HIV感染者腸道真菌菌群分布及分泌物變化與腸粘膜損傷
發(fā)布時(shí)間:2020-12-28 18:28
目的:對比尚未發(fā)展至AIDS期的無癥狀HIV感染者與健康人群腸道真菌群落、真菌分泌毒性蛋白、免疫屏障、機(jī)械屏障的差異,分析腸道真菌群落、毒性因子、免疫狀態(tài)之間的相關(guān)性。探討HIV感染者腸道真菌微生態(tài)變化與腸粘膜屏障受損的可能關(guān)聯(lián)。方法:將所有入組人員分為A組、B組、對照組。A組為確診后未治療的無癥狀HIV感染者,B組為確診后接受規(guī)范抗病毒治療的無癥狀HIV感染者,對照組為健康人群。采集入組人員糞便標(biāo)本及血液標(biāo)本,用真菌ITS1高通量測序技術(shù),分析三組人群腸道真菌菌落結(jié)構(gòu);用RT-qPCR技術(shù)檢測三組人群腸道真菌分泌毒性蛋白基因的表達(dá):凝集素樣序列蛋白3(ALS3)、菌絲壁蛋白1(HWP1)、磷酸酯酶B1(PLB1)、聚苯乙烯黏附增強(qiáng)蛋白1(EaP1)、分泌型天冬氨酸蛋白酶(SAPs);用流式細(xì)胞術(shù)檢測三組人群細(xì)胞免疫狀態(tài):CD4+T細(xì)胞計(jì)數(shù)(CD4)、CD4+T細(xì)胞百分比(CD4%);用酶連免疫吸附法檢測三組人群血清中腸粘膜機(jī)械屏障損傷標(biāo)志物的含量:脂肪酸結(jié)合蛋白(I-FABP)、D-乳酸(D-Lactata)及脂多糖(LPS)。使用SPSS...
【文章來源】:西南醫(yī)科大學(xué)四川省
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
下機(jī)數(shù)據(jù)處理流程
-26-結(jié)果1三組人群腸道糞便真菌ITS1高通量測序結(jié)果:1.1測序數(shù)據(jù):對三組人群糞便樣本檢測發(fā)現(xiàn),共得到2209113條有效序列,序列平均長度為215.37bp。1.2OUT數(shù)分析:三組測序結(jié)果中各組所獨(dú)有、共有OUT數(shù)量見下圖3-A。圖3:A:各組獨(dú)有、共有OUT數(shù)量韋恩圖;B三組間NMDS分析圖,點(diǎn)與點(diǎn)之間連線的距離表示差異程度;C三組樣本稀釋曲線;D三組樣本等級聚類曲線
-27-1.3物種相對豐度分析:在門水平上,三組腸道糞便真菌以子囊菌門、擔(dān)子菌門為主,A組這兩個(gè)菌門占87.34%,B組這兩個(gè)菌門占85.60%,對照組這兩個(gè)菌門占92.87%。在屬水平上,A組以鐮刀菌屬、念珠菌屬、梗霉屬為主,豐度分別為0.643472、0.174736、0.018045;B組以鐮刀菌屬、鏈格孢屬、念珠菌屬為主,豐度分別為0.652034、0.070699、0.029777;對照組以鐮刀菌屬、梗霉屬為主,念珠菌屬相對低,豐度分別為0.77856、0.069153、0.000847。在能檢測到的種水平上,A組以鐮刀菌、白念珠菌為主,相對豐度分別為0.642799、0.173693;在B組以鐮刀菌、鏈格孢、白念珠菌為主,相對豐度分別為0.65131、0.070501、0.027628;在對照組以鐮刀菌、梗霉菌為主,白念珠菌相對低,相對豐度分別為0.777822、0.069153、0.000478。見門、屬、種水平的物種相對豐度柱狀圖及熱圖(圖4、5、6),桑葚圖(圖7)可看出念珠菌屬變化趨勢較大。圖4:各組門水平物種相對豐度柱狀圖、熱圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]兒童特應(yīng)性皮炎患者腸道菌群中益生菌的構(gòu)成比研究[J]. 羅瑞靜,王英杰,劉杰,彭勇,武宗琴,姜珠倩,李淑,柴維漢. 中國麻風(fēng)皮膚病雜志. 2018(11)
[2]腸道微生態(tài)與代謝性疾病[J]. 田慧,楊琳,王娜. 中國老年學(xué)雜志. 2018(19)
[3]2018年4月全國艾滋病性病疫情[J]. NCAIDS,NCSTD,China CDC;. 中國艾滋病性病. 2018(06)
[4]腸道菌群與腸道外腫瘤關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 龐冰玉,姜雅菲,李穎,鄭燕芳. 實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志. 2017(20)
[5]高通量測序技術(shù)在腸道微生物宏基因組學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 葉雷,閆亞麗,陳慶森,趙林森,齡南,龐廣昌. 中國食品學(xué)報(bào). 2016(07)
[6]假絲酵母黏附相關(guān)糖基磷脂酰肌醇錨定細(xì)胞壁蛋白的研究進(jìn)展[J]. 嚴(yán)蕾,唐建國. 微生物與感染. 2013(03)
