基于iTRAQ的蛋白組學(xué)技術(shù)篩查泡球蚴病患者血清特異性標(biāo)志物的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2021-05-11 23:09
目的:應(yīng)用i TRAQ標(biāo)記聯(lián)合LC-MS/MS技術(shù)篩查AE患者血清中的差異表達(dá)蛋白,初步篩選AE血清早期診斷的特異性標(biāo)志物。方法:1.收集2016年1月-2016年5月期間在青海大學(xué)附屬醫(yī)院肝膽胰外科住院經(jīng)彩超、CT、MRI或手術(shù)后病理確診的HAE患者血清3例及伴隨肝外轉(zhuǎn)移AE患者血清3例,同時(shí)收集健康體檢者血清2例作為對(duì)照。2.將收集的血清8例經(jīng)去血清高豐度蛋白、電泳及酶解后采用iTRAQ 8-plex標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行標(biāo)記(其中健康體檢者A組標(biāo)記“113、114”,HAE患者B組標(biāo)記“115、116、117”,伴隨肝外轉(zhuǎn)移AE患者C組標(biāo)記“118、119、121”)。3.使用高分辨質(zhì)譜儀Q Exactive(Thermo Scientific)行質(zhì)譜分析,用軟件Mascot2.5和Proteome Discoverer2.1蛋白質(zhì)鑒定軟件對(duì)UniProt蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行搜索,以報(bào)告基團(tuán)“113、114”的相對(duì)含量作為參照對(duì)象,選擇差異具有顯著的的結(jié)果(p<0.05),高于1.2或低于0.83的倍數(shù)變化被認(rèn)為顯著上調(diào)或下調(diào),并應(yīng)用GO分類(lèi)、KEGG通路等數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)對(duì)差異表達(dá)蛋白進(jìn)行生...
【文章來(lái)源】:青海大學(xué)青海省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:43 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
主要符號(hào)對(duì)照表
第1章 引言
第2章 材料與方法
2.1 研究對(duì)象及分組
2.1.1 研究對(duì)象
2.1.2 分組
2.2 試劑與儀器
2.2.1 實(shí)驗(yàn)儀器和分析軟件
2.2.1.1 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.2.1.2 分析軟件
2.2.2 試劑和耗材
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 血液標(biāo)本的采集與保存
2.3.2 去除血清高豐度蛋白及SDS-PAGE電泳
2.3.3 FASP酶解
2.3.4 iTRAQ標(biāo)記
2.3.5 HighPHRP分級(jí)
2.3.6 質(zhì)譜分析
2.3.7 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索及生物信息學(xué)分析
2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2.5 技術(shù)路線
第3章 結(jié)果
3.1 研究對(duì)象的一般資料
3.2 研究結(jié)果
3.2.1 外周血清蛋白鑒定和定量結(jié)果評(píng)估
3.2.2 蛋白質(zhì)定性結(jié)果展示
3.2.3 蛋白質(zhì)定量結(jié)果展示
3.2.4 外周血差異蛋白鑒定結(jié)果
3.2.5 生物信息分析—GO功能注釋及GO功能富集分析
3.2.6 生物信息分析—KEGG通路注釋及KEGG通路富集分析
3.2.7 生物信息分析—蛋白質(zhì)聚類(lèi)分析
3.2.8 差異蛋白篩選結(jié)果
第4章 討論
第5章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄A 綜述
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]超聲引導(dǎo)經(jīng)皮肝穿刺微波消融肝泡型包蟲(chóng)的初步臨床研究[J]. 郭建琴,華國(guó)勇,張曉敏,冶鳳英,祁莉娜,楊蓉. 中華超聲影像學(xué)雜志. 2017 (10)
[2]應(yīng)用iTRAQ技術(shù)對(duì)尤文肉瘤的蛋白組學(xué)研究[J]. 王翀,田征,宋興華,曹力,艾克拜爾·尤努斯,徐磊磊. 新疆醫(yī)學(xué). 2017(04)
[3]青海省包蟲(chóng)病源頭防治工作匯報(bào)[J]. 蔡金山. 中國(guó)動(dòng)物保健. 2016(09)
[4]泡型肝包蟲(chóng)病的臨床治療進(jìn)展[J]. 路越晴,鄧勇,張靈強(qiáng),周瀛,任利,陽(yáng)丹才讓,候立朝,溫浩,王海久,樊海寧. 中國(guó)普外基礎(chǔ)與臨床雜志. 2016(05)
[5]MR彌散加權(quán)成像對(duì)泡型肝包蟲(chóng)病的評(píng)估價(jià)值研究[J]. 尹桂秀,鮑海華,趙希鵬,樊海寧,李偉霞. 中國(guó)普外基礎(chǔ)與臨床雜志. 2016(05)
[6]肝包蟲(chóng)病的診斷現(xiàn)狀及進(jìn)展[J]. 黃士波,米圓圓,劉愛(ài)琴,趙憲琪,張鐵民. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2016(04)
