核酸檢測技術(shù)對日本血吸蟲病診斷價值的meta分析
發(fā)布時間:2021-02-10 02:31
目的應(yīng)用診斷試驗meta分析,定量評價核酸檢測中變溫和等溫擴增技術(shù)對日本血吸蟲病的診斷價值。方法通過計算機檢索1990年1月-2019年6月中國知網(wǎng)、萬方數(shù)據(jù)知識服務(wù)平臺、PubMed數(shù)據(jù)庫和ScienceDirect數(shù)據(jù)庫中公開發(fā)表的日本血吸蟲病核酸檢測相關(guān)文獻,手工查閱《血吸蟲病研究資料匯編》及論文集等紙質(zhì)出版物,并以文獻追溯法對相關(guān)文獻引文進行追溯查找。按照納入與排除標(biāo)準(zhǔn)對檢索的文獻進行篩選,提取納入文獻相關(guān)數(shù)據(jù),采用RevMan 5.3軟件對入選文獻進行質(zhì)量評價,采用MetaDiSc 1.4軟件對數(shù)據(jù)進行meta分析。結(jié)果最終納入19篇文獻,其中中文文獻5篇、英文文獻14篇;共24組研究,其中17組研究涉及變溫擴增技術(shù)與金標(biāo)準(zhǔn)的比較、7組研究涉及等溫擴增技術(shù)與金標(biāo)準(zhǔn)的比較。文獻質(zhì)量評價結(jié)果表明,所納入文獻總體偏倚較小;Deek漏斗圖提示變溫擴增技術(shù)相關(guān)文獻可能存在發(fā)表偏倚。變溫擴增技術(shù)相關(guān)研究間存在非閾值效應(yīng)引起的異質(zhì)性,故采用隨機效應(yīng)模型合并效應(yīng)量;合并分析結(jié)果示,其檢測日本血吸蟲病的綜合靈敏度為0.81(0.79,0.83)、特異度為0.73(0.71,0.74)、SROC...
【文章來源】:中國血吸蟲病防治雜志. 2020,32(01)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
變溫擴增技術(shù)檢測日本血吸蟲病靈敏度與特異度的森林圖Fig.4Forestchartofsensitivityandspecificityof
?惺?莘治;嬤粕??圖,分別計算變溫擴增技術(shù)和等溫擴增技術(shù)的合并靈敏度、特異度、陰性似然比、陽性似然比、診斷比值比(Diagnosticoddsratio,DOR)及95%可信區(qū)間(Confidenceinterval,CI)。結(jié)果1文獻篩選及數(shù)據(jù)提取共檢索相關(guān)文獻2957篇,其中中文文獻2209篇、英文文獻748篇。根據(jù)納入與排除標(biāo)準(zhǔn),最終納入文獻19篇,其中中文文獻5篇、英文文獻14篇;共24組研究,其中17組研究采用變溫擴增技術(shù)與金標(biāo)準(zhǔn)、7組研究采用等溫擴增技術(shù)與金標(biāo)準(zhǔn)。文獻篩選過程見圖1。對所有納入的文獻進行數(shù)據(jù)提取,具體信息見表1。圖1文獻篩選流程Fig.1Publicationselectionprocess表1納入文獻數(shù)據(jù)提取表Table1Dataextractionfromtheincludedpublications文獻Literature[8][9][10][11][12](1)[13][14][15]評估類型Typeofevaluative實驗室評估Laboratoryevaluation現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication實驗室評估Laboratoryevaluation檢測方法Method多重PCRMultiplexPCRPCRPCRdPCRPCRPCRqPCRqPCRn37683621648252106560294TP1251231511412194FP0191357013238439FN20011708728TN23443376462388248133樣本(來源)Sample(Source)糞樣(老鼠)Stool(mouse)糞樣、尿樣(人)Stoolandurine(people)釘螺Snail糞便
中國血吸蟲病防治雜志2020年第32卷第1期ChinJSchistoControl2020,Vol.32,No.12文獻質(zhì)量評價使用RevMan5.3軟件,根據(jù)QUADAS2方法,從“病例選擇”、“待評價試驗”、“金標(biāo)準(zhǔn)”和“病例流程和進展情況”4個方面進行文獻質(zhì)量評價。結(jié)果顯示,高風(fēng)險條目主要為病例選擇偏倚,待評價試驗偏倚和金標(biāo)準(zhǔn)偏倚均較校結(jié)果表明,本研究所納入文獻總體偏倚較小,質(zhì)量相對較高,整體可信性較高(圖2)。圖2納入文獻質(zhì)量評價圖Fig.2Chartofqualityevaluationoftheincludedliteratures3文獻發(fā)表偏倚因納入的等溫擴增技術(shù)相關(guān)研究數(shù)量少于10項,故未采用漏斗圖評價其發(fā)表偏倚。