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長(zhǎng)春市腎綜合征出血熱地理流行病學(xué)及病原基因序列分析

發(fā)布時(shí)間:2018-10-25 20:07
【摘要】:腎綜合征出血熱(HFRS)是鼠傳自然疫源性疾病,其分布廣、發(fā)病多、病死率高,疫區(qū)類型復(fù)雜,能夠嚴(yán)重危害人民群眾的身體健康和生命安全,是當(dāng)前重要的公共衛(wèi)生問題之一。在過去的十年間,我國(guó)HFRS的發(fā)病呈現(xiàn)下降的趨勢(shì),發(fā)病率從3.05/10萬下降到0.84/10萬(3倍),但部分地區(qū)首爾病毒型HFRS的比例出現(xiàn)顯著上升的趨勢(shì)。吉林省1955年報(bào)告首例HFRS病例,隨后的40年間,HFRS始終維持在較低的流行水平。然而,上世紀(jì)90年代末,HFRS的發(fā)病率出現(xiàn)明顯的增長(zhǎng),特別在省會(huì)城市長(zhǎng)春市。該病再次發(fā)生流行后,其時(shí)空分布特征、存在的危險(xiǎn)因素尚不清楚。因此,有必要探討不同流行階段、不同空間尺度上HFRS的分布特征,研究HFRS疫源地動(dòng)態(tài)變遷規(guī)律及其與環(huán)境和社會(huì)因素之間的關(guān)系,弄清HFRS高發(fā)區(qū)域,準(zhǔn)確預(yù)測(cè)、預(yù)報(bào)HFRS的流行范圍和強(qiáng)度,這對(duì)預(yù)防和控制HFRS具有重要意義。 目的:分析長(zhǎng)春市HFRS不同流行階段時(shí)空分布特點(diǎn)、疫區(qū)變化趨勢(shì)及流行特征。進(jìn)一步研究環(huán)境和社會(huì)因素等對(duì)HFRS流行動(dòng)態(tài)的影響;建立長(zhǎng)春市HTNV、SEOV宿主動(dòng)物的生態(tài)位模型,繪制感染風(fēng)險(xiǎn)分布的預(yù)測(cè)圖;從基因水平上分析長(zhǎng)春市HV病毒的核苷酸序列特征及其進(jìn)化關(guān)系、HV亞型分布及與其他毒株的基因同源性,為防控策略的制定提供科學(xué)依據(jù)。 方法:①收集1988-2012年縣區(qū)級(jí)的HFRS病例數(shù)據(jù),根據(jù)其季節(jié)性分布的變化劃分兩個(gè)階段對(duì)HFRS的流行病學(xué)特征進(jìn)行分析;在鄉(xiāng)鎮(zhèn)尺度上,建立2004-2012年分年度平均發(fā)病率地圖,使用地理信息系統(tǒng)(ArcGIS)將HFRS個(gè)案數(shù)據(jù)和鼠情數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián),制作長(zhǎng)春市人間疫情數(shù)據(jù)和鼠情監(jiān)測(cè)空間分布地圖,動(dòng)態(tài)顯示和分析長(zhǎng)春市HFRS的空間分布特征;②使用STATA軟件,應(yīng)用Possion回歸分析方法在縣區(qū)尺度上分別探討HFRS不同流行階段空間分布、時(shí)間動(dòng)態(tài)分布,與人口密度、海拔、土地利用類型、氣象和畜牧業(yè)的關(guān)系,同時(shí)考慮到HFRS影響因素可能存在的空間尺度效應(yīng),進(jìn)一步在鄉(xiāng)鎮(zhèn)尺度上對(duì)影響其空間分布的環(huán)境和社會(huì)因素進(jìn)行了分析。對(duì)單因素分析中P值0.1的變量作為協(xié)變量納入多因素分析,進(jìn)一步確定影響長(zhǎng)春市HFRS發(fā)病時(shí)空異質(zhì)性的主要環(huán)境與社會(huì)因素;③使用最大熵方法,利用89個(gè)監(jiān)測(cè)點(diǎn)中捕獲染疫動(dòng)物的陽性標(biāo)本采樣點(diǎn)來構(gòu)建長(zhǎng)春市HV宿主動(dòng)物生態(tài)位模型,預(yù)測(cè)HFRS感染發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)分布,探索不同型別HV病毒的分布與環(huán)境相關(guān)變量之間的關(guān)系;④采用免疫熒光法對(duì)鼠肺標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),陽性鼠肺進(jìn)行核酸提取、RT-PCR擴(kuò)增、測(cè)序,并進(jìn)行同源性分析和系統(tǒng)發(fā)生樹研究。 結(jié)果:①1988-2012年以縣區(qū)為單位分析結(jié)果顯示,10個(gè)縣(市)區(qū)的年發(fā)病率不同,位于長(zhǎng)春東南部的雙陽發(fā)病數(shù)最高(1525例,占所有病例的35.9%),但是其人口數(shù)只占總?cè)丝诘?.6%。根據(jù)HFRS發(fā)病的季節(jié)性特征,確定了兩個(gè)流行階段。第一階段為1988-1997年,發(fā)病呈單峰型;第二階段為1998-2012年,呈春、秋冬兩個(gè)發(fā)病高峰。HFRS發(fā)病率男性高于女性,患者主要為農(nóng)民。從2004-2012年鄉(xiāng)鎮(zhèn)尺度分析結(jié)果可以看出,2004-2007年長(zhǎng)春市HFRS呈現(xiàn)逐年下降趨勢(shì),自2008年開始進(jìn)入發(fā)病平臺(tái)期。