深圳市耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥基因突變特征分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-10 08:53
目的利用全基因組序列分析方法研究深圳市耐多藥結(jié)核分枝桿菌(MDR-MTB)的耐藥基因突變類(lèi)型特點(diǎn),為耐藥結(jié)核病的快速分子檢測(cè)提供依據(jù)。方法對(duì)2013—2017年深圳市慢性病防治中心及各區(qū)慢性病防治院門(mén)診收集的所有449株MDR-MTB臨床分離株進(jìn)行全基因組測(cè)序,經(jīng)與結(jié)核分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)菌株(H37Rv)基因組模板序列比對(duì)后獲得447株滿足分析要求的全基因組測(cè)序菌株。每株菌株經(jīng)單核苷酸多態(tài)性(SNP)鑒定后與H37Rv各基因型和亞型的特異性突變和對(duì)11種抗結(jié)核藥品已知的耐藥基因突變進(jìn)行比對(duì),獲得各菌株獨(dú)屬的基因型或亞型和耐藥基因突變,并分析不同藥品耐藥基因中的主要耐藥突變類(lèi)型不同基因型或亞型間的相關(guān)性。結(jié)果 447株MDR-MTB中全基因組測(cè)序結(jié)果顯示,432株(96.6%)發(fā)生基因突變,MTB對(duì)11種藥品主要的耐藥突變類(lèi)型分別為katG-315-S/T[INH,81.7%(353/432)]、rpoB-450-S/L[RFP,59.7%(258/432)]、rpsL-43-K/R[Sm,66.0%(198/300)]、embB-306-M/V[EMB,35.5%(94/265)]、pncA...
【文章來(lái)源】:中國(guó)防癆雜志. 2020,42(06)CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]重慶地區(qū)耐多藥結(jié)核分枝桿菌對(duì)氟喹諾酮類(lèi)藥物耐藥的相關(guān)基因特征分析[J]. 胡彥,劉潔,沈靜,朱大冕,馮鑫,陳林,詹建,歐喜超,周楊,趙雁林. 中國(guó)防癆雜志. 2018 (10)
[2]寧波地區(qū)耐多藥結(jié)核分枝桿菌乙胺丁醇耐藥embB基因突變研究[J]. 車(chē)洋,楊天池,平國(guó)華,林律. 中國(guó)預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2018(07)
[3]廣西欽州地區(qū)結(jié)核分枝桿菌相關(guān)耐藥基因變異特征分析[J]. 李崇建,鮑金圭,陳焯彬,李仕娟,吳海松,梁玲. 國(guó)際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2018(08)
[4]重慶地區(qū)耐多藥結(jié)核分枝桿菌吡嗪酰胺耐藥基因突變的特征分析[J]. 朱大冕,胡代玉,劉潔,逄宇,羅明,沈靜,陳林. 中國(guó)防癆雜志. 2018 (02)
本文編號(hào):3179078
【文章來(lái)源】:中國(guó)防癆雜志. 2020,42(06)CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]重慶地區(qū)耐多藥結(jié)核分枝桿菌對(duì)氟喹諾酮類(lèi)藥物耐藥的相關(guān)基因特征分析[J]. 胡彥,劉潔,沈靜,朱大冕,馮鑫,陳林,詹建,歐喜超,周楊,趙雁林. 中國(guó)防癆雜志. 2018 (10)
[2]寧波地區(qū)耐多藥結(jié)核分枝桿菌乙胺丁醇耐藥embB基因突變研究[J]. 車(chē)洋,楊天池,平國(guó)華,林律. 中國(guó)預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2018(07)
[3]廣西欽州地區(qū)結(jié)核分枝桿菌相關(guān)耐藥基因變異特征分析[J]. 李崇建,鮑金圭,陳焯彬,李仕娟,吳海松,梁玲. 國(guó)際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2018(08)
[4]重慶地區(qū)耐多藥結(jié)核分枝桿菌吡嗪酰胺耐藥基因突變的特征分析[J]. 朱大冕,胡代玉,劉潔,逄宇,羅明,沈靜,陳林. 中國(guó)防癆雜志. 2018 (02)
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