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廣州市2018年輸入性登革病毒4型全基因組序列特征分析

發(fā)布時間:2021-02-09 08:01
  目的本文對廣州市2018年輸入性DENV-4型病毒的生物學來源進行分析,為本地登革熱的防控提供科學依據(jù)并累積基線數(shù)據(jù)。方法通過傳染病監(jiān)測網(wǎng)絡收集廣州市2018年輸入性DENV-4病例,對急性期患者血清進行病毒分離培養(yǎng)并對分離到的DENV-4毒株進行全基因組測序、系統(tǒng)發(fā)生樹重建和生物信息學分析。結果共分離得到5株DENV-4毒株,其中4株由泰國和柬埔寨輸入的分離株均屬于DENV-4基因Ⅰ型;菲律賓輸入的病例分離株與其他4株親緣性較低,屬于DENV-4基因Ⅱa型;5株分離株間的核苷酸(氨基酸)同源性為90.8%(96.7%~96.9%);經(jīng)過比對,5株分離株和6株參考株的E蛋白區(qū)域有9個位點出現(xiàn)差異,NS1蛋白區(qū)域有14個位點出現(xiàn)差異,NS5蛋白區(qū)域有25個位點出現(xiàn)差異。結論本研究對廣州地區(qū)輸入性DENV-4毒株進行全基因組測定,間接地掌握周邊國家地區(qū)DENV-4的基因特征,為本地登革熱的防控和溯源提供基線數(shù)據(jù),具有重要的公共衛(wèi)生意義。 

【文章來源】:中國人獸共患病學報. 2020,36(03)北大核心

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

廣州市2018年輸入性登革病毒4型全基因組序列特征分析


廣州市2018年DENV-4分離株基因組全序列進化樹重建結果

【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3025328

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