多房棘球蚴抗原蛋白Emy162及TSP3的抗原表位的預(yù)測(cè)及鑒定
本文關(guān)鍵詞:多房棘球蚴抗原蛋白Emy162及TSP3的抗原表位的預(yù)測(cè)及鑒定,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的預(yù)測(cè)并鑒定分析多房棘球絳蟲(chóng)抗原蛋白Emy162及TSP3的B細(xì)胞和T細(xì)胞(Th1型、Th2型、Th17型)優(yōu)勢(shì)抗原表位,為后續(xù)抗多房棘球蚴多表位疫苗的研制奠定基礎(chǔ)。方法1.Genbank獲取Emy162、TSP3的氨基酸序列后通過(guò)生物信息學(xué)軟件SOPMA預(yù)測(cè)二級(jí)結(jié)構(gòu)特征,進(jìn)一步通過(guò)在線軟件IEDB、SYFPEITHI、Bcepred和ABCpred預(yù)測(cè)潛在的T細(xì)胞和B細(xì)胞表位。2.收集Emy162蛋白、TSP3蛋白、PBS分別免疫后的BALB/c小鼠得脾臟淋巴細(xì)胞,并用化學(xué)合成的抗原小肽進(jìn)行刺激共培養(yǎng)。通過(guò)脾臟淋巴細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)、培養(yǎng)上清與病人血清ELISA實(shí)驗(yàn),鑒定出具有良好免疫原性的B細(xì)胞抗原表位。3.人工合成的T細(xì)胞抗原小肽刺激Emy162蛋白、TSP3蛋白、PBS致敏小鼠脾臟淋巴細(xì)胞,通過(guò)ELISA、ELISpot、流式細(xì)胞術(shù)等方法檢測(cè)Th1、Th2、Th17型細(xì)胞因子的表達(dá),鑒定出具有良好免疫原性的Th1、Th2、Th17型細(xì)胞抗原表位。結(jié)果1.Emy16、TSP3蛋白均存在潛在優(yōu)勢(shì)抗原性表位存在。Emy162的8個(gè)潛在優(yōu)勢(shì)B細(xì)胞表位為E7-13、E19-27、E28-36、E37-48、E78-83、E101-109、E112-121、E129-139;Emy162的6個(gè)T細(xì)胞潛在優(yōu)勢(shì)抗原表位為E7-13、E36-41、E80-89、E87-96、E97-106、E129-139。TSP3的7個(gè)B細(xì)胞潛在優(yōu)勢(shì)抗原表位分別為T18-33、T45-55、T53-63、T64-75、T80-90、T92-104、T110-122;TSP3蛋白的8個(gè)T細(xì)胞表位是T33-42、T45-55、T53-63、T68-77、T80-90、T92-104、T110-122、T134-144。2.Emy162、TSP3蛋白各B抗原表位的抗原性不同。Emy162的3個(gè)優(yōu)勢(shì)B抗原表位為E19-27、E112-121、E129-139;TSP3的3個(gè)優(yōu)勢(shì)B抗原表位為T18-33、T45-55、T110-122。3.Emy162蛋白各T抗原表位可誘導(dǎo)不同細(xì)胞因子的表達(dá)。E7-13、E36-41、E80-89、E129-139為Emy162的Th1型優(yōu)勢(shì)抗原表位;E36-41、E87-96、E97-106為Emy162的Th2型優(yōu)勢(shì)抗原表位;E36-41、E87-96、E97-106為Emy162的Th17型優(yōu)勢(shì)抗原表位。4.TSP3蛋白各T抗原表位可誘生不同細(xì)胞因子的表達(dá)。TSP3的優(yōu)勢(shì)Th1型抗原表位為T33-42、T45-55、T80-90、T110-122;TSP3的Th2型優(yōu)勢(shì)抗原表位為T45-55、T68-77、T92-104;TSP3的Th17型優(yōu)勢(shì)抗原表位為T53-60、T80-90。結(jié)論1.Emy162及TSP3具有良好的抗原性,并存在潛在優(yōu)勢(shì)抗原表位。利用生物信息學(xué)的方法預(yù)測(cè)分析出了Emy162的8個(gè)B細(xì)胞表位和6個(gè)T細(xì)胞表位,預(yù)測(cè)分析出TSP3蛋白8個(gè)T細(xì)胞和7個(gè)B細(xì)胞表位。2.Emy162蛋白具有3個(gè)優(yōu)勢(shì)B細(xì)胞表位、4個(gè)Th1型優(yōu)勢(shì)抗原表位、3個(gè)Th2型優(yōu)勢(shì)抗原表位、3個(gè)Th17型優(yōu)勢(shì)抗原表位。3.TSP3蛋白具有3個(gè)優(yōu)勢(shì)B細(xì)胞表位、4個(gè)Th1型優(yōu)勢(shì)抗原表位、3個(gè)Th2型優(yōu)勢(shì)抗原表位、2個(gè)Th17型優(yōu)勢(shì)抗原表位。4.鑒定出的各優(yōu)勢(shì)抗原表位,為后續(xù)研制用于免疫預(yù)防接種、診斷、治療的高效多表位疫苗奠定了理論基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】:多房棘球蚴 生物信息學(xué) 抗原表位 B細(xì)胞表位 T細(xì)胞表位
【學(xué)位授予單位】:青海大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R532.32
【目錄】:
- 摘要4-6
- Abstract6-10
- 主要符號(hào)對(duì)照表10-11
- 第1章 引言11-14
- 第2章 多房棘球蚴抗原蛋白Emy162及TSP3的免疫優(yōu)勢(shì)表位的預(yù)測(cè)14-30
- 2.1 材料與方法14-15
- 2.1.1 獲取Emy162及TSP3蛋白的氨基酸序列14
