華支睪吸蟲鈣調(diào)蛋白基因的功能預(yù)測(cè)及其在華支睪吸蟲成蟲活動(dòng)和囊蚴脫囊中的作用探討
發(fā)布時(shí)間:2021-06-26 06:55
目的采用生物信息學(xué)方法分析預(yù)測(cè)華支睪吸蟲鈣調(diào)蛋白(CsCaM)基因的結(jié)構(gòu)和功能,通過體內(nèi)實(shí)驗(yàn)觀察其對(duì)華支睪吸蟲成蟲活動(dòng)能力和囊蚴脫囊的影響。方法利用生物信息學(xué)方法對(duì)華支睪吸蟲鈣調(diào)蛋白基因及其對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和空間構(gòu)象進(jìn)行預(yù)測(cè),并通過對(duì)其他CaM序列進(jìn)行同源性比對(duì),分析該基因的進(jìn)化規(guī)律。用CaM抑制劑三氟拉嗪(TFP)與華支睪吸蟲成蟲、囊蚴分別孵育,觀察成蟲活動(dòng)能力以及囊蚴脫囊情況。結(jié)果 CsCaM基因編碼區(qū)在第93-543 bp,編碼149個(gè)氨基酸。編碼蛋白的等電點(diǎn)為4.14,理論相對(duì)分子質(zhì)量為16.8×103。拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析該蛋白無信號(hào)肽和跨膜區(qū)。InterProScan預(yù)測(cè)CsCaM含2個(gè)超家族,4個(gè)EF手性結(jié)構(gòu)域(1個(gè)超家族含有2個(gè)EF結(jié)構(gòu)域),分別位于aa21-aa33,aa57-aa69,aa94-aa106和aa130-aa142。CsCaM與其他物種CaM的同源性均在90%以上。TFP與華支睪吸蟲成蟲和囊蚴共孵育后,實(shí)驗(yàn)組成蟲活動(dòng)能力和囊蚴脫囊率均較對(duì)照組有所下降。結(jié)論 CsCaM具有鈣離子信號(hào)蛋白的特性,參與華支睪吸蟲成蟲活動(dòng)和囊蚴脫囊,是華支睪...
【文章來源】:中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2020,15(10)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
華支睪吸蟲CaM全長(zhǎng)cDNA序列及其ORF編碼的氨基酸序列
InterProScan分析CsCaM的氨基酸序列含有2個(gè)超家族,4個(gè)EF手性結(jié)構(gòu)域(1個(gè)超家族含有2個(gè)EF結(jié)構(gòu)域),分別位于aa21-aa33、aa57-aa69、aa94-aa106和aa130-aa142(圖 2)。5 CsCaM的空間結(jié)構(gòu)和親水性特征
Sec(secondary structure)軟件分析CsCaM蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu),α螺旋(H)、β折疊(E)及無規(guī)卷曲(L)分別占59.06%、0和40.94%。預(yù)測(cè)每個(gè)氨基酸的溶劑可及性(solvent accessibility, Acc),超過16%的表面暴露的定義為暴露氨基酸(e),其余為包埋氨基酸(b)。從分析結(jié)果看,69.13%的氨基酸殘基暴露在溶液界面,其余30.87%氨基酸殘基包埋在蛋白質(zhì)內(nèi)部。Htm預(yù)測(cè)該蛋白無跨膜區(qū)(圖 3)。6 CsCaM的三維結(jié)構(gòu)[9]
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]華支睪吸蟲感染與膽管癌發(fā)病關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 馮銘彬,劉超. 中華肝臟外科手術(shù)學(xué)電子雜志. 2017(06)
[2]華支睪吸蟲生活史在實(shí)驗(yàn)室的建立[J]. 梁熾,胡旭初,呂志躍,吳忠道,余新炳,徐勁,鄭煥欽. 中國(guó)寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2009(02)
[3]血吸蟲鈣調(diào)蛋白與吡喹酮?dú)⑾x作用機(jī)理[J]. 潘星清,郭菁. 中國(guó)寄生蟲病防治雜志. 1990(01)
本文編號(hào):3250860
【文章來源】:中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2020,15(10)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
華支睪吸蟲CaM全長(zhǎng)cDNA序列及其ORF編碼的氨基酸序列
InterProScan分析CsCaM的氨基酸序列含有2個(gè)超家族,4個(gè)EF手性結(jié)構(gòu)域(1個(gè)超家族含有2個(gè)EF結(jié)構(gòu)域),分別位于aa21-aa33、aa57-aa69、aa94-aa106和aa130-aa142(圖 2)。5 CsCaM的空間結(jié)構(gòu)和親水性特征
Sec(secondary structure)軟件分析CsCaM蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu),α螺旋(H)、β折疊(E)及無規(guī)卷曲(L)分別占59.06%、0和40.94%。預(yù)測(cè)每個(gè)氨基酸的溶劑可及性(solvent accessibility, Acc),超過16%的表面暴露的定義為暴露氨基酸(e),其余為包埋氨基酸(b)。從分析結(jié)果看,69.13%的氨基酸殘基暴露在溶液界面,其余30.87%氨基酸殘基包埋在蛋白質(zhì)內(nèi)部。Htm預(yù)測(cè)該蛋白無跨膜區(qū)(圖 3)。6 CsCaM的三維結(jié)構(gòu)[9]
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]華支睪吸蟲感染與膽管癌發(fā)病關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 馮銘彬,劉超. 中華肝臟外科手術(shù)學(xué)電子雜志. 2017(06)
[2]華支睪吸蟲生活史在實(shí)驗(yàn)室的建立[J]. 梁熾,胡旭初,呂志躍,吳忠道,余新炳,徐勁,鄭煥欽. 中國(guó)寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2009(02)
[3]血吸蟲鈣調(diào)蛋白與吡喹酮?dú)⑾x作用機(jī)理[J]. 潘星清,郭菁. 中國(guó)寄生蟲病防治雜志. 1990(01)
本文編號(hào):3250860
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