HIV-1感染者Vpr基因多態(tài)性及其臨床意義研究
發(fā)布時(shí)間:2018-05-27 08:46
本文選題:HIV感染 + Vpr基因; 參考:《北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院》2013年博士論文
【摘要】:[目的] 探討HIV-1感染者亞型的分子流行病學(xué)特征和HIV-1Vpr基因的多態(tài)性及其臨床意義。 [方法] 研究對象來自我國“十一五”HIV/AIDS抗病毒治療隊(duì)列一(即初治患者)。提取323例HIV-1感染者血漿HIV-RNA,采用RT-PCR的方法對Vpr基因進(jìn)行擴(kuò)增、測序。利用Contig Express軟件、Bioedit5.0軟件、美國拉莫斯國家實(shí)驗(yàn)室Los Alamos網(wǎng)站上的HIV databases, ClustalW軟件、Mega4.1軟件,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹、鑒定病毒亞型并與Env/Gag基因分型結(jié)果進(jìn)行比較、比對氨基酸序列。收集患者在基線和治療48周時(shí)的臨床數(shù)據(jù)信息(包括性別、年齡、傳播途徑、CD4+T淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)、HIV病毒載量、血肌酐、腎小球?yàn)V過率eGFR肌酐清除率Ccr)。分析我國HIV-1感染者亞型的分子流行病學(xué)特征和HIV-1Vpr基因的多態(tài)性及其臨床意義。 [結(jié)果] 1.我國HIV-1感染者亞型的分子流行病學(xué)特征 我國HIV-1感染者以男性為主占74.7%,年齡18-49歲的感染者占87.0%,主要流行株為CRF01_AE亞型占46%,同時(shí)有BC亞型(28%)(包括CRF07_BC亞型(19%)、CRF08_BC(9%))、B亞型(23%)、CRF03_AB亞型(2%)及C亞型(1%),其中CRF01_AE亞型主要分布在北京、上海、廣州,BC亞型主要分布在云南,B亞型主要分布在河南。本研究中,性途徑為主要傳播途徑占83.0%,其中異性傳播占43.0%,同性傳播占38.3%,異性傳播:同性傳播大致1:1。同性傳播以CRF01_AE亞型為主,血液傳播以B亞型為主。合并HBV感染的共感染率是15.0%。采用HIV-1Vpr基因?qū)ξ覈鳫IV-1毒株進(jìn)行分型與Env/Gag基因分型結(jié)果一致性高達(dá)95.3%,且操作簡單、方便,經(jīng)濟(jì)。 2.不同HIV-1亞型對抗病毒治療臨床療效的影響 在治療基線時(shí),CRF01_AE亞型感染者的CD4+T淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)顯著低于其它亞型(P=0.007)。治療48周時(shí)CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B亞型感染者均出現(xiàn)CD4+T淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)升高、血漿HIV-1病毒載量顯著下降,但不同HIV-1亞型抗病毒治療臨床療效間無顯著差異。 3.我國HIV-1感染者Vpr基因的多態(tài)性及其臨床意義 我國HIV/AIDS初治患者HIV-1Vpr基因氨基酸保守位點(diǎn)所占比例為41.7%,變異位點(diǎn)較為分散,C末端變異較N末端明顯。我國HIV-1感染者Vpr氨基酸序列第77位為谷氨酰胺(Q)的比例高達(dá)81.7%,與國外研究報(bào)道的該位點(diǎn)多為精氨酸(R)不同。我國HIV-1感染者Vpr氨基酸序列R85P和Q86G變異者基線CD4+T淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)顯著低于未變異者而血漿HIV-1病毒載量顯著高于未變異者(均P0.05);A89G變異者基線及治療48周時(shí)CD4+T淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)顯著低于未變異者(均P0.05);184L變異者基線血漿HIV-1病毒載量顯著低于未變異者,治療48周時(shí)CD4+T淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)顯著高于未變異者(均P0.05);E55A變異者基線CD4+T淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)顯著高于未變異者(P=0.038)。 [結(jié)論] 該研究提出使用HIV-1Vpr基因進(jìn)行我國HIV-1毒株基因亞型分析準(zhǔn)確度高、方便、經(jīng)濟(jì)。我國HIV-1感染者以男性為主,CRF01_AE亞型為主要流行株,性途徑為主要傳播途徑,同性與異性傳播比例大致相當(dāng)。CRF01_AE亞型感染者疾病進(jìn)展快,不同HIV-1亞型對抗病毒治療臨床療效無影響。我國HIV-1感染者Vpr基因R77Q氨基酸位點(diǎn)變異頻率遠(yuǎn)高于國外報(bào)道,R85P、Q86G、A89G和E55A變異可能與疾病進(jìn)程有關(guān)。該研究不僅揭示了我國HIV-1感染者亞型的分子流行病學(xué)特征和HIV-1Vpr基因的多態(tài)性及其臨床意義,而且對于指導(dǎo)我國HIV-1感染者的疾病監(jiān)控、指導(dǎo)疫苗研發(fā)、提供潛在的治療干預(yù)手段都有著重要意義。
[Abstract]:Purpose of the project
To investigate the molecular epidemiology of HIV - 1 infection and the polymorphism of HIV - 1 Vpr gene and its clinical significance .
Methodology
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本文編號:1941328
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