- 2.1.2 Emy162及TSP3蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)特征預(yù)測(cè)14
- 2.1.3 預(yù)測(cè)Emy162及TSP3抗原蛋白的T細(xì)胞抗原表位14-15
- 2.1.4 預(yù)測(cè)Emy162及TSP3蛋白的B細(xì)胞抗原表位15
- 2.2 結(jié)果15-26
- 2.2.1 獲取Emy162及TSP3蛋白的氨基酸序列15-16
- 2.2.2 預(yù)測(cè)的Emy162及TSP3蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)16-17
- 2.2.3 預(yù)測(cè)所得Emy162及TSP3蛋白的T細(xì)胞抗原表位17-21
- 2.2.4 預(yù)測(cè)所得Emy162及TSP3抗原的B細(xì)胞表位21-26
- 2.3 討論26-28
- 2.4 結(jié)論28-30
- 第3章 多房棘球蚴抗原蛋白Emy162及TSP3的B細(xì)胞免疫優(yōu)勢(shì)表位的鑒定30-40
- 3.1 材料與方法30-33
- 3.1.1 材料30-32
- 3.1.1.1 抗原的獲得30
- 3.1.1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物30
- 3.1.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器30-31
- 3.1.1.4 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及試劑31
- 3.1.1.5 試劑配制31-32
- 3.1.2 方法32-33
- 3.1.2.1 小鼠的免疫32
- 3.1.2.2 小鼠脾臟淋巴細(xì)胞的分離[50]32
- 3.1.2.3 小鼠脾臟淋巴細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)32-33
- 3.1.2.4 抗原小肽與病人血清ELISA反應(yīng)33
- 3.2 結(jié)果33-36
- 3.2.1 Emy162的B細(xì)胞抗原小肽刺激后淋巴細(xì)胞增殖反應(yīng)的檢測(cè)33-34
- 3.2.2 TSP3的B細(xì)胞抗原小肽刺激后淋巴細(xì)胞增殖反應(yīng)的檢測(cè)34-35
- 3.2.3 Emy162的B細(xì)胞抗原小肽與病人血清ELISA反應(yīng)的檢測(cè)35-36
- 3.2.4 TSP3的B細(xì)胞抗原小肽與病人血清ELISA反應(yīng)的檢測(cè)36
- 3.3 討論36-38
- 3.4 結(jié)論38-40
- 第4章 多房棘球蚴抗原蛋白Emy162及TSP3的T細(xì)胞免疫優(yōu)勢(shì)表位的鑒定40-57
- 4.1 材料與方法40-45
- 4.1.1 材料40-42
- 4.1.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器40
- 4.1.1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物40
- 4.1.1.3 免疫物40-41
- 4.1.1.4 實(shí)驗(yàn)試劑41
- 4.1.1.5 試劑配制41-42
- 4.1.2 方法42-45
- 4.1.2.1 小鼠的免疫42
- 4.1.2.2 小鼠脾臟淋巴細(xì)胞的分離42-43
- 4.1.2.3 小鼠脾臟淋巴細(xì)胞的培養(yǎng)43
- 4.1.2.4 小鼠脾臟淋巴細(xì)胞因子ELISA檢測(cè)43-44
- 4.1.2.5 小鼠脾臟淋巴細(xì)胞因子ELISpot檢測(cè)44
- 4.1.2.6 小鼠脾臟淋巴細(xì)胞因子流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)44-45
- 4.2 結(jié)果45-53
- 4.2.1 Emy162的優(yōu)勢(shì)T抗原表位鑒定45-49
- 4.2.1.1 不同細(xì)胞因子ELISA檢測(cè)篩選T表位45-47
- 4.2.1.2 不同細(xì)胞因子ELISpot檢測(cè)篩選T表位47-48
- 4.2.1.3 流式細(xì)胞術(shù)對(duì)優(yōu)勢(shì)抗原表位的驗(yàn)證48-49
- 4.2.2 TSP3的優(yōu)勢(shì)T抗原表位鑒定49-53
- 4.2.2.1 不同細(xì)胞因子ELISA檢測(cè)鑒定T表位49-50
- 4.2.2.2 不同細(xì)胞因子ELISpot檢測(cè)篩選T表位50-52
- 4.2.2.3 流式細(xì)胞術(shù)對(duì)優(yōu)勢(shì)抗原表位的驗(yàn)證52-53
- 4.3 討論53-55
- 4.4 結(jié)論55-57
- 參考文獻(xiàn)57-64
- 全文總結(jié)64-66
- 創(chuàng)新點(diǎn)66-67
- 不足和展望67-68
- 致謝68-69
- 綜述69-83
- 參考文獻(xiàn)77-83
- 個(gè)人簡(jiǎn)歷83-84
【參考文獻(xiàn)】
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本文關(guān)鍵詞:多房棘球蚴抗原蛋白Emy162及TSP3的抗原表位的預(yù)測(cè)及鑒定,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):272854
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