RNAi工程微藻防控登革熱傳毒媒介伊蚊的研究
【學(xué)位單位】:海南醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R512.8;R184.3
【部分圖文】:
圖 1.2 HR3 蛋白保守區(qū)域多序列比對(duì)Figure. 1.2 Multi-sequence comparison of conserved region of HR3 protein利用 ProtParam 對(duì) HR3 核酸序列進(jìn)行分析(表 1.1),HR3 蛋白質(zhì)分子式為 C2341H3700N640O722S32,理論分子量為 53388.91,等電點(diǎn)為 5.66,半衰期為 30小時(shí),不穩(wěn)定參數(shù)為 50.99,為不穩(wěn)定蛋白。組成蛋白質(zhì)的氨基酸數(shù)量為 468,主要的氨基酸為:絲氨酸 Ser(41 個(gè),占 8.8%),亮氨酸 Leu(41 個(gè),占 8.8%),谷氨酸 Glu(32 個(gè),占 6.8%),纈氨酸 Val(29 個(gè),占 6.2%),天冬氨酸 Asp(29 個(gè),占 6.2%),谷氨酰胺 Gln(28 個(gè),占 6.0%),異亮氨酸 Ile(28 個(gè),占 6.0%),丙氨酸 Ala(26 個(gè),占 5.6%),蘇氨酸 Thr(26 個(gè),占 5.6%),精氨酸 Arg(26 個(gè),占 5.6%),賴氨酸 Lys(25 個(gè),占 5.3%),甘氨酸 Gly(22 個(gè),占 4.7%),甲硫氨酸 Met(21 個(gè),占 4.5%),苯丙氨酸 Phe(19 個(gè),占 4.1%),酪氨酸 Tyr(19 個(gè),占 4.1%),酪氨酸 Tyr(19 個(gè),占 4.1%),
圖 1.3 HR3 跨膜結(jié)構(gòu)域分析Figure. 1-3 Cross-membrane domain analysis of HR3(2)昆蟲(chóng) HR3 基因系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)HR3 基因系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),總結(jié)了 HR3 基因家族的進(jìn)化關(guān)系。從 GenBank 中搜索到 15 種相關(guān)昆蟲(chóng)的 HR3 序列,通過(guò) MEGA7 軟件構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(圖1.4.A)。從進(jìn)化樹(shù)中可以看出,埃及伊蚊 HR3 基因序列與白紋伊蚊及其相似,同源率達(dá)到 99%,其次是蠅屬,與玉帶鳳蝶的同源性最差,同源率只有 71%。利用在線工具 GSDS 繪制基因結(jié)構(gòu),如圖 1.4.B 所示,外顯子和內(nèi)含子分別用黃色矩形和細(xì)線表示,未翻譯的區(qū)域(UTRs)用藍(lán)色框表示,底部比例尺估計(jì)外顯子和內(nèi)含子的大小。HR3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域利用在線工具 Smart 和 Pfam 共同得出。不同的域用不同顏色的框表示,標(biāo)志在右下角,借助底部的比例尺可以明確蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和大。▓D 1.4.C)。
12圖 1.6 3HKT 蛋白保守區(qū)域Figure. 1.6 Multi-sequence comparison of 3H利用 ProtParam 對(duì) 3HKT 核酸序列進(jìn)行分式為 C1935H3039N519O554S25,理論分子量為 43230 小時(shí),不穩(wěn)定參數(shù)為 38.63,為不穩(wěn)定蛋白。主要的氨基酸為:亮氨酸 Leu(37 個(gè),占 9.5%)異亮氨酸 Ile(29 個(gè),占 7.5%),丙氨酸 Ala(24 個(gè),占 6.2%),脯氨酸 Pro(24 個(gè),占6.2%),纈氨酸 Val(24 個(gè),占 6.2%),精氨氨酸 Lys(19 個(gè),占 4.9%),天冬氨酸 Asp((17 個(gè),占 4.4%),天冬酰胺 Asn(15 個(gè),占
【相似文獻(xiàn)】
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