2015-2018年廣州地區(qū)急性腹瀉患者糞便中病毒的檢測及其分子流行病學特征
發(fā)布時間:2021-05-23 04:34
1.研究目的感染性腹瀉(簡稱腹瀉)是重要的公共衛(wèi)生問題,病毒是引起腹瀉病的主要原因,了解引起腹瀉的病毒種類,認識其流行病學特征,對預(yù)防控制腹瀉病有重要的科學意義。2.研究方法2.1研究對象、資料及標本采集以廣州某綜合三甲醫(yī)院為監(jiān)測點,收集2015年1月至2018年1月急性腹瀉患者及非腹瀉對照的糞便標本,同時收集人口學和臨床表現(xiàn)資料。2.2腸道病毒檢測檢測的病毒的種類包括人類輪狀病毒(Human Rotavirus,HRV)、人類杯狀病毒(Human Calicivirus,HuCV)、人類星狀病毒(Human astrovirus,AstV)、人類博卡病毒(Human bocavirus,HBoV)、人類腺病毒(Human adenoviruses,AdV),尚存在爭議的腹瀉病毒包括人雙?刹《荆℉uman parechovirus,HPeV)、愛知病毒(Aichi virus,AiV)、Klassevirus/Salivirus(SaIV)等。2.3宏病毒組學研究用Illumina HiSeq進行高通量測序,經(jīng)過質(zhì)控和宿主序列過濾后,與MicroNR、MicroNT數(shù)據(jù)庫進行比對,獲...
【文章來源】:南方醫(yī)科大學廣東省
【文章頁數(shù)】:179 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
前言
第一章 2015-2018年廣州地區(qū)腹瀉患者常見腸道病毒的檢測
前言
1. 實驗材料和方法
1.1 研究對象
1.2 實驗材料
1.3 實驗步驟與方法
1.4 統(tǒng)計學分析
2. 結(jié)果
2.1 研究對象的基本情況
2.2 HRV檢測結(jié)果及其流行特點
2.3 NOV檢測結(jié)果及其流行特點
2.4 SaV檢測結(jié)果及其流行特點
2.5 AstV檢測結(jié)果及其流行特點
2.6 HPeV檢測結(jié)果及其流行特點
2.7 HBoV檢測結(jié)果及其流行特點
2.8 AdV檢測結(jié)果及其流行特點
2.9 AiV和SaIV檢測結(jié)果及其流行特點
2.10 臨床特點
3. 討論
4. 本章小結(jié)
第二章 腹瀉患者糞便的宏病毒組研究
前言
1. 實驗材料和方法
1.1 研究對象
1.2 實驗材料
1.3 實驗步驟與方法
2. 結(jié)果
2.1 研究對象的基本特征
2.2 宏病毒組學測序結(jié)果概況
2.3 物種分類學注釋
2.4 物種與功能組成分析
2.5 樣本比較分析
2.6 Circos樣本與物種的共線性關(guān)系圖
2.7 Ternary三元相圖
3. 討論
4. 本章小結(jié)
第三章 腹瀉患者糞便的腸道細菌群落分析
前言
1. 實驗材料和方法
1.1 研究對象
1.2 實驗材料
1.3 實驗步驟與方法
2. 結(jié)果
2.1 研究對象的基本特征
2.2 腸道病毒的檢出情況
2.3 微生物群落特征
3. 討論
4. 本章小結(jié)
第四章 全文總結(jié)、主要創(chuàng)新點和不足
1. 全文總結(jié)
2. 主要創(chuàng)新點
3. 研究中存在的不足
4. 下一步研究計劃
參考文獻
附錄 縮略語詞匯表
攻讀博士學位期間發(fā)表及參與發(fā)表的論文
致謝
本文編號:3202293
【文章來源】:南方醫(yī)科大學廣東省
【文章頁數(shù)】:179 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
前言
第一章 2015-2018年廣州地區(qū)腹瀉患者常見腸道病毒的檢測
前言
1. 實驗材料和方法
1.1 研究對象
1.2 實驗材料
1.3 實驗步驟與方法
1.4 統(tǒng)計學分析
2. 結(jié)果
2.1 研究對象的基本情況
2.2 HRV檢測結(jié)果及其流行特點
2.3 NOV檢測結(jié)果及其流行特點
2.4 SaV檢測結(jié)果及其流行特點
2.5 AstV檢測結(jié)果及其流行特點
2.6 HPeV檢測結(jié)果及其流行特點
2.7 HBoV檢測結(jié)果及其流行特點
2.8 AdV檢測結(jié)果及其流行特點
2.9 AiV和SaIV檢測結(jié)果及其流行特點
2.10 臨床特點
3. 討論
4. 本章小結(jié)
第二章 腹瀉患者糞便的宏病毒組研究
前言
1. 實驗材料和方法
1.1 研究對象
1.2 實驗材料
1.3 實驗步驟與方法
2. 結(jié)果
2.1 研究對象的基本特征
2.2 宏病毒組學測序結(jié)果概況
2.3 物種分類學注釋
2.4 物種與功能組成分析
2.5 樣本比較分析
2.6 Circos樣本與物種的共線性關(guān)系圖
2.7 Ternary三元相圖
3. 討論
4. 本章小結(jié)
第三章 腹瀉患者糞便的腸道細菌群落分析
前言
1. 實驗材料和方法
1.1 研究對象
1.2 實驗材料
1.3 實驗步驟與方法
2. 結(jié)果
2.1 研究對象的基本特征
2.2 腸道病毒的檢出情況
2.3 微生物群落特征
3. 討論
4. 本章小結(jié)
第四章 全文總結(jié)、主要創(chuàng)新點和不足
1. 全文總結(jié)
2. 主要創(chuàng)新點
3. 研究中存在的不足
4. 下一步研究計劃
參考文獻
附錄 縮略語詞匯表
攻讀博士學位期間發(fā)表及參與發(fā)表的論文
致謝
本文編號:3202293
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