目的探索獲得性免疫缺陷綜合征（AIDS）患者易感抑郁癥的關(guān)鍵差異表達基因,為進一步研究尋找靶點。方法通過GEO數(shù)據(jù)庫下載AIDS合并抑郁癥患者和AIDS患者額葉皮層灰質(zhì)細胞的基因芯片數(shù)據(jù)集GSE17440,利用R語言挖掘差異表達基因,通過STRING、metascape等工具進行生物信息學分析。結(jié)果挖掘出差異表達基因71個,其中上調(diào)基因16個,下調(diào)基因55個。經(jīng)過不同的富集工具富集,差異表達基因主要集中于細胞凋亡通路。構(gòu)建蛋白與蛋白互相作用的網(wǎng)絡(luò)圖顯示,差異表達基因的表達產(chǎn)物大部分存在密切的相互作用,AIDS合并抑郁癥患者腦部組織免疫防御反應(yīng)異常激活。結(jié)論通過對AIDS合并抑郁癥患者和AIDS患者差異表達基因的分析,對其差異基因有了系統(tǒng)的認識,針對關(guān)鍵基因的大樣本研究及網(wǎng)絡(luò)化基因分析是未來的研究方向。 

【文章來源】：重慶醫(yī)學. 2020,49(13)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

AIDS合并抑郁癥患者及AIDS患者的差異基因聚類熱圖

通過在線軟件metascape(http：//metascape.org/）對AIDS合并抑郁癥患者及AIDS患者的差異基因進行富集，其富集結(jié)果見表3，其富集分類熱圖見圖2。圖3 AIDS合并抑郁癥患者及AIDS患者的差異基因表達產(chǎn)物的相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

AIDS合并抑郁癥患者及AIDS患者的差異基因表達產(chǎn)物的相互作用網(wǎng)絡(luò)圖

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號：3234793