該市119個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)有病例報(bào)告,不同鄉(xiāng)鎮(zhèn)(社區(qū))報(bào)告發(fā)病率的差異較大。其中13個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)年累積發(fā)病率超過100/10萬;②1988-2012年泊松回歸分析結(jié)果表明,在縣區(qū)尺度上,HFRS發(fā)病的時(shí)間動(dòng)態(tài)及空間分布異質(zhì)性均與畜牧業(yè)之間有顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,特別是與鹿飼養(yǎng)業(yè)明顯相關(guān)(P0.001)。利用2004-2012年HFRS鄉(xiāng)鎮(zhèn)尺度的發(fā)病數(shù)據(jù)進(jìn)行泊松回歸分析研究發(fā)現(xiàn),人口密度、水田、稻田、灌木林、y|土地是HFRS發(fā)病的相關(guān)因素。其中,水田(IRR=1.23,P=0.003)、稻田(IRR=1.15,P=0.031)與HFRS發(fā)病呈正相關(guān),發(fā)病率隨著其面積的增加而增長(zhǎng);而人口密度(IRR=0.99,P0.001),灌木林(IRR=0.22,P0.001)和裸土地(IRR=0.25,P0.001)與HFRS發(fā)病呈負(fù)相關(guān),隨著其面積或密度的增加而發(fā)病率降低;③嚙齒類動(dòng)物的生態(tài)位模型顯示,土地利用、降水量、相對(duì)濕度、溫度、植被指數(shù)、海拔與嚙齒類動(dòng)物分布存在相關(guān)性。其中,相對(duì)濕度(30.8%)、土地利用(29.7%)對(duì)野鼠型疫區(qū)貢獻(xiàn)最大,溫度(23.5%)次之;而土地利用對(duì)家鼠型疫區(qū)貢獻(xiàn)最大,其次為降水量。HTNV、SEOV建模ROC曲線顯示,AUC平均值分別為0.897、0.846,說明總體預(yù)測(cè)效果較好。宿主動(dòng)物的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)分布圖提示,感染HTNV風(fēng)險(xiǎn)最高的地區(qū)主要分布在雙陽區(qū)和榆樹市,而感染SEOV的高風(fēng)險(xiǎn)區(qū)域分布范圍較廣,主要集中在雙陽區(qū)、榆樹市和市轄區(qū),而九臺(tái)市、德惠市感染風(fēng)險(xiǎn)次之;④2010-2012年在該市共捕獲1246只嚙齒類動(dòng)物,IFA檢測(cè)到17份鼠肺標(biāo)本陽性,均為SEOV型。從分離到HV病毒的雙陽、榆樹、農(nóng)安、德惠4個(gè)縣(市)區(qū)各選取1份鼠肺標(biāo)本進(jìn)行基因序列分析發(fā)現(xiàn),S、M基因片段與SEOV型其他病毒核苷酸序列比對(duì),同源性均在95%以上,氨基酸序列同源性在99%以上,說明該地區(qū)發(fā)現(xiàn)的這4株SEOV型病毒未出現(xiàn)較大變異。S基因片段氨基酸序列位點(diǎn)位于231~294之間,分析發(fā)現(xiàn)該區(qū)段在SEOV型病毒之間同源性高,不同型別HV病毒序列間差異性大于45%,符合多變區(qū)域的特點(diǎn)。S、M基因片段序列系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),4株SEOV型病毒均為S3亞型,與已報(bào)道的吉林省內(nèi)雙陽、白城、公主嶺等地區(qū)分離的SEOV型病毒親緣關(guān)系接近。 結(jié)論:①長(zhǎng)春市HFRS發(fā)病自1998年開始明顯上升,同時(shí)伴有季節(jié)性特征的改變,其發(fā)病高峰由每年年末的單峰型轉(zhuǎn)變?yōu)橐源、秋冬發(fā)病為主的雙峰型,提示長(zhǎng)春市HFRS的再次流行與過去25年間季節(jié)發(fā)病模式的變化有關(guān);②長(zhǎng)春市HFRS發(fā)病率的增長(zhǎng)、時(shí)空分布特征與畜牧養(yǎng)殖業(yè)、氣候因素和土地利用類型顯著相關(guān),尤其是鹿類養(yǎng)殖。預(yù)防控制措施的重點(diǎn)應(yīng)放在畜牧業(yè)養(yǎng)殖的相關(guān)地區(qū);③生態(tài)位模型分析結(jié)果顯示,土地利用為影響HV宿主動(dòng)物生存生境的主要因素,而相對(duì)濕度、降水量分別為HTNV、SEOV宿主動(dòng)物的次要影響因素。風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)分布圖提示,雙陽區(qū)、榆樹市為混合型疫區(qū),,是HTNV、SEOV兩種病毒感染發(fā)病的高危區(qū)域,而其他地區(qū)主要為SEOV病毒;④目前長(zhǎng)春市HFRS疫區(qū)是以家鼠型為主的混合型疫區(qū),本研究檢測(cè)到的HV病毒均為SEOV的S3亞型,其S片段、M片段的核苷酸、氨基酸同源性均較高,未發(fā)現(xiàn)較大變異。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R512.8

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2294706


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