西部地區(qū)鼠疫疫情趨勢分析及鼠疫桿菌F1抗原表位特征預測
發(fā)布時間:2019-11-16 00:07
【摘要】:我國西部,土地遼闊,人口眾多,是國家發(fā)展戰(zhàn)略中的核心地區(qū)。近年來,伴隨著經(jīng)濟改革開放的政策,西部地區(qū)廣泛開展建設,經(jīng)濟發(fā)展迅猛。但是,環(huán)境和生態(tài)的變化,人口流動的增加,特別是三峽庫區(qū)的修建和使用,給這些地區(qū)帶來了傳染病流行和暴發(fā)的威脅。目前,雖然西部的大部分地區(qū)還屬于鼠疫非疫區(qū)和非病區(qū),但是多種鼠疫疫源地穿越并包繞在這些地域。如果生態(tài)環(huán)境的變化引發(fā)了該地區(qū)鼠疫通道的快速擴展和延伸,將有可能呈現(xiàn)更為復雜的疫情表現(xiàn)特征,危害性難以估量。因此描述和分析近年來西部地區(qū)鼠疫疫源地的疫情趨勢及生態(tài)特征,研究鼠疫桿菌特殊抗原成分的分子結構將有利于豐富鼠疫流行病學的理論,掌握鼠疫疫情動態(tài),對及時、有效開展疫情控制,開展鼠疫的防治研究有著重要意義。 目的:系統(tǒng)分析評價我國近9年來有關西部地區(qū)鼠疫疫情、鼠疫疫源地特征及鼠疫監(jiān)測的文獻,以描述和了解該地區(qū)鼠疫疫源地發(fā)展趨勢;通過生物信息技術探索黃胸鼠疫源地鼠疫桿菌F1抗原免疫原性效應。 方法:①制定檢索策略,在PubMed、ScienceDirect、中文全文等數(shù)據(jù)庫與WHO、美國CDC等官方網(wǎng)站上檢索并納入2000年至今的相關文獻。采用定性系統(tǒng)分析方法嚴格評價納入文獻。系統(tǒng)分析2000-2008年西南地區(qū)鼠疫疫情趨勢,疫源地地理景觀特征,動物宿主及媒介特征。 ②對2003-2010年三峽庫區(qū)重慶段設定的24個鼠疫監(jiān)測點進行嚙齒動物和媒介動物采樣、鑒定。了解庫區(qū)與鼠疫相關的動物、媒介的種類和密度。 ③以云南地區(qū)黃胸鼠疫源地分離的鼠疫桿菌基因序列為目標,引入NCBI、 ProtParam tool、SOPMA、BLAST、PDB、PHYRE2、SignalP4.1Server等生物信息檢索及分析工具(含數(shù)據(jù)庫及模型),按照生物信息原理分析F1抗原的分子結構和抗原表位。 結果:①疫情趨勢的系統(tǒng)分析共納入14篇文獻,包括13篇原始研究,1篇綜述。 ②以云南、貴州和四川為觀察目的地西南地區(qū)被5種鼠疫疫源地穿越和包繞,鼠疫疫情在2000年達高峰,以后逐年下降,呈穩(wěn)定趨勢;四川地區(qū)疫源地有輕微活躍趨勢,但無病例報道;云南,貴州同屬黃胸鼠鼠疫自然疫源地,是目前我國最活躍的鼠疫自然疫源地;不同地區(qū)的同類疫源地在地理景觀和動物特征方面非常近似。 ⑨2003-2010年三峽庫區(qū)蓄水后,在重慶庫區(qū)8個縣(市)室內(nèi)平均鼠密度為1.61%,優(yōu)勢種為褐家鼠、小家鼠、四川短尾,
本文編號:2561554
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