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2014年廣東省登革熱大流行的病原體來源及分子進化特點

發(fā)布時間:2018-06-07 13:23

  本文選題:登革熱 + 登革病毒; 參考:《中山大學學報(醫(yī)學科學版)》2017年01期


【摘要】:【目的】分離培養(yǎng)與鑒定2014年廣東省登革熱暴發(fā)流行的病原體,從分子進化方向分析其來源和遺傳進化特點,為登革熱的監(jiān)測和防控提供科學依據(jù)。【方法】在2014年登革熱暴發(fā)流行期間,采集廣東省不同地區(qū)登革熱患者的血清標本,從中分離培養(yǎng)登革病毒并進行型別鑒定。采用RT-PCR和測序技術(shù)獲取病毒的E基因和全基因組序列,并對其進行系統(tǒng)進化分析、貝葉斯進化分析和遺傳變異分析!窘Y(jié)果】分離培養(yǎng)與鑒定了40株登革病毒1型(DENV-1)病毒,獲得了這40株分離株的完整E基因序列和其中6株分離株的全基因組序列。E基因進化分析結(jié)果顯示,40株分離株中有16株為基因Ⅰ型,24株為基因Ⅴ型。16株基因Ⅰ型毒株中有14株與2013年廣州市和2013年新加坡流行的毒株高度同源,核苷酸相似度為99.6%~99.9%,另2株基因Ⅰ型毒株則與2013年馬來西亞流行的毒株親緣關(guān)系最近,核苷酸相似度為99.7%。24株基因Ⅴ型毒株均與2009年孟加拉、廣州市和2013年不丹流行的毒株同源性高,核苷酸相似度為99.0%~99.9%。對6株病毒全基因組進化分析結(jié)果顯示,其中5株病毒與2013年廣州市和中山市流行的毒株高度同源,核苷酸相似度為99.6%~99.8%,另一株病毒則與2002年的緬甸流行株親緣關(guān)系最近,核苷酸相似度為98.8%。對E基因的遺傳變異分析結(jié)果顯示,與2013年廣東省的流行代表株比較,2014年廣東省分離株有5個氨基酸位點發(fā)生了變異,其中3個(S88V,E203G,T275R)位于EⅡ區(qū)的毒力位點區(qū)域,1個(S305P)位于EⅢ區(qū)的毒力位點區(qū)域!窘Y(jié)論】2014年廣東省登革熱的病原體主要為DENV-1,且至少有2種基因型同時在流行;其可能來源于2013年廣東省流行的毒株,也可能來源于新加坡、馬來西亞、緬甸等東南亞國家的毒株,其中2013年廣東省流行的毒株可能是重要來源之一,提示須加強對本地毒株及傳播媒介的監(jiān)測和研究,以便了解登革熱是否在廣東省本地化的問題;在流行過程中,病毒有些氨基酸位點已發(fā)生變異,其中有4個變異位點位于登革病毒的毒力位點區(qū)域,提示有必要對這些變異的生物學意義開展進一步研究。
[Abstract]:[objective] to isolate, culture and identify the pathogen of dengue fever outbreak in Guangdong Province in 2014, and analyze its origin and genetic evolution from the direction of molecular evolution. [methods] during the outbreak of dengue fever in 2014, serum samples of dengue patients from different areas of Guangdong Province were collected, and the dengue virus was isolated and identified. The E gene and the whole genome sequence of the virus were obtained by RT-PCR and sequencing techniques, and were analyzed by phylogenetic analysis, Bayesian evolutionary analysis and genetic variation analysis. [results] 40 strains of dengue virus type 1 (DENV-1) virus were isolated and identified. The complete E gene sequence of 40 isolates and the whole genome sequence of 6 of them were obtained. The results showed that 16 of the 40 isolates were gene type 鈪,

本文編號:1991321

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