷,李小杉,李偉,宣楊,宋玥,方坤,衛(wèi)平民. 微生物學(xué)通報. 2017(02)
博士論文
[1]基于社會網(wǎng)絡(luò)理論的流感傳播特征及防控措施效果評價[D]. 黃淑瓊.華中科技大學(xué) 2010
[2]上海地區(qū)人甲型流感病毒基因變異與季節(jié)性流行關(guān)系的研究[D]. 施強.復(fù)旦大學(xué) 2010
碩士論文
[1]山東省H3N2亞型流感病毒的分子流行病學(xué)研究[D]. 亓倩.山東大學(xué) 2017
[2]云南省2009-2014年流感樣病例監(jiān)測及分離毒株變異研究[D]. 李芫苑.昆明醫(yī)科大學(xué) 2015
[3]2007-2011年深圳市流感H3N2亞型HA、NA基因的分子進化研究[D]. 張梅娟.南方醫(yī)科大學(xué) 2014
[4]廣西H3N2亞型和H1N1亞型寵物犬流感病毒的分子流行病學(xué)調(diào)查及其遺傳進化分析[D]. 莫彥寧.廣西大學(xué) 2014
[5]B型流感病毒的遺傳特性分析與感染性克隆的構(gòu)建[D]. 岳秀芳.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]長春地區(qū)H1N1流感病毒HA、NA基因分析及抗原性變異研究[D]. 忻悅.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[7]2006~2011年長春市流感監(jiān)測情況分析[D]. 陰媛.吉林大學(xué) 2012
[8]2005-2010年濟南市季節(jié)性流感及新甲型H1N1流感監(jiān)測數(shù)據(jù)分析[D]. 李戰(zhàn).山東大學(xué) 2011
[9]1998-2009年浙江省流感主要流行株H3N2的全基因組特性研究[D]. 趙斐斐.寧波大學(xué) 2011
[10]上海地區(qū)流感流行與甲型流感病毒變異情況的研究[D]. 呂錫宏.復(fù)旦大學(xué) 2010
本文編號:3308067
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