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基于全基因組測序的結核病傳播及耐藥特征分析

發(fā)布時間:2021-05-20 01:16
  第一部分基于全基因組測序的西藏結核病傳播特征分析目的利用全基因組測序技術分析西藏地區(qū)結核病近期傳播及其相關影響因素和跨區(qū)傳播情況,為當?shù)叵嚓P部門制定防治管理措施提供參考依據(jù)。方法收集西藏2006、2009和2010年的結核分枝桿菌菌株576株,通過流行病學調查獲取每株菌株的社會人口學信息、臨床特征等信息。利用全基因組測序技術回顧性分析西藏的結核病的傳播情況,并分析影響西藏結核病傳播的相關因素、跨區(qū)傳播的情況。結果(1)以5個和12個SNP為界,在540株MTB中分別鑒定到196株(36.3%)和308株(57.0%)成簇菌株。(2)單因素分析結果顯示2010年、痰涂片(+)、北京基因型、RR/MDR均為成簇的影響因子(P值均<0.05);多因素分析結果提示無論以SNP≤5還是SNP≤12定義成簇時,2010年(OR5=2.72,95%CI:1.70-4.48;OR12=1.88,95%CI:1.22-2.97)、北京基因型(ORSNP≤5=3.77,95%CI:1.72-9.49;OR SNP≤12=4.91,95%CI:2.48-10.47)、RR/MDR(OR SNP≤5=2... 

【文章來源】:南華大學湖南省

【文章頁數(shù)】:95 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞
第一部分 基于全基因組測序的西藏結核病傳播特征分析
    1.1 前言
    1.2 對象和方法
    1.3 結果
        1.3.1 西藏結核分枝桿菌菌株的基本信息
        1.3.2 西藏成簇菌株影響因素分析
        1.3.3 西藏結核病跨區(qū)傳播情況
        1.3.4 西藏結核病傳播簇大小與初復治的相關性
    1.4 討論
    1.5 小結
第二部分 基于全基因組測序的中國耐多藥結核分枝桿菌耐藥突變特征分析
    2.1 前言
    2.2 對象和方法
    2.3 結果
        2.3.1 結核分枝桿菌中MDR菌株分布情況
        2.3.2 MDR菌株耐藥特點
        2.3.3 GenoType MTBDRplus和 MTBDRsI檢測效果評價
        2.3.4 遺傳背景與耐藥突變的相關性分析
    2.4 討論
    2.5 小結
結論
參考文獻
綜述
    參考文獻
攻讀碩士學位期間發(fā)表的科研成果
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
[1]熒光PCR探針熔解曲線技術檢測結核分枝桿菌對五種抗結核藥物耐藥性的研究[J]. 曹志華,趙悅竹,胡雙雙.  中國防癆雜志. 2019 (02)
[2]2010年西藏自治區(qū)結核病監(jiān)測資料分析[J]. 平措卓瑪.  疾病監(jiān)測. 2013(04)
[3]2010年全國第五次結核病流行病學抽樣調查報告[J]. 王黎霞,成詩明,陳明亭,趙雁林,張慧,姜世聞,何廣學,呂青,杜昕,陳偉,劉小秋,阮云洲,王勝芬,夏愔愔,于蘭,李峻,李雪.  中國防癆雜志. 2012(08)
[4]西藏自治區(qū)復治涂陽肺結核病人發(fā)生原因分析[J]. 國杰.  中國防癆雜志. 2008(06)
[5]MLVA和Spoligotyping用于西藏地區(qū)216株結核分枝桿菌臨床分離株的基因分型研究[J]. 石荔,楊敏,Christine Pourcel,董海燕,尼瑪彭多,張嬡媛,朗珍,呂冰,蔣毅,魏淑貞,范昕建,萬康林.  中華微生物學和免疫學雜志. 2007(08)



本文編號:3196795

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