目的分析2013年-2018年安徽省外環(huán)境中H9N2亞型禽流感病毒（avian influenza virus, AIVs）血凝素（hemagglutinin, HA）基因變異特征。方法將所有安徽省禽流感外環(huán)境監(jiān)測(cè)點(diǎn)搜集的H9N2亞型核酸陽(yáng)性樣本接種雞胚分離病毒,病毒RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA后用特異性引物進(jìn)行擴(kuò)增,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)產(chǎn)物通過(guò)基因測(cè)序后獲得HA基因序列,應(yīng)用分子生物學(xué)軟件進(jìn)行分析;使用DATAMONKEY在線服務(wù)器進(jìn)行基因選擇壓力分析,并使用SWISS-MODLE軟件構(gòu)建分子突變?nèi)S構(gòu)象。結(jié)果獲得33株H9N2 AIVs屬于h9.4.2.5進(jìn)化分支,受體結(jié)合位點(diǎn)183、226和227位置分別突變?yōu)镹、L和M,189和190位置存在多樣性;2015年以后分離的毒株均攜帶6個(gè)糖基化位點(diǎn);選擇壓力分析得出160位置承受較大的正向選擇壓力,至少呈現(xiàn)7種空間構(gòu)象。結(jié)論安徽省外環(huán)境中存在的H9N2亞型AIVs具有感染哺乳動(dòng)物的分子特征并具備抗原漂移能力,需密切關(guān)注該病毒的分子變異特征。 

【文章來(lái)源】：中華疾病控制雜志. 2020年03期 北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

HA骨架結(jié)構(gòu)的空間構(gòu)象變化受因158～160氨基酸突變的影響

HA蛋白潛在糖基化位點(diǎn)中29～31、141～143、298～300、305～307和492～494均為穩(wěn)定存在的糖基化位點(diǎn),并且和以往H9N2亞型AIVs比,在313～315位置增加了一個(gè)糖基化位點(diǎn),此6個(gè)糖基化位點(diǎn)穩(wěn)定地存在于2015年以后安徽省分離的外環(huán)境毒株中。2015年以前外環(huán)境中分離的毒株中在145～147、206～208和218～220位置曾出現(xiàn)過(guò)糖基化位點(diǎn),但隨后分離的毒株中這3個(gè)糖基化位點(diǎn)均未再出現(xiàn),見表1。表1 2013年-2018年安徽省活禽市場(chǎng)外環(huán)境分離H9N2亞型禽流感毒株HA基因受體結(jié)合位點(diǎn)和糖基化位點(diǎn)分析Table 1 Analysis of receptor binding sites and potential glycosylation sites in the HA gene of H9N2 AIVs isolated from external environment of live poultry markets in Anhui Province from 2013 to 2018 毒株名稱 受體結(jié)合位點(diǎn)(H3 numbering) 潛在糖基化位點(diǎn)(H3 numbering)a 155 183 189 190 194 226 227 29 105 141 145 206 218 298 305 313 492 A/Environment/Anhui/08829/2013 T N T A L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/08826/2013 T N T A L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/09183/2014 T N T T L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/09184/2014 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/09185/2014 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/09189/2014 T N T T L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/09180/2014 T N T T L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/40246/2015 T N T A L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/40248/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/40249/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/38992/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/38981/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/38978/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/38977/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/01012/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/01010/2015 T N T T L L M + + + + + + + A/Environment/Anhui/01011/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/46666/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/42489/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/19202/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/19204/2015 T N T T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16914/2016 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16915/2016 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/17450/2017 T N T A L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16916/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16917/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16918/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/04468/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16920/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16921/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16922/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/04713/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Environment/Anhui/16924/2018 T N D T L L M + + + + + + A/Duck/Hong Kong/Y280/97 T N T T L L Q + + + + + + A/Chicken/Hong Kong/G9/97 T N T A L L Q + + + + + + A/Quail/Hong Kong/G1/97 T H T E L L Q + + + + + + + + A/Chicken/Shanghai/F/98 T N T A L Q Q + + + + + + A/Chicken/Beijing/1/94 T N T V L Q Q + + + + + + 注:aHA蛋白潛在糖基化位置分別為29～31、105～107、141～143、145～147、206～208、218～220、298～300、305～307、313～315和492～494;“+”存在糖基化位點(diǎn),空白表示無(wú)糖基化位點(diǎn)

安徽省外環(huán)境分離的H9N2亞型AIVs的HA蛋白有4個(gè)毗鄰受體結(jié)合位點(diǎn)的糖基化位點(diǎn)(105～107、145～147、206～208和218～220)在進(jìn)化的過(guò)程中均發(fā)生突變并消失,唯獨(dú)靠近Right edge的糖基化位點(diǎn)141～143仍存在;、HA的158～160位置為HA蛋白高突變位點(diǎn),安徽省33株外環(huán)境H9N2 AIVs位置存在7種三維構(gòu)象:DGN、DNA、NNA、NGE、NGN、NGD和NSD,其中有17株病毒為“NGD”構(gòu)象。見圖2、圖3。圖3 HA骨架結(jié)構(gòu)的空間構(gòu)象變化受因158～160氨基酸突變的影響

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]2009-2017年煙臺(tái)地區(qū)甲型（H1N1）pdm09流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因進(jìn)化分析[J]. 劉娟,高巧,徐迎春,孫振璐,董兆靜,徐小雯,宮連鳳.  中華疾病控制雜志. 2018(10)
[2]H9N2亞型禽流感病毒全基因組序列測(cè)定方法的建立[J]. 何軍,李曉丹,何蘭,俞俊嶺,蘇斌.  病毒學(xué)報(bào). 2018(01)



本文編號(hào)：2936308