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2018年廣州市輸入型登革病毒3型基因組全序列測(cè)定和特征分析

發(fā)布時(shí)間:2021-01-24 10:56
  目的分析廣州市2018年輸入型登革熱病毒3型(DENV-Ⅲ)毒生物學(xué)來源,為本地登革熱防控提供科學(xué)依據(jù)和基線數(shù)據(jù)。方法通過傳染病監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)收集廣州市2018年輸入型DENV-Ⅲ病例,對(duì)患者急性期血清進(jìn)行病毒分離培養(yǎng)、全基因組測(cè)序、系統(tǒng)發(fā)生樹重建和生物信息學(xué)分析。結(jié)果共分離到4株DENV-Ⅲ型毒株,株間核苷酸(氨基酸)同源性為91.8%~97.3%(97.6%~99.4%);泰國(guó)輸入的分離株屬于G-I型,與印度尼西亞2016年分離株的距離最近;其余3株分離株屬于G-Ⅲ型,在進(jìn)化樹上處于同一分支,分別與老撾、巴基斯坦和新加坡分離株的距離最近;經(jīng)過比對(duì),4株分離株和13株參考株的E蛋白區(qū)域有18個(gè)氨基酸位點(diǎn)出現(xiàn)替換,NS1蛋白區(qū)域有7個(gè)氨基酸位點(diǎn)出現(xiàn)替換,NS5蛋白區(qū)域有21個(gè)氨基酸位點(diǎn)出現(xiàn)替換。結(jié)論廣州市2018年輸入型DENV-Ⅲ毒株分屬于2個(gè)不同的基因型亞群,在進(jìn)化上距離較遠(yuǎn),抗原性差異較大;通過全基因組測(cè)序和特征分析,逐步完善周邊地區(qū)的病毒特征信息,為防控工作提供生物學(xué)溯源依據(jù),具有重要意義。 

【文章來源】:現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2020,47(06)北大核心

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

2018年廣州市輸入型登革病毒3型基因組全序列測(cè)定和特征分析


廣州市2018年DENV-Ⅲ分離株基因組全序列進(jìn)化樹重建結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2014-2017年廣州市登革熱連續(xù)暴發(fā)的街道登革病毒E基因進(jìn)化分析[J]. 蔣力云,李意蘭,蘇文哲,陳宗遒,曹毅敏,劉文輝,狄飚,楊智聰.  熱帶醫(yī)學(xué)雜志. 2018(09)
[2]云南省景洪市2013年登革熱暴發(fā)的分子流行病學(xué)研究[J]. 馮云,范建華,朱進(jìn),李鴻斌,車英,李衛(wèi)平,刀天友,楊衛(wèi)紅,章域震,張海林.  中華流行病學(xué)雜志. 2014 (12)
[3]4種血清型登革病毒NS1蛋白序列及B細(xì)胞抗原表位特異性分析[J]. 陳艷佳,熊建英,朱利,曹虹,趙衛(wèi).  現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2013(01)
[4]廣州市1978至2006年登革熱流行病學(xué)特征分析[J]. 羅雷,楊智聰,王玉林,劉于飛.  中華傳染病雜志. 2008 (08)



本文編號(hào):2997119

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