【摘要】:適應(yīng)性免疫應(yīng)答是宿主控制病毒感染的重要手段。作為抗原加工和呈遞的中樞—人類白細(xì)胞抗原(human leucocyte antigen, HLA)系統(tǒng),在對(duì)特定病毒的有效應(yīng)答中起著核心作用。病毒感染和清除是機(jī)體抗原呈遞通路聯(lián)合作用的結(jié)果。目前研究認(rèn)為:HLAI類抗原呈遞通路中參與抗原肽產(chǎn)生,轉(zhuǎn)運(yùn)和呈遞的基因可能存在共同進(jìn)化,共同進(jìn)化將有助于細(xì)胞因子對(duì)這些基因的調(diào)控,更好的進(jìn)行抗原呈遞。已有研究表明低分子量多肽(low molecular weight protein, LMP)基因和HLA-G基因14bp插入/缺失的多態(tài)性與一系列的感染性疾病的發(fā)生、發(fā)展有著密切的關(guān)聯(lián)。近年來(lái),國(guó)內(nèi)外一些研究報(bào)道了IMP基因與丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus, HCV)感染的關(guān)聯(lián)研究,但是由于種族和人群的差異,結(jié)果并不完全一致。因此,對(duì)不同民族、不同樣本的研究顯得非常重要。 本研究以云南地區(qū)HCV感染者232名,正常健康對(duì)照362名作為研究對(duì)象,進(jìn)行第一分部分實(shí)驗(yàn)研究;以云南地區(qū)HCV感染者243名,正常健康對(duì)照448名作為研究對(duì)象,進(jìn)行第二部分實(shí)驗(yàn)研究。第一部分為L(zhǎng)MP因與HCV感染的關(guān)聯(lián)研究:采用聚合酶鏈反應(yīng)直接測(cè)序(Polymerase chain reaction-sequence based typing, PCR-SBT)方法對(duì)云南漢族正常人群及HCV感染者LMP因進(jìn)行分型,進(jìn)行HCV感染的關(guān)聯(lián)分析。第二部分為HLA-G因14bp插入/缺失多態(tài)與HCV感染的關(guān)聯(lián)研究:采用序列特異引物引導(dǎo)的PCR反應(yīng)(Polymerase chain reaction-sequence specific primer, PCR-SSP)的方法檢測(cè)云南漢族正常人群及HCV感染者HLA-G因第八外顯子3’UTR的一個(gè)14bp插入/缺失多態(tài)位點(diǎn)分布,進(jìn)行HCV感染的關(guān)聯(lián)分析。 結(jié)果:(1)對(duì)照組和HCV病例組LMP基因6個(gè)位點(diǎn)和HLA-G基因14bp插入/缺失的多態(tài)性位點(diǎn)等位基因的頻率分布均符合HWE平衡,人群具有代表性。(2)共檢測(cè)出LMP基因的6個(gè)多態(tài)性位點(diǎn):rs17587、rs2071477、rs2071476、rs2071542、rs2071543、rs6924102,對(duì)照組中頻率為:rs17587的A和G等位基因頻率分別為0.210和0.790,rs2071477的C和T等位基因頻率分別為0.386和0.614,rs2071476的A和G等位基因頻率分別為0.620和0.380;rs2071542的C和T等位基因頻率分別為0.066和0.934,rs2071543的A和C等位基因頻率分別為0.151和0.849,rs6924102的C和T等位基因頻率分別為0.416和0.584。病例組中頻率為:rs17587的A和G等位基因頻率分別為0.258和0.742,rs2071477的C和T等位基因頻率分別為0.440和0.560,rs2071476的A和G等位基因頻率分別為0.545和0.455;rs2071542的C和T等位基因頻率分別為0.103和0.897,rs2071543的A和C等位基因頻率分別為0.147和0.853,rs6924102的C和T等位基因頻率分別為0.456和0.544。(3)構(gòu)建了LMP2基因SNP位點(diǎn)rs17587,rs2071477,rs2071476的單倍型:ACG與GTA,對(duì)照組中頻率分別為0.204和0.610;病例組中頻率分別為0.255和0.543。構(gòu)建了LMP7基因SNP rs2071542,rs2071543,rs6924102的單倍型:CCT與TCT,對(duì)照組的頻率分別為0.066和0.511;病例組的頻率分別為0.097和0.437。(4)病例對(duì)照關(guān)聯(lián)研究表明:對(duì)照組與HCV感染組中LMP基因位點(diǎn)re2071476和6924102的基因型頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P值分別為0.031和0.010,OR值分別為0.733和1.180)。rs2071476和re2071542等位基因頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P值分別為0.010和0.022,OR值分別為0.733和1.625)。單倍型ACG和GTA在兩組人群中差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),表明具有單倍型ACG的個(gè)體較之不含該單倍型的個(gè)體對(duì)于HCV感染能夠增加其患病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.347,95%CI:1.020~1.779);具有單倍型GTA的個(gè)體較之不含該單倍型的個(gè)體對(duì)于HCV感染能夠降低其患病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.760,95%CI0.598~0.965)。單倍型CCT和TCT在兩組人群中差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P值分別為0.047和0.020,表明具有單倍型CCT的個(gè)體較之不含該單倍型的個(gè)體對(duì)于HCV感染能夠增加其患病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.537,95%CI:1.004~2.353);具有單倍型TCT的個(gè)體較之不含該單倍型的個(gè)體對(duì)于HCV感染能夠降低其患病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.755,95%CI:0.596-0.957)。(5)HLA-G基因14bp插入/缺失等位基因頻率在對(duì)照組中為0.335和0.665;在HCV感染組中為0.348和0.652。無(wú)論是基因型頻率,還是等位基因頻率在HCV感染組和對(duì)照組中差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 結(jié)論:LMP2/LMP7基因的多態(tài)性與HCV感染有顯著的易感關(guān)聯(lián)。而HLA-G基因14bp插入/缺失多態(tài)性與HCV感染未見易感關(guān)聯(lián)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R512.63
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):
2281011
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