【摘要】：背景：乙型肝炎相關(guān)慢加急性肝衰竭(Hepatitis B-related Acute-on-chronic liver failure, HBV-ACLF)在亞太地區(qū)有很高的死亡率,但是它的發(fā)生發(fā)展機(jī)制尚不清楚。建立敏感且特異的生物標(biāo)志物,用于HBV-ACLF的早期診斷和疾病進(jìn)展預(yù)測(cè),對(duì)于確定哪些病人需要盡早地治療和接受肝移植手術(shù)非常重要。最近,已有研究報(bào)道將外周血中的微小RNA (miRNA)和信號(hào)蛋白作為很多疾病無(wú)創(chuàng)診斷的潛在生物標(biāo)志物,其中也包括一些肝臟疾病。材料和方法：在第一章中,我們用高通量測(cè)序技術(shù)研究來(lái)自HBV-ACLF組、慢性乙型肝炎(CHB)組和健康對(duì)照(Healthy)組的12例(每組4例)樣本外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)中的miRNA表達(dá)譜,從中尋找HBV-ACLF的全新miRNA標(biāo)志物。首先提取所有樣本的PBMC中的miRNA,用HiSeq 2000測(cè)序儀對(duì)其進(jìn)行深度測(cè)序；然后使用miRDeep2軟件從測(cè)序結(jié)果中分析已知miRNA的表達(dá)量并鑒定未知的全新miRNA,再用DESeq2分析在HBV-ACLF中表達(dá)失調(diào)的miRNA;最后,在另外的30例(每組10例)樣本中用基于TaqMan探針技術(shù)的實(shí)時(shí)定量PCR方法(qRT-PCR)來(lái)驗(yàn)證失調(diào)miRNA的表達(dá)量和確認(rèn)全新miRNA的表達(dá)情況。在第二章中,我們用含有274個(gè)人類(lèi)細(xì)胞因子蛋白抗體的芯片檢測(cè)來(lái)自HBV-ACLF組、CHB組和Healthy組的15例(每組5例)血清樣本中的信號(hào)蛋白表達(dá)情況,從中篩選全新的HBV-ACLF血清蛋白標(biāo)志物。用芯片顯著性分析(SAM)和芯片預(yù)測(cè)分析(PAM)兩種方法找出差異表達(dá)的蛋白,然后用酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定法(ELISA)在279例HBV-ACLF樣本、116例CHB樣本和20例健康樣本中驗(yàn)證顯著差異蛋白的表達(dá)量,再對(duì)各組樣本的驗(yàn)證結(jié)果進(jìn)行聚類(lèi)分析,找出能將HBV-ACLF樣本與CHB和Healthy樣本進(jìn)行正確區(qū)分的信號(hào)蛋白。此外,我們根據(jù)HBV-ACLF樣本的三個(gè)月死亡情況和驗(yàn)證結(jié)果中信號(hào)蛋白的表達(dá)水平,通過(guò)生物信息學(xué)分析找出與HBV-ACLF死亡率密切相關(guān)的信號(hào)蛋白,然后將另外136例HBV-ACLF樣本作為外部驗(yàn)證組,用于驗(yàn)證該信號(hào)蛋白預(yù)測(cè)HBV-ACLF死亡率的能力。結(jié)果：在第一章中,用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)HBV-ACLF組、CHB組和Healthy組的PBMC中miRNA表達(dá)譜進(jìn)行研究后,我們發(fā)現(xiàn)有1167個(gè)已知miRNA和107個(gè)全新miRNA至少在一個(gè)樣本中有表達(dá),其中,78個(gè)miRNA在HBV-ACLF病人中的表達(dá)水平與CHB病人和健康人中的相比有顯著差異。通過(guò)進(jìn)一步分析,我們找到了7個(gè)上調(diào)和1個(gè)下調(diào)的miRNA,它們?cè)贖BV-ACLF病人中的表達(dá)水平與CHB 和 Healthy組中的相比都有4倍以上的變化,同時(shí)它們?cè)贖BV-ACLF組中的測(cè)序讀長(zhǎng)片段(Read)數(shù)量高于該組的中位數(shù)。用qRT-PCR方法對(duì)這8個(gè)miRNA的表達(dá)量進(jìn)行驗(yàn)證后,發(fā)現(xiàn)其中6個(gè)miRNA (hsa-miR-21-5p, hsa-miR-34c-5p, hsa-miR-143-3p, hsa-miR-143-5p, hsa-miR-374a-3p和hsa-miR-542-3p)的表達(dá)量在HBV-ACLF病人中顯著升高,這個(gè)結(jié)果與高通量測(cè)序結(jié)果一致,但是另外兩個(gè)miRNA在HBV-ACLF病人中的表達(dá)水平與其他兩組相比沒(méi)有顯著變化。