目的圓環(huán)病毒2型（porcine circovirus type 2,PCV2）能否感染人類細(xì)胞一直都是一個爭論的話題。本研究通過轉(zhuǎn)錄組測序（RNA sequencing,RNA-seq）技術(shù)分析PCV2感染人源細(xì)胞后的差異表達(dá)基因及其相關(guān)的信號通路、生物學(xué)功能,以期為人源細(xì)胞對PCV2及其他病毒產(chǎn)生抗病毒效應(yīng)的研究提供參考。方法用PCV2感染He La細(xì)胞,然后進(jìn)行RNA-seq技術(shù)分析,篩選與抗病毒反應(yīng)相關(guān)的差異表達(dá)基因（differentially expressed genes,DEGs）,并通過實(shí)時定量PCR進(jìn)一步驗(yàn)證。結(jié)果在感染PCV2的He La細(xì)胞中共注釋到15402個Uni Genes,其中有387個DEGs（包括267個上調(diào)基因和120個下調(diào)基因）。對生物過程類DEGs進(jìn)行GO富集和KEGG通路分析,發(fā)現(xiàn)富集基因要參與應(yīng)激反應(yīng)（97/291 DEGs）和免疫系統(tǒng)過程（80/291 DEGs）,其中最顯著兩條途徑的基因是NOD樣受體信號途徑（21/170 DEGs）和單純皰疹病毒感染途徑（22/170 DEGs）相關(guān)差異表達(dá)基因。結(jié)論 PCV2感染He La細(xì)胞之后,... 

【文章來源】：中國比較醫(yī)學(xué)雜志. 2020,30(06)北大核心

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

PCV2感染與未感染細(xì)胞基因差異表達(dá)分析

圖1 PCV2感染與未感染細(xì)胞基因差異表達(dá)分析此外，利用STRING網(wǎng)站分析了與病毒應(yīng)答相關(guān)的DEGs潛在的相互作用網(wǎng)絡(luò)。如圖3B所示，24個DEGs在PCV2感染后下調(diào)，包括IRF9、IFI44L、DDX58、GBP1、GBP3、IFIT2、IFIT1、IFIT3、IL6、IRF1、IRF7、LGALS9、MX1、MX2、OAS1、OAS2、PLSCR1、DDX60、CCL5、IFIH1(MDA5)、DHX58(LGP2)、ZC3H12 A(MCPIP)、RSAD2和ISG15(圖3B)。

此外，利用STRING網(wǎng)站分析了與病毒應(yīng)答相關(guān)的DEGs潛在的相互作用網(wǎng)絡(luò)。如圖3B所示，24個DEGs在PCV2感染后下調(diào)，包括IRF9、IFI44L、DDX58、GBP1、GBP3、IFIT2、IFIT1、IFIT3、IL6、IRF1、IRF7、LGALS9、MX1、MX2、OAS1、OAS2、PLSCR1、DDX60、CCL5、IFIH1(MDA5)、DHX58(LGP2)、ZC3H12 A(MCPIP)、RSAD2和ISG15(圖3B)。2.4 實(shí)時q PCR對DEGs的確認(rèn)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]PCV2對人源細(xì)胞系感染的研究及轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 劉曉慧.吉林大學(xué) 2019



本文編號：3238973