本文選題：HCV基因型 + HCV核心區(qū)　； 參考：《中國(guó)輸血雜志》2017年09期

【摘要】：目的研究感染HCV的無(wú)癥狀獻(xiàn)血者基因型和1b基因型的核心區(qū)氨基酸置換情況。方法用巢式PCR方法擴(kuò)增91個(gè)HCV RNA陽(yáng)性獻(xiàn)血者標(biāo)本,根據(jù)直接測(cè)序得到的序列用Mega6.0軟件進(jìn)行序列比對(duì)和進(jìn)化樹構(gòu)建,分析基因型和氨基酸置換情況。結(jié)果在78個(gè)測(cè)序結(jié)果清晰的樣品中,66個(gè)為基因型1b(84.6%),其他基因型為1a(1,1.3%)、2a(7,8.9%)、3b(2,2.6%)和6a(2,2.6%)。62個(gè)1b樣品的核心區(qū)蛋白(aa68-120)發(fā)生17處氨基酸置換。第70位R70Q、R70P和R70H各1例;第91位L91M置換非常普遍,為87.9%。結(jié)論本研究中獻(xiàn)血者感染的HCV基因型主要為1型,尤其是1b為優(yōu)勢(shì)基因型。首次發(fā)現(xiàn)中國(guó)獻(xiàn)血者感染的HCV核心區(qū)蛋白的氨基酸置換具有獨(dú)特性。
[Abstract]:Objective to study the amino acid exchange in core region of asymptomatic blood donors infected with HCV and genotype 1b. Methods 91 HCV RNA positive blood donors were amplified by nested PCR. The sequence alignment and phylogenetic tree construction were carried out by Mega6.0 software according to the sequence obtained by direct sequencing. The genotype and amino acid replacement were analyzed. Results among the 78 samples with clear sequencing results, 66 were genotypes 1b, 84.6, and the others were 1a, 1. 3, 1. 3, 78.9, 78.9) and 6a, 22. 6 and 62 1b, respectively. 17 amino acid substitutions occurred in the core region protein aa68-120 of 62 1b samples. There were 1 case of R70QN R70P and 1 case of R70H at the 70th position, and 87.9% of L91M replacement at the 91st position. Conclusion the HCV genotype of blood donors in this study was mainly genotype 1, especially 1b. It is the first time that the amino acid replacement of HCV core protein infected by Chinese blood donors is unique.
【作者單位】： 江蘇省血液中心;
【基金】：江蘇省“六大人才高峰”項(xiàng)目(2014-WSN-002) 江蘇省第五期“333高層次人才培養(yǎng)工程”資助項(xiàng)目(LGY2016045)
【分類號(hào)】：R512.63

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本文編號(hào)：2037555