目的:應用i TRAQ標記聯(lián)合LC-MS/MS技術篩查AE患者血清中的差異表達蛋白,初步篩選AE血清早期診斷的特異性標志物。方法:1.收集2016年1月-2016年5月期間在青海大學附屬醫(yī)院肝膽胰外科住院經(jīng)彩超、CT、MRI或手術后病理確診的HAE患者血清3例及伴隨肝外轉(zhuǎn)移AE患者血清3例,同時收集健康體檢者血清2例作為對照。2.將收集的血清8例經(jīng)去血清高豐度蛋白、電泳及酶解后采用iTRAQ 8-plex標記技術進行標記（其中健康體檢者A組標記“113、114”,HAE患者B組標記“115、116、117”,伴隨肝外轉(zhuǎn)移AE患者C組標記“118、119、121”）。3.使用高分辨質(zhì)譜儀Q Exactive（Thermo Scientific）行質(zhì)譜分析,用軟件Mascot2.5和Proteome Discoverer2.1蛋白質(zhì)鑒定軟件對UniProt蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進行搜索,以報告基團“113、114”的相對含量作為參照對象,選擇差異具有顯著的的結(jié)果（p<0.05）,高于1.2或低于0.83的倍數(shù)變化被認為顯著上調(diào)或下調(diào),并應用GO分類、KEGG通路等數(shù)據(jù)庫平臺對差異表達蛋白進行生... 

【文章來源】：青海大學青海省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：43 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
主要符號對照表
第1章 引言
第2章 材料與方法
    2.1 研究對象及分組
        2.1.1 研究對象
        2.1.2 分組
    2.2 試劑與儀器
        2.2.1 實驗儀器和分析軟件
            2.2.1.1 主要實驗儀器
            2.2.1.2 分析軟件
        2.2.2 試劑和耗材
    2.3 實驗方法
        2.3.1 血液標本的采集與保存
        2.3.2 去除血清高豐度蛋白及SDS-PAGE電泳
        2.3.3 FASP酶解
        2.3.4 iTRAQ標記
        2.3.5 HighPHRP分級
        2.3.6 質(zhì)譜分析
        2.3.7 數(shù)據(jù)庫檢索及生物信息學分析
    2.4 統(tǒng)計學方法
    2.5 技術路線
第3章 結(jié)果
    3.1 研究對象的一般資料
    3.2 研究結(jié)果
        3.2.1 外周血清蛋白鑒定和定量結(jié)果評估
        3.2.2 蛋白質(zhì)定性結(jié)果展示
        3.2.3 蛋白質(zhì)定量結(jié)果展示
        3.2.4 外周血差異蛋白鑒定結(jié)果
        3.2.5 生物信息分析—GO功能注釋及GO功能富集分析
        3.2.6 生物信息分析—KEGG通路注釋及KEGG通路富集分析
        3.2.7 生物信息分析—蛋白質(zhì)聚類分析
        3.2.8 差異蛋白篩選結(jié)果
第4章 討論
第5章 結(jié)論
參考文獻
致謝
附錄A 綜述
    參考文獻
作者簡介


【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]泛素結(jié)合酶UBE2T在鼻咽癌發(fā)生發(fā)展中的作用及其機制探討[D]. 胡威.南方醫(yī)科大學 2016



本文編號：3182276