Gene Ontology (GO)通路分析顯示上述6個(gè)差異表達(dá)miRNA的靶基因主要參與了系統(tǒng)發(fā)育、信號(hào)調(diào)節(jié)、RNA代謝過(guò)程和基因表達(dá)等生物學(xué)過(guò)程。此外,我們用qRT-PCR方法對(duì)5個(gè)在測(cè)序結(jié)果中表達(dá)量最高的全新miRNA進(jìn)行檢測(cè),發(fā)現(xiàn)它們?cè)谌M樣本的PBMC中均有表達(dá),而且其中兩個(gè)在HBV-ACLF中的表達(dá)量顯著上升。在第二章中,細(xì)胞因子抗體芯片的初始篩選找到了在]HBV-ACLF病人中顯著差異表達(dá)的15個(gè)蛋白,這15個(gè)蛋白主要參與了細(xì)胞識(shí)別、炎癥、細(xì)胞粘附、血管生成和細(xì)胞調(diào)控等生物學(xué)過(guò)程。其中有6個(gè)蛋白(肝細(xì)胞生長(zhǎng)因子(HGF)、巨噬細(xì)胞炎癥蛋白3a (MIP-3a).癌胚抗原相關(guān)細(xì)胞黏附分子1 (CEACAM1)、生長(zhǎng)分化因子15(GDF15)、選擇蛋白E (E-selectin)和骨橋蛋白(Osteopontin))在]HBV-ACLF病人中的表達(dá)量遠(yuǎn)高于在CHB病人和健康人中的表達(dá)量。用ELISA方法在279例HBV-ACLF病人與116例CHB病人和20例健康人的血清樣本中對(duì)這6個(gè)蛋白的表達(dá)量進(jìn)行驗(yàn)證,驗(yàn)證結(jié)果與抗體芯片的結(jié)果基本一致。通過(guò)聚類(lèi)分析,發(fā)現(xiàn)僅用HGF和GDF15就可以將HBV-ACLF組樣本與CHB和Healthy組樣本正確區(qū)分開(kāi)。此外,我們發(fā)現(xiàn)在ELISA實(shí)驗(yàn)組中MIP-α與HBV-ACLF病人的死亡率密切相關(guān),外部驗(yàn)證組的結(jié)果也顯示MIP-3α可以用于預(yù)測(cè)HBV-ACLF病人的死亡率。同時(shí),免疫組化結(jié)果顯示HGF, GDF15和MIP-3α在HBV-ACLF來(lái)源的肝組織中表達(dá)為陽(yáng)性,而在CHB和Healthy來(lái)源的肝組織中表達(dá)為陰性。結(jié)論：HBV-ACLF病人PBMC中的miRNA表達(dá)譜和血清中的信號(hào)蛋白表達(dá)水平在該疾病的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中發(fā)生了明顯變化。6個(gè)在HBV-ACLF病人PBMC中高表達(dá)的miRNA可以作為全新生物標(biāo)志物用于反映疾病的發(fā)展進(jìn)程；在PBMC中還存在著很多全新miRNA,而且它們的表達(dá)水平也可能與HBV-ACLF相關(guān)。HGF和GDF15能夠作為HBV-ACLF全新的血清標(biāo)志物,用于該疾病的早期診斷；MIP-3α有潛力作為全新的血清預(yù)后標(biāo)志物用于預(yù)測(cè)HBV-ACLF的死亡率。
【學(xué)位授予單位】：浙江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類(lèi)號(hào)】：R512.62

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 Wen Chen;Ze-Hui Yan;Yu-Ming Wang;Bao-Yan Xu;Guo-Hong Deng;;Genome-wide microarray-based analysis of miRNAs expression in patients with acute-onchronic liver failure[J];Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International;2014年01期

2 Shubham Shrivastava;Anupam Mukherjee;Ratna B Ray;;Hepatitis C virus infection,microRNA and liver disease progression[J];World Journal of Hepatology;2013年09期

本文編號(hào)：2773565