[7]肝包蟲(chóng)病的治療方法選擇[J]. 陳哲宇. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2015(18)
[8]肝包蟲(chóng)病的治療[J]. 陳哲宇. 中國(guó)普外基礎(chǔ)與臨床雜志. 2015(02)
[9]肝包蟲(chóng)病外科治療的單中心經(jīng)驗(yàn)[J]. 張瀚之,陳哲宇,嚴(yán)律南,曾勇,李波,文天夫,王文濤,吳泓,楊家印,黃紀(jì)偉,李嘉鑫,王靜塵. 中國(guó)普外基礎(chǔ)與臨床雜志. 2015(02)
[10]半離體或離體肝切除聯(lián)合自體肝移植適應(yīng)證探討(附36例報(bào)告)[J]. 葉啟發(fā),李弦,范曉禮,王彥峰,李玲,范林,鐘自彪. 中國(guó)實(shí)用外科雜志. 2014(08)
博士論文
[1]泛素結(jié)合酶UBE2T在鼻咽癌發(fā)生發(fā)展中的作用及其機(jī)制探討[D]. 胡威.南方醫(yī)科大學(xué) 2016
本文編號(hào):3182276
【文章來(lái)源】:青海大學(xué)青海省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:43 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
主要符號(hào)對(duì)照表
第1章 引言
第2章 材料與方法
2.1 研究對(duì)象及分組
2.1.1 研究對(duì)象
2.1.2 分組
2.2 試劑與儀器
2.2.1 實(shí)驗(yàn)儀器和分析軟件
2.2.1.1 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.2.1.2 分析軟件
2.2.2 試劑和耗材
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 血液標(biāo)本的采集與保存
2.3.2 去除血清高豐度蛋白及SDS-PAGE電泳
2.3.3 FASP酶解
2.3.4 iTRAQ標(biāo)記
2.3.5 HighPHRP分級(jí)
2.3.6 質(zhì)譜分析
2.3.7 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索及生物信息學(xué)分析
2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2.5 技術(shù)路線
第3章 結(jié)果
3.1 研究對(duì)象的一般資料
3.2 研究結(jié)果
3.2.1 外周血清蛋白鑒定和定量結(jié)果評(píng)估
3.2.2 蛋白質(zhì)定性結(jié)果展示
3.2.3 蛋白質(zhì)定量結(jié)果展示
3.2.4 外周血差異蛋白鑒定結(jié)果
3.2.5 生物信息分析—GO功能注釋及GO功能富集分析
3.2.6 生物信息分析—KEGG通路注釋及KEGG通路富集分析
3.2.7 生物信息分析—蛋白質(zhì)聚類(lèi)分析
3.2.8 差異蛋白篩選結(jié)果
第4章 討論
第5章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄A 綜述
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]超聲引導(dǎo)經(jīng)皮肝穿刺微波消融肝泡型包蟲(chóng)的初步臨床研究[J]. 郭建琴,華國(guó)勇,張曉敏,冶鳳英,祁莉娜,楊蓉. 中華超聲影像學(xué)雜志. 2017 (10)
[2]應(yīng)用iTRAQ技術(shù)對(duì)尤文肉瘤的蛋白組學(xué)研究[J]. 王翀,田征,宋興華,曹力,艾克拜爾·尤努斯,徐磊磊. 新疆醫(yī)學(xué). 2017(04)
[3]青海省包蟲(chóng)病源頭防治工作匯報(bào)[J]. 蔡金山. 中國(guó)動(dòng)物保健. 2016(09)
[4]泡型肝包蟲(chóng)病的臨床治療進(jìn)展[J]. 路越晴,鄧勇,張靈強(qiáng),周瀛,任利,陽(yáng)丹才讓,候立朝,溫浩,王海久,樊海寧. 中國(guó)普外基礎(chǔ)與臨床雜志. 2016(05)
[5]MR彌散加權(quán)成像對(duì)泡型肝包蟲(chóng)病的評(píng)估價(jià)值研究[J]. 尹桂秀,鮑海華,趙希鵬,樊海寧,李偉霞. 中國(guó)普外基礎(chǔ)與臨床雜志. 2016(05)
[6]肝包蟲(chóng)病的診斷現(xiàn)狀及進(jìn)展[J]. 黃士波,米圓圓,劉愛(ài)琴,趙憲琪,張鐵民. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2016(04)
[7]肝包蟲(chóng)病的治療方法選擇[J]. 陳哲宇. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2015(18)
[8]肝包蟲(chóng)病的治療[J]. 陳哲宇. 中國(guó)普外基礎(chǔ)與臨床雜志. 2015(02)
[9]肝包蟲(chóng)病外科治療的單中心經(jīng)驗(yàn)[J]. 張瀚之,陳哲宇,嚴(yán)律南,曾勇,李波,文天夫,王文濤,吳泓,楊家印,黃紀(jì)偉,李嘉鑫,王靜塵. 中國(guó)普外基礎(chǔ)與臨床雜志. 2015(02)
[10]半離體或離體肝切除聯(lián)合自體肝移植適應(yīng)證探討(附36例報(bào)告)[J]. 葉啟發(fā),李弦,范曉禮,王彥峰,李玲,范林,鐘自彪. 中國(guó)實(shí)用外科雜志. 2014(08)
博士論文
[1]泛素結(jié)合酶UBE2T在鼻咽癌發(fā)生發(fā)展中的作用及其機(jī)制探討[D]. 胡威.南方醫(yī)科大學(xué) 2016
本文編號(hào):3182276
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