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鮑曼不動(dòng)桿菌醫(yī)院感染流行病學(xué)調(diào)查及自然轉(zhuǎn)化感受態(tài)相關(guān)基因研究

發(fā)布時(shí)間:2019-11-14 01:16
【摘要】:目的:了解某院近年來(lái)鮑曼不動(dòng)桿菌的感染分布特點(diǎn)及耐藥性變遷,為臨床合理用藥提供科學(xué)依據(jù);研究鮑曼不動(dòng)桿菌自然轉(zhuǎn)化感受態(tài)相關(guān)基因的表達(dá)情況,有助于了解鮑曼不動(dòng)桿菌獲得外源DNA元件的機(jī)制,為控制多重耐藥菌感染提供新的治療思路。方法:回顧性分析某院2009年1月-2012年12月住院患者送檢標(biāo)本檢出的鮑曼不動(dòng)桿菌的科室分布、標(biāo)本來(lái)源及對(duì)常用抗菌藥物的耐藥性。利用鮑曼不動(dòng)桿菌ATCC17978與自然轉(zhuǎn)化研究的模式菌不動(dòng)桿菌屬菌BD413及嗜熱棲熱菌HB27的全基因組序列進(jìn)行比較基因組學(xué)研究,獲取鮑曼不動(dòng)桿菌可能的感受態(tài)相關(guān)基因。采用逆轉(zhuǎn)錄PCR方法和Real-timePCR方法,檢測(cè)鮑曼不動(dòng)桿菌感受態(tài)相關(guān)基因comB隨生長(zhǎng)期變化的表達(dá)特征,以及研究在不同刺激條件(如外源DNA、抗菌藥物以及鐵離子限制)下,鮑曼不動(dòng)桿菌感受態(tài)相關(guān)代表基因comB、comP、pilC、pilU、comM和comEA的表達(dá)情況。結(jié)果:共收集的1140株鮑曼不動(dòng)桿菌,主要感染科室為神經(jīng)科、ICU、老年科及呼吸內(nèi)科,檢出率分別為28.2%、23.6%、16.8%及9.8%;在痰液中檢出率最高,占94.9%;鮑曼不動(dòng)桿菌對(duì)阿米卡星耐藥率相對(duì)穩(wěn)定且仍然較低,為14.1%;對(duì)包括碳青霉烯類在內(nèi)的其余臨床常用抗菌藥物耐藥率2009-2011年明顯上升,2012年雖較2011年有所下降,但仍然較高。獲得了18個(gè)鮑曼不動(dòng)桿菌可能的感受態(tài)相關(guān)基因,包括菌毛合成相關(guān)基因A1S_3166(comE)、A1S_3167(comC)、A1S_3165(comF)、A1S_3168(comB)和A1S_3177(comP);Ⅳ型前菌毛蛋白多肽酶編碼基因A1S_0327(pilD)、A1S_0328(pilC)和A1S_0329(pilB);運(yùn)動(dòng)功能蛋白編碼基因:A1S_0896(pilU)和A1S_0897(pilT);外源DNA受體蛋白編碼基因A1S_0582(comEA);膜通道蛋白編碼基因A1S_2610(comEC)以及內(nèi)膜相關(guān)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白編碼基因A1S_3195(comM)、A1S_3004(pilN)和A1S_3193(pilO)等。鮑曼不動(dòng)桿菌感受態(tài)相關(guān)基因comB表達(dá)是一種生長(zhǎng)階段依耐型表達(dá)。外源DNA不能誘導(dǎo)感受態(tài)相關(guān)基因表達(dá)。在MMC刺激下,感受態(tài)相關(guān)基因表達(dá)明顯上調(diào);而在氯已定刺激下,鮑曼不動(dòng)桿菌感受態(tài)相關(guān)基因的表達(dá)情況,并沒有出現(xiàn)明顯差異。鐵離子限制條件下各種感受態(tài)相關(guān)基因都有上調(diào)表達(dá),但表達(dá)程度不如MMC刺激。結(jié)論:醫(yī)院分離的鮑曼不動(dòng)桿菌耐藥情況嚴(yán)重,呈逐年上升趨勢(shì);感染科室分布以神經(jīng)科和ICU為主;痰液中的分離率最高。應(yīng)重視對(duì)鮑曼不動(dòng)桿菌醫(yī)院感染及耐藥性的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè),根據(jù)藥敏結(jié)果合理選用抗菌藥物,以有效控制多重耐藥菌的爆發(fā)流行。鮑曼不動(dòng)桿菌中存在可能的感受態(tài)相關(guān)基因集合,而且這些基因呈生長(zhǎng)曲線依賴型表達(dá)。自然轉(zhuǎn)化由細(xì)菌自身的調(diào)控通路調(diào)控,與外源DNA的存在與否無(wú)關(guān)。DNA毒性抗菌藥物的刺激會(huì)誘導(dǎo)鮑曼不動(dòng)桿菌感受態(tài)相關(guān)基因的明顯表達(dá)增加,而其他物理殺菌劑,并不能誘導(dǎo)感受態(tài)相關(guān)基因表達(dá)。生長(zhǎng)環(huán)境營(yíng)養(yǎng)限制也會(huì)誘導(dǎo)鮑曼不動(dòng)桿菌自然轉(zhuǎn)化感受態(tài)相關(guān)基因的表達(dá)。
【圖文】:

