目的分析廣州市2018年輸入型登革熱病毒3型（DENV-Ⅲ）毒生物學(xué)來源,為本地登革熱防控提供科學(xué)依據(jù)和基線數(shù)據(jù)。方法通過傳染病監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)收集廣州市2018年輸入型DENV-Ⅲ病例,對患者急性期血清進行病毒分離培養(yǎng)、全基因組測序、系統(tǒng)發(fā)生樹重建和生物信息學(xué)分析。結(jié)果共分離到4株DENV-Ⅲ型毒株,株間核苷酸（氨基酸）同源性為91.8%～97.3%（97.6%～99.4%）;泰國輸入的分離株屬于G-I型,與印度尼西亞2016年分離株的距離最近;其余3株分離株屬于G-Ⅲ型,在進化樹上處于同一分支,分別與老撾、巴基斯坦和新加坡分離株的距離最近;經(jīng)過比對,4株分離株和13株參考株的E蛋白區(qū)域有18個氨基酸位點出現(xiàn)替換,NS1蛋白區(qū)域有7個氨基酸位點出現(xiàn)替換,NS5蛋白區(qū)域有21個氨基酸位點出現(xiàn)替換。結(jié)論廣州市2018年輸入型DENV-Ⅲ毒株分屬于2個不同的基因型亞群,在進化上距離較遠,抗原性差異較大;通過全基因組測序和特征分析,逐步完善周邊地區(qū)的病毒特征信息,為防控工作提供生物學(xué)溯源依據(jù),具有重要意義。 

【文章來源】：現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2020,47(06)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

廣州市2018年DENV-Ⅲ分離株基因組全序列進化樹重建結(jié)果

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：2997119