[7]艾滋病和艾滋病病毒感染診斷標(biāo)準(zhǔn)[J]. 邵一鳴,康來儀,汪寧,張福杰,李太生,尚紅,鐘平,李敬云,朱關(guān)福,鄭錫文,蔣巖,趙紅心,吳昊,張曉燕,朱紅. 中國艾滋病性病. 2012(04)
[8]高通量測序技術(shù)及其在微生物學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 秦楠,栗東芳,楊瑞馥. 微生物學(xué)報(bào). 2011(04)
博士論文
[1]腸內(nèi)營養(yǎng)對艾滋病患者腸屏障功能的影響及機(jī)制研究[D]. 郭世奎.昆明醫(yī)科大學(xué) 2014
本文編號:2944198
【文章來源】:西南醫(yī)科大學(xué)四川省
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
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-26-結(jié)果1三組人群腸道糞便真菌ITS1高通量測序結(jié)果:1.1測序數(shù)據(jù):對三組人群糞便樣本檢測發(fā)現(xiàn),共得到2209113條有效序列,序列平均長度為215.37bp。1.2OUT數(shù)分析:三組測序結(jié)果中各組所獨(dú)有、共有OUT數(shù)量見下圖3-A。圖3:A:各組獨(dú)有、共有OUT數(shù)量韋恩圖;B三組間NMDS分析圖,點(diǎn)與點(diǎn)之間連線的距離表示差異程度;C三組樣本稀釋曲線;D三組樣本等級聚類曲線
-27-1.3物種相對豐度分析:在門水平上,三組腸道糞便真菌以子囊菌門、擔(dān)子菌門為主,A組這兩個(gè)菌門占87.34%,B組這兩個(gè)菌門占85.60%,對照組這兩個(gè)菌門占92.87%。在屬水平上,A組以鐮刀菌屬、念珠菌屬、梗霉屬為主,豐度分別為0.643472、0.174736、0.018045;B組以鐮刀菌屬、鏈格孢屬、念珠菌屬為主,豐度分別為0.652034、0.070699、0.029777;對照組以鐮刀菌屬、梗霉屬為主,念珠菌屬相對低,豐度分別為0.77856、0.069153、0.000847。在能檢測到的種水平上,A組以鐮刀菌、白念珠菌為主,相對豐度分別為0.642799、0.173693;在B組以鐮刀菌、鏈格孢、白念珠菌為主,相對豐度分別為0.65131、0.070501、0.027628;在對照組以鐮刀菌、梗霉菌為主,白念珠菌相對低,相對豐度分別為0.777822、0.069153、0.000478。見門、屬、種水平的物種相對豐度柱狀圖及熱圖(圖4、5、6),桑葚圖(圖7)可看出念珠菌屬變化趨勢較大。圖4:各組門水平物種相對豐度柱狀圖、熱圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]兒童特應(yīng)性皮炎患者腸道菌群中益生菌的構(gòu)成比研究[J]. 羅瑞靜,王英杰,劉杰,彭勇,武宗琴,姜珠倩,李淑,柴維漢. 中國麻風(fēng)皮膚病雜志. 2018(11)
[2]腸道微生態(tài)與代謝性疾病[J]. 田慧,楊琳,王娜. 中國老年學(xué)雜志. 2018(19)
[3]2018年4月全國艾滋病性病疫情[J]. NCAIDS,NCSTD,China CDC;. 中國艾滋病性病. 2018(06)
[4]腸道菌群與腸道外腫瘤關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 龐冰玉,姜雅菲,李穎,鄭燕芳. 實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志. 2017(20)
[5]高通量測序技術(shù)在腸道微生物宏基因組學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 葉雷,閆亞麗,陳慶森,趙林森,齡南,龐廣昌. 中國食品學(xué)報(bào). 2016(07)
[6]假絲酵母黏附相關(guān)糖基磷脂酰肌醇錨定細(xì)胞壁蛋白的研究進(jìn)展[J]. 嚴(yán)蕾,唐建國. 微生物與感染. 2013(03)
[7]艾滋病和艾滋病病毒感染診斷標(biāo)準(zhǔn)[J]. 邵一鳴,康來儀,汪寧,張福杰,李太生,尚紅,鐘平,李敬云,朱關(guān)福,鄭錫文,蔣巖,趙紅心,吳昊,張曉燕,朱紅. 中國艾滋病性病. 2012(04)
[8]高通量測序技術(shù)及其在微生物學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 秦楠,栗東芳,楊瑞馥. 微生物學(xué)報(bào). 2011(04)
博士論文
[1]腸內(nèi)營養(yǎng)對艾滋病患者腸屏障功能的影響及機(jī)制研究[D]. 郭世奎.昆明醫(yī)科大學(xué) 2014
本文編號:2944198
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