廣州市2018年輸入性登革病毒4型全基因組序列特征分析
發(fā)布時間:2021-02-09 08:01
目的本文對廣州市2018年輸入性DENV-4型病毒的生物學來源進行分析,為本地登革熱的防控提供科學依據(jù)并累積基線數(shù)據(jù)。方法通過傳染病監(jiān)測網(wǎng)絡收集廣州市2018年輸入性DENV-4病例,對急性期患者血清進行病毒分離培養(yǎng)并對分離到的DENV-4毒株進行全基因組測序、系統(tǒng)發(fā)生樹重建和生物信息學分析。結果共分離得到5株DENV-4毒株,其中4株由泰國和柬埔寨輸入的分離株均屬于DENV-4基因Ⅰ型;菲律賓輸入的病例分離株與其他4株親緣性較低,屬于DENV-4基因Ⅱa型;5株分離株間的核苷酸(氨基酸)同源性為90.8%(96.7%~96.9%);經(jīng)過比對,5株分離株和6株參考株的E蛋白區(qū)域有9個位點出現(xiàn)差異,NS1蛋白區(qū)域有14個位點出現(xiàn)差異,NS5蛋白區(qū)域有25個位點出現(xiàn)差異。結論本研究對廣州地區(qū)輸入性DENV-4毒株進行全基因組測定,間接地掌握周邊國家地區(qū)DENV-4的基因特征,為本地登革熱的防控和溯源提供基線數(shù)據(jù),具有重要的公共衛(wèi)生意義。
【文章來源】:中國人獸共患病學報. 2020,36(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
廣州市2018年DENV-4分離株基因組全序列進化樹重建結果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2014-2017年廣州市登革熱連續(xù)暴發(fā)的街道登革病毒E基因進化分析[J]. 蔣力云,李意蘭,蘇文哲,陳宗遒,曹毅敏,劉文輝,狄飚,楊智聰. 熱帶醫(yī)學雜志. 2018(09)
[2]云南省登革4型病毒全基因組序列特征研究[J]. 胡挺松,張海林,劉永華,鄧波,尹小雄,徐松淼,李萍,范泉水,張富強. 中國人獸共患病學報. 2017(10)
[3]登革病毒非結構蛋白NS5研究進展[J]. 劉強強,王明連,李艷. 中國病毒病雜志. 2016(04)
[4]登革病毒非結構蛋白1結構及功能研究進展[J]. 陳月,任瑞文,劉建偉. 病毒學報. 2014(06)
[5]19782014年我國登革熱的流行病學分析[J]. 熊益權,陳清. 南方醫(yī)科大學學報. 2014(12)
[6]登革病毒的基因組分析及中國登革毒株的來源(英文)[J]. 張擁軍,周朝暉,黃萌,王金章,陳煒. 中國人獸共患病學報. 2012(06)
本文編號:3025328
【文章來源】:中國人獸共患病學報. 2020,36(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
廣州市2018年DENV-4分離株基因組全序列進化樹重建結果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2014-2017年廣州市登革熱連續(xù)暴發(fā)的街道登革病毒E基因進化分析[J]. 蔣力云,李意蘭,蘇文哲,陳宗遒,曹毅敏,劉文輝,狄飚,楊智聰. 熱帶醫(yī)學雜志. 2018(09)
[2]云南省登革4型病毒全基因組序列特征研究[J]. 胡挺松,張海林,劉永華,鄧波,尹小雄,徐松淼,李萍,范泉水,張富強. 中國人獸共患病學報. 2017(10)
[3]登革病毒非結構蛋白NS5研究進展[J]. 劉強強,王明連,李艷. 中國病毒病雜志. 2016(04)
[4]登革病毒非結構蛋白1結構及功能研究進展[J]. 陳月,任瑞文,劉建偉. 病毒學報. 2014(06)
[5]19782014年我國登革熱的流行病學分析[J]. 熊益權,陳清. 南方醫(yī)科大學學報. 2014(12)
[6]登革病毒的基因組分析及中國登革毒株的來源(英文)[J]. 張擁軍,周朝暉,黃萌,王金章,陳煒. 中國人獸共患病學報. 2012(06)
本文編號:3025328
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