采用Deek漏斗圖評價所納入變溫擴增技術(shù)相關(guān)文獻的發(fā)表偏倚,共17組研究,根據(jù)Deek漏斗圖得出P<0.05,漏斗圖不對稱,提示可能存在發(fā)表偏倚(圖3)。圖3Deek漏斗圖Fig.3Deekfunnelplot4meta分析結(jié)果4.1變溫擴增技術(shù)診斷日本血吸蟲病價值的meta分析SROC曲線平面圖不呈“肩臂狀”分布,Spearman相關(guān)系數(shù)=0.16,P=0.55,均提示不存在閾值效應(yīng)。Q=212.73,I2=92.5%,P=0.00,提示存在非閾值效應(yīng)引起的異質(zhì)性。meta回歸分析發(fā)現(xiàn),納入研究間的異質(zhì)性來源與發(fā)表時間無關(guān)(P=0.13),與評估類型、樣本量大小及檢測方法有關(guān)(P=0.01、0.00、0.01),最終不能排除異質(zhì)性影響,故采用隨機效應(yīng)模型合并效應(yīng)量,合并靈敏度、特異度、陽性似然比、陰性似然比、DOR值及其95%CI分別為0.81(0.79,0.83)、0.73(0.71,0.74)、8.30(4.66,14.77)、0.20(0.14,0.30)、61.98(23.85,161
【參考文獻】:
期刊論文
[1]診斷準(zhǔn)確性試驗Meta分析四格表數(shù)據(jù)的提取方法[J]. 劉海寧,吳昊,張寧萍,李煜,曾于珍,沈錫中,劉韜韜. 中國循證醫(yī)學(xué)雜志. 2018(09)
[2]等溫擴增技術(shù)在寄生蟲及其他病原體檢測中的應(yīng)用[J]. 李婷,楊坤. 中國血吸蟲病防治雜志. 2018(02)
[3]日本血吸蟲巢式PCR檢測方法的建立[J]. 曾凡勝,何露,何雪梅,楊杰,秦志強. 熱帶病與寄生蟲學(xué). 2017(03)
[4]環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)在病原物檢測上的應(yīng)用研究進展[J]. 戴婷婷,陸辰晨,鄭小波. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(05)
[5]PCR技術(shù)在血吸蟲感染檢測中的應(yīng)用[J]. 秦圓方,祁賢,吳,|. 中國病原生物學(xué)雜志. 2011(04)
[6]糞便PCR檢測法用于診斷日本血吸蟲病應(yīng)用價值的研究[J]. 王珍麗,汪天平,汪奇志,尹曉梅,周利,汪峰峰,王玥,章樂生. 熱帶病與寄生蟲學(xué). 2009 (01)
[7]環(huán)介導(dǎo)同溫DNA擴增技術(shù)鑒定血吸蟲感染性釘螺方法的建立[J]. 余傳信,殷旭仁,華萬全,高琪. 中國病原生物學(xué)雜志. 2008(09)
[8]核酸檢測技術(shù)在寄生蟲病診斷中的應(yīng)用[J]. 肖祥,沈繼龍. 熱帶病與寄生蟲學(xué). 2000(02)
博士論文
[1]LAMP檢測法用于日本血吸蟲病早期診斷及療效考核的研究[D]. 許靜.蘇州大學(xué) 2011
碩士論文
[1]Real-time PCR檢測感染宿主血清日本血吸蟲DNA水平動態(tài)變化及其在血吸蟲病診斷和療效考核中的意義[D]. 官威.蘇州大學(xué) 2013
本文編號:3026644
【文章來源】:中國血吸蟲病防治雜志. 2020,32(01)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
變溫擴增技術(shù)檢測日本血吸蟲病靈敏度與特異度的森林圖Fig.4Forestchartofsensitivityandspecificityof
?惺?莘治;嬤粕??圖,分別計算變溫擴增技術(shù)和等溫擴增技術(shù)的合并靈敏度、特異度、陰性似然比、陽性似然比、診斷比值比(Diagnosticoddsratio,DOR)及95%可信區(qū)間(Confidenceinterval,CI)。結(jié)果1文獻篩選及數(shù)據(jù)提取共檢索相關(guān)文獻2957篇,其中中文文獻2209篇、英文文獻748篇。根據(jù)納入與排除標(biāo)準(zhǔn),最終納入文獻19篇,其中中文文獻5篇、英文文獻14篇;共24組研究,其中17組研究采用變溫擴增技術(shù)與金標(biāo)準(zhǔn)、7組研究采用等溫擴增技術(shù)與金標(biāo)準(zhǔn)。文獻篩選過程見圖1。對所有納入的文獻進行數(shù)據(jù)提取,具體信息見表1。圖1文獻篩選流程Fig.1Publicationselectionprocess表1納入文獻數(shù)據(jù)提取表Table1Dataextractionfromtheincludedpublications文獻Literature[8][9][10][11][12](1)[13][14][15]評估類型Typeofevaluative實驗室評估Laboratoryevaluation現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication現(xiàn)場應(yīng)用Fieldapplication實驗室評估Laboratoryevaluation檢測方法Method多重PCRMultiplexPCRPCRPCRdPCRPCRPCRqPCRqPCRn37683621648252106560294TP1251231511412194FP0191357013238439FN20011708728TN23443376462388248133樣本(來源)Sample(Source)糞樣(老鼠)Stool(mouse)糞樣、尿樣(人)Stoolandurine(people)釘螺Snail糞便
