2011-2012年廣州市哨點(diǎn)醫(yī)院病毒性腹瀉的流行病學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2018-06-26 04:48
本文選題:病毒性腹瀉 + 輪狀病毒 ; 參考:《南方醫(yī)科大學(xué)》2013年碩士論文
【摘要】:研究背景: 病毒性胃腸炎是世界各國高發(fā)疾病之一,尤其在發(fā)展中國家因胃腸炎疾病死亡的兒童人數(shù)高于相應(yīng)的發(fā)達(dá)國家。隨著檢測技術(shù)的不斷發(fā)展和腹瀉研究的深入,病毒性腹瀉在急性非細(xì)菌性腹瀉中顯得越來越重要,占60%。引起嬰幼兒腹瀉的常見病原體以輪狀病毒(Rotavirus, RV)為主,之后相繼發(fā)現(xiàn)諾如病毒(Norovirus, NoV)、扎幌病毒(Sapovirus, SaV)、腸道腺病毒(denoviruses, AdV)和星狀病毒(Astroviru,AstV)也是引起急性腹瀉的主要病因。 據(jù)統(tǒng)計(jì),在世界范圍內(nèi)由A組輪狀病毒起因的腹瀉每年大約有1.11億,其感染對(duì)象主要為5歲以下兒童,在我國每年約有1-2萬名5歲內(nèi)兒童死于輪狀病毒腹瀉。杯狀病毒在世界范圍內(nèi)流行僅次于輪狀病毒,這與水源性和食源性胃腸炎的暴發(fā)和散發(fā)有著密切的關(guān)系,其自身毒性較弱,且發(fā)病過程具有自限性,但傳染性較強(qiáng),如不能及時(shí)治療可導(dǎo)致患者死亡。腸道腺病毒引起的腹瀉呈全球分布,多以區(qū)域性流行為主,少見暴發(fā)流行報(bào)道。由腸道腺病毒引起的腹瀉全年均可發(fā)生,部分地區(qū)有季節(jié)性升高現(xiàn)象,以秋冬季常見,Ad41型為流行優(yōu)勢株,部分地區(qū)以Ad40為主,也可見非腸道腺病毒引起的腹瀉報(bào)道。星狀病毒感染在世界范圍內(nèi)廣泛存在,易感人群以2歲兒童為主,在患兒腹瀉糞便中檢出率為0.6%~26%,其既可引起醫(yī)源性感染和散發(fā)流行,也有暴發(fā)報(bào)道,有研究報(bào)道它也是成人腹瀉散發(fā)流行的病原體之一。 國內(nèi)外近幾年對(duì)病毒性腹瀉的流行病學(xué)研究已廣泛開展,但多數(shù)研究主要針對(duì)常住人群5歲內(nèi)兒童進(jìn)行研究,針對(duì)成人和城鄉(xiāng)結(jié)合部人群腹瀉的報(bào)道較少。伴隨改革開放急促的步伐,經(jīng)濟(jì)、醫(yī)療衛(wèi)生行業(yè)也在迅猛發(fā)展,但農(nóng)村、城鄉(xiāng)結(jié)合部等經(jīng)濟(jì)條件卻相對(duì)落后,由于人員構(gòu)成復(fù)雜流動(dòng)性大、知識(shí)水平低、經(jīng)濟(jì)條件差等問題,整體上影響了城市流動(dòng)人口的衛(wèi)生保健服務(wù)狀況,腹瀉病的發(fā)病率不容樂觀,所以本研究前瞻性地收集兩家哨點(diǎn)醫(yī)院(其一為城區(qū)人群,其二為城鄉(xiāng)結(jié)合部人群)2011年6月至2012年5月的兒童腹瀉患者和18歲以上成人腹瀉標(biāo)本進(jìn)行相關(guān)病毒研究,以便系統(tǒng)的掌握廣州市5歲以下兒童和18歲以上成人病毒性腹瀉的流行特征和流行優(yōu)勢株的變化,為以后制定病毒性腹瀉的預(yù)防控制策略提供科學(xué)依據(jù),也為將來研制開發(fā)病毒疫苗提供全面系統(tǒng)的背景資料。 研究目的: 1.了解廣州市哨點(diǎn)醫(yī)院2011年6月~2012年5月5歲內(nèi)兒童和18歲以上成人散發(fā)病毒性腹瀉中RV、NoV、AdV、AstV和SaV感染狀況及流行病學(xué)特征,完善我國病毒性腹瀉的流行病學(xué)基礎(chǔ)資料; 2.了解該地區(qū)5歲內(nèi)兒童和18歲以上成人病毒性腹瀉中NoV、AdV、AstV和SaV基因型別,探討4種病毒的流行優(yōu)勢毒株,明確各病毒分子特征及基因型分布情況; 3.為廣州地區(qū)兒童和成人病毒感染性腹瀉的研究提供豐富的背景資料。 研究方法: 1.標(biāo)本收集: 收集2011年6月~2012年5月期間在廣州市白云區(qū)某社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)中心和南方醫(yī)院第三附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科就診的年齡在5歲以下的360例患兒標(biāo)本和年齡在18歲以上的127例成人腹瀉患者糞便標(biāo)本、人口學(xué)資料及流行病學(xué)資料。 2.標(biāo)本處理方法: 每份糞便標(biāo)本取5~10g或5~10ml,加入PBS,震蕩后制成10%的懸液,分裝三管后-80℃保存?zhèn)溆谩?3.標(biāo)本病毒檢測方法: 使用A群輪狀病毒膠體金法檢測糞便中的輪狀病毒后對(duì)符合要求的標(biāo)本進(jìn)行核酸提取,用引物JV12Y/JV13I、Ad1/Ad2、Mon269/Mon270和SLV5317/SLV5749分別檢測NoV、AdV、AstV和SaV,對(duì)純化后的PCR陽性產(chǎn)物進(jìn)行測序,測序結(jié)果應(yīng)用BLAST在GenBank上尋找各陽性株的同源序列,應(yīng)用Clustal W進(jìn)行多序列對(duì)比分析和MEGA5.0構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹,分析NoV、 SaV、AdV和AstV的基因型別,判斷NoV、AdV、AstV和SaV的流行優(yōu)勢毒株。 4.統(tǒng)計(jì)分析方法:數(shù)據(jù)管理采用Epidata2.1進(jìn)行雙份錄入,運(yùn)用統(tǒng)計(jì)軟件SPSS13.0對(duì)收集的患者資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,分析廣州地區(qū)病毒性腹瀉的流行病學(xué)特征,檢驗(yàn)水準(zhǔn)α為0.05。 