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結(jié)核分枝桿菌RD12區(qū)和RD5區(qū)特異性抗原的生物信息學(xué)分析及免疫原性初步評(píng)估

發(fā)布時(shí)間:2019-09-28 14:57
【摘要】:目的:中醫(yī)對(duì)結(jié)核病(Tuberculosis,TB)在唐朝就形成了“癆蟲”之說,1882年羅伯特·科赫發(fā)現(xiàn)了結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium Tuberculosis,MTB),證明了“癆蟲”即為MTB是TB的發(fā)病原因。為了進(jìn)一步發(fā)展中醫(yī)對(duì)TB的認(rèn)識(shí),我們采用現(xiàn)代技術(shù)和方法對(duì)MTB進(jìn)行深入研究;本論文采用生物信息學(xué)和免疫學(xué)對(duì)MTB的RD12和RD5區(qū)抗原進(jìn)行評(píng)估,從而為中西醫(yī)結(jié)合在肺癆方面的發(fā)展提供實(shí)驗(yàn)室研究依據(jù)。 方法:在NCBI數(shù)據(jù)庫上查詢并獲得各個(gè)抗原的氨基酸序列,用Blast分析其與MTB復(fù)合群及人類蛋白的同源性。利用SYFPEITHI、NETCTL、BIMAS和NetMHC數(shù)據(jù)庫預(yù)測并分析MTB的RD12區(qū)和RD5區(qū)抗原CD8+T細(xì)胞表位的分布情況;利用NetMHC數(shù)據(jù)庫預(yù)測并分析MTB的RD12區(qū)和RD5區(qū)抗原的CD4+T細(xì)胞表位的分布情況。然后,綜合CD4+T和CD8+T表位預(yù)測,篩選出優(yōu)勢表位肽段。用pET32a載體和pET28b載體分別與RD5區(qū)抗原Rv3117和RD12區(qū)抗原Rv2074構(gòu)建重組載體,用原核表達(dá)出結(jié)核特異性抗原,通過Ni-NTA柱純化蛋白,利用Triton X-114在4℃能與水混溶,而在37℃能與水形成水相與去污相的特點(diǎn),用相分離法去除Rv3117和Rv2074蛋白中的內(nèi)毒素,然后分別用顯色基質(zhì)鱟試劑法和BCA法測定目的蛋白的內(nèi)毒素含量和蛋白質(zhì)濃度。收集臨床結(jié)核病患者和健康對(duì)照者的血清,用ELISA檢測血清中抗結(jié)核特異性抗原Rv3117和抗Rv2074的體液免疫反應(yīng),篩選出特異性和敏感性較高的特異性優(yōu)勢抗原Rv3117。用純化并去除內(nèi)毒素的蛋白R(shí)v3117免疫C57BL/6小鼠,Westernblotting檢測小鼠血清中抗結(jié)核分枝桿菌Rv3117的IgG抗體;用酶聯(lián)免疫斑點(diǎn)試驗(yàn)檢測Rv3117誘導(dǎo)C57BL/6小鼠脾臟淋巴細(xì)胞產(chǎn)生特異性IFN-γ的斑點(diǎn)形成細(xì)胞數(shù)(SpotForming Cells, SFC);進(jìn)一步收集臨床活動(dòng)性結(jié)核患者和健康對(duì)照的全血,并分離外周血單個(gè)核細(xì)胞(Peripheral Blood Mononμclear Cell, PBMCs),,用ELISPOT試驗(yàn)檢測Rv3117分別刺激結(jié)核病患者和健康對(duì)照PBMCs產(chǎn)生特異性IFN-γ的SFC。 結(jié)果:通過預(yù)測與分析,并綜合CD4+T和CD8+T預(yù)測結(jié)果,初步篩選出MTB RD12區(qū)4個(gè)抗原的13個(gè)優(yōu)勢表位肽段;RD5區(qū)5個(gè)抗原的23個(gè)優(yōu)勢表位肽段。本文選擇結(jié)核分枝桿菌RD12區(qū)特異性抗原Rv2074和RD5區(qū)特異性抗原Rv3117以及公認(rèn)的具有較強(qiáng)免疫原性的抗原CFP-10和ESAT-6,分別對(duì)65例結(jié)核。═uberculosis, TB)患者的血清和59例健康對(duì)照患者的血清進(jìn)行抗結(jié)核抗體檢測,結(jié)果顯示RD5區(qū)抗原Rv3117能夠引起65例TB患者血清IgG水平提高,與59例健康對(duì)照者相比,具有顯著性差異(p0.05),并且其誘導(dǎo)產(chǎn)生IgG水平的敏感性/特異性(26.20%/98.30%)與CFP-10(24.60%/94.90%)、ESAT-6(24.60%/96.60%)相當(dāng);而RD12區(qū)抗原2074不能引起TB患者和健康對(duì)照者的顯著性差異(p0.05)。 酶聯(lián)免疫斑點(diǎn)試驗(yàn)結(jié)果顯示0.10μg/mL、1.00μg/mL和10.00μg/mL的Rv3117均能引起小鼠脾臟淋巴細(xì)胞產(chǎn)生較高水平的Rv3117抗原特異性IFN-γ,與對(duì)照組CFP-10免疫的小鼠脾臟淋巴細(xì)胞相比,二者具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(p0.05)。反之,不同濃度的CFP-10刺激CFP-10免疫的C57BL/6小鼠CFP-10抗原特異性T細(xì)胞產(chǎn)生釋放IFN-γ,而對(duì)Rv3117免疫的C57BL/6小鼠產(chǎn)生CFP-10抗原特異性的T細(xì)胞釋放IFN-γ無作用。 臨床病例標(biāo)本的實(shí)驗(yàn)顯示,用20.00μg/mL的Rv3117分別刺激TB病人和健康對(duì)照者的PBMCs,Rv3117在區(qū)分TB患者組和健康對(duì)照組PBMCs產(chǎn)生的抗原特異性IFN-γ水平之間無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.05)。采用不同濃度的Rv3117刺激TB患者(n=17)PBMCs釋放抗原特異性IFN-γ水平實(shí)驗(yàn)顯示,1.00~20.00μg/mL的重組Rv3117不能刺激TB患者產(chǎn)生IFN-γ(p0.05)。 結(jié)論:借助現(xiàn)代技術(shù)和方法對(duì)中醫(yī)關(guān)于結(jié)核病的“癆蟲”假說進(jìn)行深入探討是發(fā)展中醫(yī)進(jìn)一步認(rèn)識(shí)“癆病”和“癆蟲”本質(zhì)的必要手段。本課題采用生物信息學(xué)和免疫學(xué)對(duì)MTB的RD12和RD5區(qū)抗原進(jìn)行評(píng)估,初步評(píng)估出了結(jié)核特異性抗原Rv3117,雖然Rv3117不能作為抗結(jié)核診斷的免疫學(xué)指標(biāo),但其作為僅存在于MTB致病菌株H37Rv中的抗原,對(duì)其抗原免疫學(xué)功能的進(jìn)一步研究有助于結(jié)核新型疫苗的研究和抗結(jié)核藥物的開發(fā),并對(duì)探索結(jié)核的致病機(jī)制具有十分重要的意義,為中西醫(yī)結(jié)合預(yù)防、診斷及治療結(jié)核病提供研究依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】:河南中醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R52

【參考文獻(xiàn)】

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6 成詩明;;我國結(jié)核病研究概況[J];中國防癆雜志;2011年09期

7 馬s

本文編號(hào):2543382


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