目的了解金山區(qū)2015—2019監(jiān)測(cè)年度流行性感冒（流感）的病原學(xué)特征,為流感防控提供科學(xué)依據(jù)。方法收集金山區(qū)2015—2019監(jiān)測(cè)年度流感樣病例的鼻咽拭子標(biāo)本,通過(guò)Real-time RT-PCR鑒定流感病毒亞型,核酸陽(yáng)性標(biāo)本用馬丁達(dá)比犬腎（Madin-Darby canine kidney, MDCK）細(xì)胞和（或）無(wú)特定病原體（specific pathogen free, SPF）雞胚分離培養(yǎng),對(duì)甲型流感進(jìn)行HA基因分析。結(jié)果 2015—2019監(jiān)測(cè)年度共采集流感樣病例鼻咽拭標(biāo)本4 263份,流感病毒核酸檢測(cè)總陽(yáng)性率為23.95%（1 021/4 263）。其中甲型流感病毒檢出陽(yáng)性數(shù)占檢測(cè)總陽(yáng)性數(shù)的80.99%,主要為甲型H3N2和甲型H1N1。流感病毒檢出陽(yáng)性率及分型情況呈季節(jié)分布,各年齡組核酸檢測(cè)陽(yáng)性率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（χ²=83.783,P<0.05）,其中60歲以上組陽(yáng)性率最高30.77%,0～歲組陽(yáng)性率最低12.10%,不同性別間流感病毒核酸檢測(cè)陽(yáng)性率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（χ²=3.740,P>0.05）�；蜻M(jìn)化分析... 

【文章來(lái)源】：實(shí)用預(yù)防醫(yī)學(xué). 2020,27(11)

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2015—2019年金山區(qū)流感病毒亞型總體分布特征

甲型H1N1流感病毒疫苗參考株A/Michigan/45/2015 (H1N1)pdm09 (GenBank:MK622940)的HA基因編碼區(qū)核苷酸長(zhǎng)度為1 753 bp,選取的20株甲型H1N1流感毒株HA基因序列經(jīng)測(cè)定均為996 bp,對(duì)應(yīng)參考序列為137～1 132 bp,將20株甲型H1N1流感病毒毒株HA基因序列與當(dāng)年的疫苗株及其它代表株進(jìn)行遺傳進(jìn)化樹(shù)分析。結(jié)果表明,人群與野禽、豬流行的甲型H1N1流感毒株HA基因不在一個(gè)分支上,進(jìn)化樹(shù)共分為Homo sapiens和Out Group兩個(gè)群組,2009年以后上海及周邊地區(qū)流行的甲型H1N1流感代表株HA基因和1996—1997年上海地區(qū)代表株不在同一分支上,20株甲型H1N1流感病毒毒株HA基因與流感病毒疫苗參考株基因親緣較近,而與2009—2013年上海及周邊地區(qū)流行的甲型H1N1流感毒株HA基因不在同一分支上,見(jiàn)圖2。2.2.2 甲型H3N2流感病毒HA基因進(jìn)化樹(shù)分析

甲型H3N2流感病毒疫苗參考株A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016(H3N2)(GISAID)的HA基因編碼區(qū)核苷酸長(zhǎng)度為1 737 bp,選取的7株甲型H3N2流感毒株HA基因序列經(jīng)測(cè)定均為1 055 bp,對(duì)應(yīng)參考序列為18～1 072 bp,將7株甲型H3N2流感病毒毒株HA基因序列與當(dāng)年的疫苗株及其它代表株進(jìn)行遺傳進(jìn)化樹(shù)分析。結(jié)果表明,人群與2019年上海犬類(lèi)流行的甲型H3N2流感毒株HA基因不在一個(gè)分支上,進(jìn)化樹(shù)共分為Homo sapiens和Out Group兩個(gè)群組,2012年以后中國(guó)流行的甲型H3N2流感代表株HA基因和2010年杭州地區(qū)代表株不在同一分支上;7株甲型H3N2流感病毒毒株HA基因與流感病毒疫苗參考株基因親緣較近,而與2012—2014年中國(guó)流行的H3N2流感病毒毒株HA基因不在同一分支上,見(jiàn)圖3。3 討 論

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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