結(jié)果: 1.2011年6月-2012年5月共收集廣州市兩家哨點(diǎn)醫(yī)院5歲內(nèi)患兒糞便標(biāo)本和問卷共360份;純褐饕O(jiān)護(hù)人文化程度以大專及以上最多53.0%(188/355),職業(yè)以在家及待業(yè)為主20.2%(71/351)。 2.共收集18歲以上符合要求的成人腹瀉患者糞便127份,成人患者中平均年齡為(41.91±17.92);颊呶幕潭纫源髮<耙陨险甲疃,為50.4%(64/127),文盲最少為0.8%(1/127),職業(yè)以辦公室白領(lǐng)占最多,為25.2%(32/127)。 3.五歲內(nèi)兒童RV、NoV、AdV、SaV、AstV的檢出率分別為30%(108/360)、8.9%(32/360)、7.5%(27/360)、1.7%(6/360)、2.5%(9/360),以輪狀病毒檢出最高。混合感染占5%(18/360),以輪狀病毒混合感染為主。五種病毒檢出者主要集中在3歲內(nèi)兒童,輪狀病毒集中發(fā)病季節(jié)主要集中在9-11月,以10月高發(fā),札幌病毒以11月到12月為發(fā)病高峰,星狀病毒僅在10-12月有檢出,這三種病毒散發(fā)主要集中在秋冬季,而諾如病毒發(fā)病高峰以6月最為集中,腺病毒的發(fā)病高峰在2011年以9月最高,2012年2月最高。 4.成人患者五種病毒的檢出率以諾如病毒檢測率最高,為8.7%(11/127),其次是輪狀病毒5.5%(7/127),腺病毒2.4%(3/127),札如病毒2.4%(3/127),星狀病毒0.8%(1/127)。未見混合感染。病毒感染主要集中在60歲以上這個(gè)年齡組中占25%(7/28)。發(fā)病季節(jié)顯示:輪狀病毒的流行期為12月-次年2月份,諾如病毒的發(fā)病高峰在9月和12月,腺病毒、札幌病毒和星狀病毒檢出例數(shù)較少,還不能顯示季節(jié)分布特點(diǎn)。 5.序列分析結(jié)果:360份兒童糞便標(biāo)本中檢出諾如病毒感染32株,測序分析,26株屬于GⅡ-4型,其中3株屬于GⅡ-4-2006a。3株屬于GⅡ-13型,1株為GⅡ-5,2株GⅡ-6。檢出6株SaV,6株為都為GI型,其中4株為GI-1型,2株屬于GI-2;檢出AdV27例,其中Ad-41型18例,9例非腸道腺病毒中檢出2份Ad1型,2份Ad2型,1份Ad7型,2份Ad12型,2份Ad31型;而檢出9株AstV均為HAstV-1。 6.127份成人腹瀉標(biāo)本中檢出諾如病毒11株,其中8株屬于GⅡ-4,1株GⅡ-b,1株GⅡ-6,1株GI-1。腺病毒檢出3例均為Ad41,星狀病毒1例陽性為HAst-1;札幌病毒陽性2例屬于GⅠ-2,1例屬于GⅣ。 結(jié)論: 1、病毒性腹瀉是引起嬰幼兒和成人腹瀉的重要病原,其中兒童以輪狀病毒為主,成人以諾如病毒為主,3歲以內(nèi)兒童和60歲以上老年人為感染高發(fā)人群,不同病毒引起的季節(jié)性高峰有所不同,故應(yīng)開展長期、連續(xù)的的疾病監(jiān)測和病原學(xué)檢測; 2、NoV GII-4型是引起廣州市哨點(diǎn)醫(yī)院5歲內(nèi)兒童和18歲以上成人散發(fā)腹瀉的流行優(yōu)勢株,其中3株屬于GⅡ-4-2006a,而在我國很多地區(qū)均已檢測到2006b,對(duì)2006a檢出報(bào)道較少;AdV引起腹瀉的流行優(yōu)勢株為Ad41,同時(shí)也檢出了其他多個(gè)非腸道腺病毒的基因型別,但未檢出Ad40型,表明Ad41是廣州地區(qū)流行優(yōu)勢株,與國內(nèi)外AdV血清型變化趨勢相符;AstV在兒童和成人腹瀉中的流行優(yōu)勢株均為AstV-1,與我國國內(nèi)情況相同;兒童SaV以GI-1為主,而成人以GI-2型為主。四種病毒的感染基因型別多樣,應(yīng)引起重視。
[Abstract]:Background of Study :
Viral gastroenteritis is one of the most common diseases among countries in the world , especially in developing countries . With the development of detection technology and the study of diarrhea , viral diarrhea is more and more important in acute non - bacterial diarrhea , which accounts for 60 % . The common pathogens causing diarrhea in infants are rotavirus ( RV ) , and then novirus ( NoV ) , Sapporo virus ( SaV ) , intestinal adenovirus ( AdV ) , and astroviru are the main causes of acute diarrhea .
According to statistics , diarrhea caused by rotavirus in group A in the world is about 110 million each year , and its infection target is mainly children under 5 years old . The disease has a close relationship with the outbreak and distribution of water source and food - borne gastroenteritis .
In recent years , the epidemiological study of viral diarrhea has been widely carried out , but most of the researches are mainly aimed at the study of children in the five - year - old people who live in the urban and rural areas . In view of the rapid development of the reform and opening - up , the economy and the medical and health industry are relatively backward .