中國血吸蟲病防治雜志2020年第32卷第1期ChinJSchistoControl2020,Vol.32,No.12文獻質(zhì)量評價使用RevMan5.3軟件,根據(jù)QUADAS2方法,從“病例選擇”、“待評價試驗”、“金標(biāo)準(zhǔn)”和“病例流程和進展情況”4個方面進行文獻質(zhì)量評價。結(jié)果顯示,高風(fēng)險條目主要為病例選擇偏倚,待評價試驗偏倚和金標(biāo)準(zhǔn)偏倚均較校結(jié)果表明,本研究所納入文獻總體偏倚較小,質(zhì)量相對較高,整體可信性較高(圖2)。圖2納入文獻質(zhì)量評價圖Fig.2Chartofqualityevaluationoftheincludedliteratures3文獻發(fā)表偏倚因納入的等溫擴增技術(shù)相關(guān)研究數(shù)量少于10項,故未采用漏斗圖評價其發(fā)表偏倚。采用Deek漏斗圖評價所納入變溫擴增技術(shù)相關(guān)文獻的發(fā)表偏倚,共17組研究,根據(jù)Deek漏斗圖得出P<0.05,漏斗圖不對稱,提示可能存在發(fā)表偏倚(圖3)。圖3Deek漏斗圖Fig.3Deekfunnelplot4meta分析結(jié)果4.1變溫擴增技術(shù)診斷日本血吸蟲病價值的meta分析SROC曲線平面圖不呈“肩臂狀”分布,Spearman相關(guān)系數(shù)=0.16,P=0.55,均提示不存在閾值效應(yīng)。Q=212.73,I2=92.5%,P=0.00,提示存在非閾值效應(yīng)引起的異質(zhì)性。meta回歸分析發(fā)現(xiàn),納入研究間的異質(zhì)性來源與發(fā)表時間無關(guān)(P=0.13),與評估類型、樣本量大小及檢測方法有關(guān)(P=0.01、0.00、0.01),最終不能排除異質(zhì)性影響,故采用隨機效應(yīng)模型合并效應(yīng)量,合并靈敏度、特異度、陽性似然比、陰性似然比、DOR值及其95%CI分別為0.81(0.79,0.83)、0.73(0.71,0.74)、8.30(4.66,14.77)、0.20(0.14,0.30)、61.98(23.85,161
【參考文獻】:
期刊論文
[1]診斷準(zhǔn)確性試驗Meta分析四格表數(shù)據(jù)的提取方法[J]. 劉海寧,吳昊,張寧萍,李煜,曾于珍,沈錫中,劉韜韜. 中國循證醫(yī)學(xué)雜志. 2018(09)
[2]等溫擴增技術(shù)在寄生蟲及其他病原體檢測中的應(yīng)用[J]. 李婷,楊坤. 中國血吸蟲病防治雜志. 2018(02)
[3]日本血吸蟲巢式PCR檢測方法的建立[J]. 曾凡勝,何露,何雪梅,楊杰,秦志強. 熱帶病與寄生蟲學(xué). 2017(03)
[4]環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)在病原物檢測上的應(yīng)用研究進展[J]. 戴婷婷,陸辰晨,鄭小波. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(05)
[5]PCR技術(shù)在血吸蟲感染檢測中的應(yīng)用[J]. 秦圓方,祁賢,吳,|. 中國病原生物學(xué)雜志. 2011(04)
[6]糞便PCR檢測法用于診斷日本血吸蟲病應(yīng)用價值的研究[J]. 王珍麗,汪天平,汪奇志,尹曉梅,周利,汪峰峰,王玥,章樂生. 熱帶病與寄生蟲學(xué). 2009 (01)
[7]環(huán)介導(dǎo)同溫DNA擴增技術(shù)鑒定血吸蟲感染性釘螺方法的建立[J]. 余傳信,殷旭仁,華萬全,高琪. 中國病原生物學(xué)雜志. 2008(09)
[8]核酸檢測技術(shù)在寄生蟲病診斷中的應(yīng)用[J]. 肖祥,沈繼龍. 熱帶病與寄生蟲學(xué). 2000(02)
博士論文
[1]LAMP檢測法用于日本血吸蟲病早期診斷及療效考核的研究[D]. 許靜.蘇州大學(xué) 2011
碩士論文
[1]Real-time PCR檢測感染宿主血清日本血吸蟲DNA水平動態(tài)變化及其在血吸蟲病診斷和療效考核中的意義[D]. 官威.蘇州大學(xué) 2013
本文編號:3026644
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