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華支睪吸蟲鈣調蛋白基因的功能預測及其在華支睪吸蟲成蟲活動和囊蚴脫囊中的作用探討

發(fā)布時間:2021-06-26 06:55
  目的采用生物信息學方法分析預測華支睪吸蟲鈣調蛋白(CsCaM)基因的結構和功能,通過體內實驗觀察其對華支睪吸蟲成蟲活動能力和囊蚴脫囊的影響。方法利用生物信息學方法對華支睪吸蟲鈣調蛋白基因及其對應蛋白質的理化性質和空間構象進行預測,并通過對其他CaM序列進行同源性比對,分析該基因的進化規(guī)律。用CaM抑制劑三氟拉嗪(TFP)與華支睪吸蟲成蟲、囊蚴分別孵育,觀察成蟲活動能力以及囊蚴脫囊情況。結果 CsCaM基因編碼區(qū)在第93-543 bp,編碼149個氨基酸。編碼蛋白的等電點為4.14,理論相對分子質量為16.8×103。拓撲結構分析該蛋白無信號肽和跨膜區(qū)。InterProScan預測CsCaM含2個超家族,4個EF手性結構域(1個超家族含有2個EF結構域),分別位于aa21-aa33,aa57-aa69,aa94-aa106和aa130-aa142。CsCaM與其他物種CaM的同源性均在90%以上。TFP與華支睪吸蟲成蟲和囊蚴共孵育后,實驗組成蟲活動能力和囊蚴脫囊率均較對照組有所下降。結論 CsCaM具有鈣離子信號蛋白的特性,參與華支睪吸蟲成蟲活動和囊蚴脫囊,是華支睪... 

【文章來源】:中國病原生物學雜志. 2020,15(10)北大核心CSCD

【文章頁數】:7 頁

【部分圖文】:

華支睪吸蟲鈣調蛋白基因的功能預測及其在華支睪吸蟲成蟲活動和囊蚴脫囊中的作用探討


華支睪吸蟲CaM全長cDNA序列及其ORF編碼的氨基酸序列

功能圖,結構域,一級結構,水性


InterProScan分析CsCaM的氨基酸序列含有2個超家族,4個EF手性結構域(1個超家族含有2個EF結構域),分別位于aa21-aa33、aa57-aa69、aa94-aa106和aa130-aa142(圖 2)。5 CsCaM的空間結構和親水性特征

二級結構,氨基酸,包埋


Sec(secondary structure)軟件分析CsCaM蛋白的二級結構,α螺旋(H)、β折疊(E)及無規(guī)卷曲(L)分別占59.06%、0和40.94%。預測每個氨基酸的溶劑可及性(solvent accessibility, Acc),超過16%的表面暴露的定義為暴露氨基酸(e),其余為包埋氨基酸(b)。從分析結果看,69.13%的氨基酸殘基暴露在溶液界面,其余30.87%氨基酸殘基包埋在蛋白質內部。Htm預測該蛋白無跨膜區(qū)(圖 3)。6 CsCaM的三維結構[9]

【參考文獻】:
期刊論文
[1]華支睪吸蟲感染與膽管癌發(fā)病關系的研究進展[J]. 馮銘彬,劉超.  中華肝臟外科手術學電子雜志. 2017(06)
[2]華支睪吸蟲生活史在實驗室的建立[J]. 梁熾,胡旭初,呂志躍,吳忠道,余新炳,徐勁,鄭煥欽.  中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志. 2009(02)
[3]血吸蟲鈣調蛋白與吡喹酮殺蟲作用機理[J]. 潘星清,郭菁.  中國寄生蟲病防治雜志. 1990(01)



本文編號:3250860

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