Purpose of study :
1 . To understand the prevalence and epidemiological characteristics of RV , NoV , AdV , V and SaV infection among children and adults aged 18 and over from June 2011 to May 2012 in Guangzhou sentry duty hospital , and to improve the epidemiological basic data of viral diarrhea in China ;
2 . To understand the genotypes of NoV , AdV , V and SaV in children aged 5 years and over 18 years of age in the region , and to explore the prevalent virulent strains of four viruses , identify the molecular characteristics and genotype distribution of each virus ;
3 . Provide rich background information for the study of infectious diarrhea in children and adults in Guangzhou area .
Study method :
1 . Specimen Collection :
Data collected from 360 children under the age of 5 were collected from 360 children under the age of 5 and 127 adult diarrhea patients aged below 18 years from June 2011 to May 2012 in Baiyun District , Guangzhou .
2 . Sample processing method :
taking 5 - 10g or 5 - 10ml of each stool specimen , adding PBS , shaking , and making into 10 % suspension , and storing the three tubes at -80 & deg ; C for later use .
3 . Sample virus detection method :
A group of primers JV12Y / JV13I , Ad1 / Ad2 , Mon269 / Mon270 and SLV5317 / SLV5749 were used to detect the homologous sequences of NoV , AdV , V and SaV .
4 . Statistical analysis method : The data management adopts Epidata2 . 1 for double entry , and the statistical software SPSS 13.0 is used to analyze the collected patient data . The epidemiological characteristics of viral diarrhea in Guangzhou area are analyzed , and the test level 偽 is 0.05 .
Results :
1 . From June 2011 to May 2012 , a total of 360 children ' s stool samples and questionnaires were collected from two children ' s sentinel hospitals in Guangzhou . The cultural level of the main guardian of the children was up to 53.0 % ( 188 / 355 ) and 20.2 % ( 71 / 351 ) at home and at home .
2 . The average age was ( 41.91 鹵 17.92 ) , and the age of adult patients was ( 41.91 鹵 17.92 ) . The patient ' s degree of culture was 50.4 % ( 64 / 127 ) . The illiteracy rate was at least 0.8 % ( 1 / 127 ) .
The positive rates of RV , NoV , AdV , SaV , and V were 30 % ( 108 / 360 ) , 8.9 % ( 32 / 360 ) , 7.5 % ( 27 / 360 ) , 1.7 % ( 6 / 360 ) , 2.5 % ( 9 / 360 ) , respectively .
4 . The detection rate of five kinds of virus in adult patients was the highest , 8.7 % ( 11 / 127 ) , the second was rotavirus 5.5 % ( 7 / 127 ) , adenovirus 2.4 % ( 3 / 127 ) , Zaragoza virus 2.4 % ( 3 / 127 ) , star virus 0.8 % ( 1 / 127 ) .
5 . Sequence analysis showed that 32 strains were detected in 360 children ' s stool samples , sequenced and analyzed , 26 belonged to type G 鈪,
本文編號(hào):2069172
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