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基于深層遷移學(xué)習(xí)的DR胸片肺結(jié)核病灶檢測

發(fā)布時(shí)間:2021-03-08 19:45
  針對(duì)基于傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)方法設(shè)計(jì)的DR胸片肺結(jié)核檢測器存在著泛化能力不強(qiáng),實(shí)際檢測精度低等問題,提出了一種基于Focal Loss的深度學(xué)習(xí)檢測方法Tuberculosis Neural Net(TBNN).醫(yī)學(xué)圖像的特殊性,存在帶標(biāo)注的數(shù)據(jù)量小導(dǎo)致無法充分訓(xùn)練深層網(wǎng)絡(luò)模型等問題.該方法利用肺炎和肺結(jié)核同為呼吸道感染疾病且在DR胸片上有相似表征的特點(diǎn),基于遷移學(xué)習(xí)原理訓(xùn)練特征提取子網(wǎng)絡(luò),減少肺結(jié)核胸片樣本不足對(duì)模型訓(xùn)練造成的影響.首先在大型的肺炎胸片數(shù)據(jù)集上訓(xùn)練特征提取網(wǎng)絡(luò),以獲取DR圖像中豐富的深層圖像語義信息,然后使用樣本較少的肺結(jié)核數(shù)據(jù)集微調(diào)網(wǎng)絡(luò)參數(shù),并將多層卷積的輸出作為TBNN分類子網(wǎng)絡(luò)的輸入,得到基于DR胸片的肺結(jié)核病灶檢測模型.實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該方法生成的檢測模型在分類精度和性能上均優(yōu)于基于傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)的肺結(jié)核檢測器.在同等訓(xùn)練數(shù)據(jù)量和訓(xùn)練周期下,模型性能高于其他采用傳統(tǒng)數(shù)據(jù)增強(qiáng)方法的深層網(wǎng)絡(luò)肺結(jié)核檢測算法,且能標(biāo)識(shí)病灶區(qū)域,準(zhǔn)度上有不低于放射科閱片醫(yī)生的表現(xiàn). 

【文章來源】:四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,57(03)北大核心

【文章頁數(shù)】:10 頁

【部分圖文】:

基于深層遷移學(xué)習(xí)的DR胸片肺結(jié)核病灶檢測


基于Focal Loss的檢測框架

特征提取,肺結(jié)核


傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)只有在訓(xùn)練集數(shù)據(jù)和測試集數(shù)據(jù)都來自同一個(gè)域和同一分布的時(shí)候才能很好運(yùn)行,但是在實(shí)際應(yīng)用中,這種假設(shè)可能不成立.模型的泛化能力以及遷移能力很低,這也是運(yùn)用傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)方法處理醫(yī)學(xué)圖像問題的缺陷之一.根據(jù)經(jīng)驗(yàn),至少需要2萬張胸片才能充分訓(xùn)練一個(gè)深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò).遷移學(xué)習(xí)指從一個(gè)或多個(gè)任務(wù)的域中提取知識(shí)并將知識(shí)應(yīng)用于目標(biāo)任務(wù)的方法.即一個(gè)域D由兩個(gè)部分組成:特征空間X以及邊緣概率分布P(X),其中,X={x1,…,xn}∈X,指某個(gè)特定的學(xué)習(xí)樣本;一個(gè)任務(wù)T由輸出空間 Y= { y 1 , ? ,y n } 和預(yù)測函數(shù) f( ? )=Ρ(Y|X) 組成.T不能被觀察,但是可通過訓(xùn)練多組數(shù)據(jù) { x i ,y i } ,x i ∈X,y i ∈Y 被學(xué)習(xí).假設(shè)有兩個(gè)域DS和DT以及不同的學(xué)習(xí)任務(wù)TS和TT,遷移學(xué)習(xí)就是利用DS和TS的知識(shí)來改善任務(wù)TT的預(yù)測函數(shù)f(·)在域DT中的表現(xiàn)能力.基于肺炎在DR影像學(xué)上表征和肺結(jié)核相似的特點(diǎn),本文采用圖2所示的深層遷移學(xué)習(xí)方法實(shí)現(xiàn)DR胸片肺結(jié)核病灶檢測.小樣本肺結(jié)核標(biāo)注數(shù)據(jù)DT和目標(biāo)結(jié)核檢測任務(wù)TT,從肺炎檢測TS訓(xùn)練肺炎標(biāo)注數(shù)據(jù)DS的過程中,學(xué)習(xí)知識(shí)以充分訓(xùn)練深層特征提取網(wǎng)絡(luò)用于肺結(jié)核檢測任務(wù)TT.假設(shè)DS={(xS1,yS1),…,(xSn,ySn)},DT={(xT1,yT1),…,(xTn,yTn)},TS={YS,P(YS|XS)},TT={YT,P(YT|XT)},其中xSi∈XS,ySi∈YS,xTi∈XT,yTi∈YT.深層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)提取特征過程如式(4),當(dāng)域DS中特定數(shù)據(jù){xm,ym}通過f(xm)計(jì)算后,若 y ︿ m =y m ,則認(rèn)為特征提取成功.

肺結(jié)核,數(shù)據(jù)采集,胸片


2) 真實(shí)性.由于閱讀醫(yī)學(xué)圖像需要具備豐富的醫(yī)學(xué)理論知識(shí),我們從收集的胸片中,按圖3的三級(jí)遞進(jìn)式診斷中整理出1 935張疑似肺結(jié)核胸片由華西醫(yī)院結(jié)核專家做標(biāo)注.3) 準(zhǔn)確性.除了對(duì)肺結(jié)核胸片打標(biāo)簽外,還利用矩形框?qū)Σ∽儏^(qū)域做了像素級(jí)標(biāo)注.標(biāo)注前胸片已進(jìn)行了脫敏處理,只保留其圖像信息,如圖4.將標(biāo)注信息和圖像相匹配后,得到表1所示的肺結(jié)核標(biāo)注數(shù)據(jù)集.其中,X, Y, Width, Height分別表示標(biāo)注框的左上頂點(diǎn)的坐標(biāo)以及標(biāo)注框的寬和高的像素值.

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3071570

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