生長(zhǎng)曲線,自然轉(zhuǎn)化,鮑曼不動(dòng)桿菌


圖 2-1 鮑曼不動(dòng)桿菌 ATCC17978 自然轉(zhuǎn)化調(diào)控圖Fig 2-1 Model of DNA translocation in acinetobacter baumannii ATCC17978首先細(xì)菌外膜蛋白識(shí)別外源 DNA 元件,在菌毛相關(guān)蛋白 ComE、ComB、ComF、ComP 的介導(dǎo)下,經(jīng)蛋白 PilU 和 PilT 的擺動(dòng)作用將外源 DNA 轉(zhuǎn)運(yùn)入細(xì)胞周質(zhì)中,然后胞膜蛋白受體 ComEA 與周質(zhì)中外源 DNA 結(jié)合并將其傳遞給相應(yīng)的核酸酶(未知),核酸酶將雙鏈 DNA 中的一條單鏈降解,同時(shí)另一條互補(bǔ)單鏈在內(nèi)膜蛋白 PilO、ComM 以及 PilN 共同作用下,通過膜通道蛋白 ComEC被轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞內(nèi),進(jìn)入胞內(nèi)的單鏈 DNA 與 DprA 蛋白結(jié)合從而避免被胞內(nèi)核酸酶降解,在 RecA 蛋白作用下與染色體基因進(jìn)行同源重組,,完成自然轉(zhuǎn)化過程。OM:細(xì)胞外膜;IM:細(xì)胞內(nèi)膜。2 鮑曼不動(dòng)桿菌生長(zhǎng)曲線比濁法測(cè)定鮑曼不動(dòng)桿菌生長(zhǎng)曲線,以培養(yǎng)時(shí)間為橫坐標(biāo)、細(xì)菌

鮑曼不動(dòng)桿菌,生長(zhǎng)曲線,感受態(tài),外源


我濫托捅澩錚!rowth-phase-dependent expression)(圖2-2),對(duì)數(shù)期表達(dá)明顯增加,在對(duì)數(shù)生長(zhǎng)后期達(dá)到最高,穩(wěn)定期表達(dá)基本保持不變,但即使達(dá)到平臺(tái)期,comB的相對(duì)表達(dá)量也不到sigma70的兩倍。4 感受態(tài)相關(guān)基因表達(dá)不受外源 DNA 的誘導(dǎo) 自然轉(zhuǎn)化在細(xì)菌中廣泛存在,整個(gè)過程受受體菌自身調(diào)控系統(tǒng)調(diào)控,而不受外源 DNA 存在的影響[28]。為了探討鮑曼不動(dòng)桿菌感受態(tài)相關(guān)基因的表達(dá)是否受外源 DNA 的誘導(dǎo),我們使用鮑曼不動(dòng)桿菌pET-RA 表達(dá)質(zhì)粒刺激對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期鮑曼不動(dòng)桿菌 ATCC17978,并利用DNA 溶劑 TBE 緩沖液作為對(duì)照刺激細(xì)菌。結(jié)果顯示,DNA 刺激后鮑曼不動(dòng)桿菌的感受態(tài)相關(guān)基因 comB、comP、pilC、pilU、comM 和comEA 的表達(dá),與 TBE 刺激的結(jié)果并無(wú)差異,見圖 2-3。
【學(xué)位授予單位】:瀘州醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R515

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