人冠狀病毒（Human coronavirus,HCoV）是導致人呼吸道感染的重要病原之一。為了從分子水平上探討嚴重急性呼吸道感染（Severe acute respiratory infection,SARI）病例中HCoV-OC43的基因特征,本研究應用實時熒光定量（Real-time）PCR方法對2019年河南省374份SARI病例樣本進行HCoV-OC43核酸篩查,并對核酸檢測陽性樣本進行棘突蛋白（Spike,S）、RNA依賴的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase,RdRp）和核衣殼蛋白（Nucleocapsid,N）三個靶基因擴增和序列測定。結(jié)合從GenBank數(shù)據(jù)庫篩選的國內(nèi)外42條代表序列和本研究所獲得的S、RdRp和N三個靶基因全長序列構(gòu)建基因親緣性關(guān)系樹,對本研究所獲得的HCoV-OC43樣本進行基因型別鑒定和基因特征分析,并對HCoV-OC43重要抗原S蛋白進行氨基酸位點變異分析。結(jié)果顯示:在374份SARI病例樣本中共檢測出15份HCoV-OC43核酸陽性樣本（15/374,4.01%）,并在4份臨床樣本中獲得S、RdRp和N基因... 

【文章來源】：病毒學報. 2020,36(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
材料與方法
    1樣本來源
    2實時熒光定量PCR檢測
    3 S、Rd Rp和N三個靶基因的擴增及序列測定
    4序列拼接與進化分析
    5氨基酸位點變異分析
結(jié)果
    1 HCoV-OC43樣本S、RdRp和N靶基因擴增
    2 HCoV-OC43基因進化分析
    3 S蛋白氨基酸位點變異分析
討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]2013-2015年人冠狀病毒OC43基因型分布特點的研究[J]. 賈寶遷,肖艷,王營,任麗麗,王健偉.  中華實驗和臨床病毒學雜志. 2016 (02)
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[3]2008-2013年武漢市某醫(yī)院就診兒童人冠狀病毒感染情況[J]. 孔雯驊,王英,朱洪浩,林新明,余濱,胡權(quán),郭德銀,彭勁松.  中華預防醫(yī)學雜志. 2015 (05)
[4]人冠狀病毒OC43在北京成人呼吸道感染患者中感染的初步分析[J]. 胡琴,陸柔劍,彭堃,王文,趙彥杰,樓永良,譚文杰.  中華實驗和臨床病毒學雜志. 2014 (02)
[5]人冠狀病毒HCoV-OC43的研究進展[J]. 胡琴,譚文杰.  中華預防醫(yī)學雜志. 2013 (07)

碩士論文
[1]人冠狀病毒OC43分子流行病學與種系進化動力學特征研究[D]. 張越.北京協(xié)和醫(yī)學院 2014



本文編號：3190645