安徽省GII.P16-GII.2諾如病毒暴發(fā)疫情的基因特征分析
發(fā)布時間:2021-03-15 13:00
目的了解2018年安徽省一起感染性胃腸炎暴發(fā)疫情的病原學(xué)特征。方法收集2018年10月一起急性胃腸炎病例糞便/肛拭子12份標(biāo)本,采用Real-time PCR檢測諾如病毒GII基因組,陽性標(biāo)本經(jīng)RT-PCR擴(kuò)增聚合酶區(qū)和衣殼蛋白區(qū)部分基因序列,進(jìn)行核苷酸序列測定和遺傳進(jìn)化樹分析。結(jié)果 12份急性胃腸炎病例標(biāo)本,熒光PCR檢出諾如病毒核酸均為陽性,測序獲得10條序列。遺傳進(jìn)化樹顯示:10條GII.2型間核苷酸序列同源性為100%,與臺州參考株GII.2(GenBank登錄號:MH806429,MH842206)同源性最高(同源性最高為99.47%),且處于同一分支。結(jié)論此次急性胃腸炎暴發(fā)疫情由GII.P16-GII.2諾如病毒引起,鑒于它在中國的廣泛流行,應(yīng)重視GII.P16-GII.2重組株在本地區(qū)諾如病毒的監(jiān)測。
【文章來源】:安徽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2020,26(03)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
NoV衣殼蛋白區(qū)部分核苷酸序列進(jìn)化樹
NoV 聚合酶部分核苷酸序列進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃山市2018年兩起暴發(fā)疫情諾如病毒分子分型與基因特征分析[J]. 程鵬,史永林,楊小雙,張忠心. 安徽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2019(03)
[2]安徽省急性胃腸炎疫情相關(guān)GⅡ.P17-GⅡ.17基因型諾如病毒分子特征研究[J]. 史永林,葛盈露,金晶,劉敏鴻,汪飛鵬,陳曉龍,張文艷,孫永,胡萬富. 病毒學(xué)報. 2019(02)
[3]2017年安慶市急性胃腸炎暴發(fā)疫情病原體諾如病毒的鑒定及基因特征分析[J]. 劉敏鴻,金愛武,曹孟嬋,史永林,李賢相,徐四清. 中國病原生物學(xué)雜志. 2018(09)
[4]安徽省諾如病毒G II.4/Sydney 2012變異株分子特征分析[J]. 史永林,張文艷,金晶,周偉,湯仁樹,吳金菊,靳淼,胡萬富. 安徽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2016(06)
[5]安徽省諾如病毒胃腸炎暴發(fā)的分子病原學(xué)特征研究[J]. 史永林,孔翔羽,靳淼,方金才,施旭東,胡萬富. 中華實驗和臨床病毒學(xué)雜志. 2015 (04)
[6]我國諾如病毒感染性腹瀉流行現(xiàn)狀及防制措施建議[J]. 張靜,常昭瑞,孫軍玲,廖巧紅,邢薇佳,劉鳳鳳. 疾病監(jiān)測. 2014(07)
本文編號:3084222
【文章來源】:安徽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2020,26(03)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
NoV衣殼蛋白區(qū)部分核苷酸序列進(jìn)化樹
NoV 聚合酶部分核苷酸序列進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃山市2018年兩起暴發(fā)疫情諾如病毒分子分型與基因特征分析[J]. 程鵬,史永林,楊小雙,張忠心. 安徽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2019(03)
[2]安徽省急性胃腸炎疫情相關(guān)GⅡ.P17-GⅡ.17基因型諾如病毒分子特征研究[J]. 史永林,葛盈露,金晶,劉敏鴻,汪飛鵬,陳曉龍,張文艷,孫永,胡萬富. 病毒學(xué)報. 2019(02)
[3]2017年安慶市急性胃腸炎暴發(fā)疫情病原體諾如病毒的鑒定及基因特征分析[J]. 劉敏鴻,金愛武,曹孟嬋,史永林,李賢相,徐四清. 中國病原生物學(xué)雜志. 2018(09)
[4]安徽省諾如病毒G II.4/Sydney 2012變異株分子特征分析[J]. 史永林,張文艷,金晶,周偉,湯仁樹,吳金菊,靳淼,胡萬富. 安徽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2016(06)
[5]安徽省諾如病毒胃腸炎暴發(fā)的分子病原學(xué)特征研究[J]. 史永林,孔翔羽,靳淼,方金才,施旭東,胡萬富. 中華實驗和臨床病毒學(xué)雜志. 2015 (04)
[6]我國諾如病毒感染性腹瀉流行現(xiàn)狀及防制措施建議[J]. 張靜,常昭瑞,孫軍玲,廖巧紅,邢薇佳,劉鳳鳳. 疾病監(jiān)測. 2014(07)
本文編號:3084222
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