目的應(yīng)用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)分析結(jié)核潛伏感染相關(guān)蛋白R(shí)v3407的結(jié)構(gòu)及功能。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫中搜索結(jié)核分枝桿菌Rv3407蛋白的氨基酸序列,分別利用ProtParam、Protscale、TMHMM、PSORT、SignalP、ITASSER、NetNGlyc、NetPhos、Motif Scan、SOPMA、SWISS-MODEL等生物信息學(xué)軟件分析蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、親（疏）水性、跨膜螺旋、亞細(xì)胞定位、信號(hào)肽,可能與之結(jié)合的配體和該配體的結(jié)合位點(diǎn)、糖基化、磷酸化和翻譯后修飾位點(diǎn)及二、三級(jí)結(jié)構(gòu);采用BepiPred、ABCpred、IEDB預(yù)測(cè)分析B細(xì)胞表位,采用SYFPEITHI、RANKPEP、NetMHC、NetCTL預(yù)測(cè)分析細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞（CTL）表位,采用SYFPEITHI和RANKPEP預(yù)測(cè)分析輔助性T（Th）淋巴細(xì)胞表位。結(jié)果 Rv3407蛋白共由99個(gè)氨基酸構(gòu)成,分子式為C₄₇₁H₈₀₇N₁₅₅O₁₄₄S₂,不穩(wěn)定指數(shù)為46.59,為親水性不穩(wěn)定蛋白;無... 

【文章來源】：中國病原生物學(xué)雜志. 2020,15(08)北大核心

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

MTB Rv3407蛋白的親（疏）水性

MTB Rv3407蛋白的跨膜區(qū)預(yù)測(cè)

MTB Rv3407蛋白的信號(hào)肽預(yù)測(cè)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3078840