拉曼光譜技術(shù)在乙型病毒肝炎血清診斷試驗(yàn)中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-01-16 02:23
目的:研究應(yīng)用拉曼光譜技術(shù)通過血清檢測(cè)以篩查感染乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)血清。方法:1.分別選擇HBV感染血清和非HBV感染血清各20例,用拉曼光譜儀在不同波長(zhǎng)條件下進(jìn)行檢測(cè),以選擇最佳實(shí)驗(yàn)條件。2.在上述最佳條件下,選擇500例研究組血清標(biāo)本、500例對(duì)照組血清標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),首先將測(cè)定的光譜圖運(yùn)用自適應(yīng)迭代重加權(quán)懲罰最小二乘法(adaptive iterative re-weighted penalized least squares,airPLS)進(jìn)行拉曼光譜中扣除熒光背景,然后運(yùn)用主成分分析法(Principal Component Analysis,PCA)將處理后的拉曼光譜進(jìn)行主成分特征提取,接著運(yùn)用支持向量機(jī)(Support Vector Machine,SVM)進(jìn)行建模和預(yù)測(cè),粒子群優(yōu)化(Particle Swarm optimization,PSO)算法代替?zhèn)鹘y(tǒng)的網(wǎng)格搜索來優(yōu)化SVM的參數(shù)。最后建立感染HBV血清的診斷模型。3.采用盲法方法按照所建立的模型和運(yùn)用熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,...
【文章來源】:新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
病例組與對(duì)照組之間的歸一化平均拉曼光譜的比較
新疆醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文25圖2拉曼光譜的三個(gè)主成分的三維散點(diǎn)圖Figure2Three-dimensionalscatterplotofthethreeprincipalcomponentsoftheRamanspectrum通過PSO-SVM建立的感染HBV血清模型進(jìn)行計(jì)算,其準(zhǔn)確性為93.1%、靈敏度為100%、特異度為88%。為了進(jìn)一步驗(yàn)證模型對(duì)感染HBV血清診斷的可靠性,我們繪制了特征ROC曲線如圖4進(jìn)行評(píng)估。ROC曲線下的積分區(qū)域(AUC)為0.942,其曲線下面積比較大,表明本實(shí)驗(yàn)建立的模型具有更高的診斷準(zhǔn)確性。
新疆醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文26圖3通過PSO-SVM建立的乙型病毒肝炎模型的ROC曲線Figure3ROCcurveofhepatitisBvirusmodelestablishedbyPSO-SVM3鑒別感染乙型肝炎病毒血清模型的驗(yàn)證第一實(shí)驗(yàn)組通過拉曼光譜技術(shù)用盲法檢測(cè)了200例標(biāo)本,結(jié)果如(表5)。經(jīng)過計(jì)算得出:靈敏度:87%,特異度:92%,KAPPA值:0.79。表5第一實(shí)驗(yàn)組盲法實(shí)驗(yàn)結(jié)果Table5Blindexperimentalresultsofthefirstexperimentalgroup第二實(shí)驗(yàn)組通過拉曼光譜技術(shù)用盲法檢測(cè)了400例標(biāo)本,結(jié)果如表6。經(jīng)過計(jì)算得出:靈敏度:80%,特異度:79%,KAPPA值:0.59。拉曼光譜結(jié)果金標(biāo)準(zhǔn)合計(jì)陽(yáng)性陰性陽(yáng)性87895陰性1392105合計(jì)100100200
本文編號(hào):2979970
【文章來源】:新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
病例組與對(duì)照組之間的歸一化平均拉曼光譜的比較
新疆醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文25圖2拉曼光譜的三個(gè)主成分的三維散點(diǎn)圖Figure2Three-dimensionalscatterplotofthethreeprincipalcomponentsoftheRamanspectrum通過PSO-SVM建立的感染HBV血清模型進(jìn)行計(jì)算,其準(zhǔn)確性為93.1%、靈敏度為100%、特異度為88%。為了進(jìn)一步驗(yàn)證模型對(duì)感染HBV血清診斷的可靠性,我們繪制了特征ROC曲線如圖4進(jìn)行評(píng)估。ROC曲線下的積分區(qū)域(AUC)為0.942,其曲線下面積比較大,表明本實(shí)驗(yàn)建立的模型具有更高的診斷準(zhǔn)確性。
新疆醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文26圖3通過PSO-SVM建立的乙型病毒肝炎模型的ROC曲線Figure3ROCcurveofhepatitisBvirusmodelestablishedbyPSO-SVM3鑒別感染乙型肝炎病毒血清模型的驗(yàn)證第一實(shí)驗(yàn)組通過拉曼光譜技術(shù)用盲法檢測(cè)了200例標(biāo)本,結(jié)果如(表5)。經(jīng)過計(jì)算得出:靈敏度:87%,特異度:92%,KAPPA值:0.79。表5第一實(shí)驗(yàn)組盲法實(shí)驗(yàn)結(jié)果Table5Blindexperimentalresultsofthefirstexperimentalgroup第二實(shí)驗(yàn)組通過拉曼光譜技術(shù)用盲法檢測(cè)了400例標(biāo)本,結(jié)果如表6。經(jīng)過計(jì)算得出:靈敏度:80%,特異度:79%,KAPPA值:0.59。拉曼光譜結(jié)果金標(biāo)準(zhǔn)合計(jì)陽(yáng)性陰性陽(yáng)性87895陰性1392105合計(jì)100100200
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