本文選題：腹瀉 + 病原學(xué)　； 參考：《現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué)》2015年07期

【摘要】：目的對(duì)2013年南京市疑似病毒性腹瀉成人門診樣本進(jìn)行星狀病毒核酸檢測(cè)、分子分型和進(jìn)化分析,為星狀病毒所致成人病毒性腹瀉的分子流行病學(xué)提供資料。方法收集2013年疑似病毒性腹瀉門診成人病例的腹瀉物375份,用星狀病毒特異性引物和探針進(jìn)行熒光定量RT-PCR檢測(cè),然后對(duì)熒光定量RT-PCR陽(yáng)性的樣本,用一步法RT-PCR再進(jìn)行星狀病毒特異片段的檢測(cè)。對(duì)RT-PCR產(chǎn)物進(jìn)行雙向測(cè)序和進(jìn)化樹分析。結(jié)果熒光定量RT-PCR共檢測(cè)到9例星狀病毒陽(yáng)性(2.4%),其中,6例(1.6%)擴(kuò)增到單一條帶,測(cè)序獲得449 bp的星狀病毒殼蛋白基因片段序列。經(jīng)比對(duì)分析,6例星狀病毒中,4例為5型星狀病毒,1例為1型星狀病毒,1例為8型星狀病毒。結(jié)論南京市星狀病毒所致成人病毒性腹瀉中有多種型別星狀病毒,5型為優(yōu)勢(shì)型。
[Abstract]:Objective to detect stellate virus nucleic acid, molecular typing and evolutionary analysis in adult clinic samples of suspected viral diarrhea in Nanjing in 2013, so as to provide data for molecular epidemiology of adult viral diarrhea caused by stellate virus. Methods 375 samples of diarrhea products from adult patients with suspected viral diarrhea in 2013 were collected and detected by fluorescent quantitative RT-PCR with stellate virus specific primers and probes, and then positive samples of fluorescent quantitative RT-PCR were collected. The stellate virus specific fragment was detected by one step RT-PCR. Bidirectional sequencing and phylogenetic tree analysis of RT-PCR products were carried out. Results A total of 9 stellate virus positive individuals were detected by fluorescence quantitative RT-PCR, 6 of them were amplified into a single band, and 449 BP sequence of stellate virus capsid protein gene was obtained by sequencing. Among 6 cases of stellate virus, 4 cases were stellate virus type 5, 1 case was stellate virus type 1 and 1 case was stellate virus type 8. Conclusion there are many types of stellate virus type 5 in adult viral diarrhea caused by stellate virus in Nanjing.
【作者單位】： 南京市疾病預(yù)防控制中心;
【基金】：南京市醫(yī)學(xué)科技發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(ZKX09033) 南京市衛(wèi)生青年培養(yǎng)工程項(xiàng)目(QRX11127)
【分類號(hào)】：R512.5

【參考文獻(xiàn)】

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1 王永霞;段招軍;李宇寧;;人星狀病毒研究進(jìn)展[J];病毒學(xué)報(bào);2012年04期

2 林謙;金玉;周進(jìn)蘇;陸芬;李曉樂;李玫;段招軍;;2009至2010年南京兒童醫(yī)院5歲以下兒童病毒性腹瀉分子流行病學(xué)特點(diǎn)[J];中國(guó)循證兒科雜志;2012年01期

3 方肇寅;孫亞萍;葉新華;王慧;章青;段招軍;Duncan Steele;Roger Glass;;中國(guó)七個(gè)地區(qū)1998-2005年急性腹瀉住院患兒中星狀病毒感染研究[J];中華流行病學(xué)雜志;2006年08期

4 王春娟;陳志軍;白堯;;西安市病毒性腹瀉病原學(xué)構(gòu)成及流行特征分析[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2013年05期

5 李學(xué)軍;陳茜;任建莎;宋迎都;顧清;;病毒性腹瀉的流行病學(xué)研究進(jìn)展[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2013年12期

【共引文獻(xiàn)】

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1 朱美霞,劉海清,張?jiān)掠?應(yīng)用RAPD-PCR分析棉花A基因組的起源與進(jìn)化[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2004年06期

2 溫洪宇;韓寶平;周玉樓;呂愛軍;楊柳;;嗜鹽菌HBCC-3的培養(yǎng)特性及系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年14期

3 熱娜·米吉提;古麗斯瑪依·艾拜都拉;蘇豫梅;周秀文;李越中;烏斯?jié)M·依米提;;新疆飼料乳酸菌的多樣性與系統(tǒng)進(jìn)化分析[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2012年06期

4 李政紅;馬琳娜;何澤;張勝;王文中;于娟;王麗娟;曹文庚;;耐鉻菌群特性及其修復(fù)土壤鉻污染的條件優(yōu)化[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2012年12期

5 鄧書湛;劉若余;;關(guān)中奶山羊線粒體Cyt b基因遺傳多樣性研究[J];現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技;2010年02期

6 王成樹,李增智;分子數(shù)據(jù)的遺傳多樣性分析方法(綜述)[J];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2002年01期

7 梁俊文;于可響;陳靜;王貴升;莊文忠;田夫林;;新城疫病毒分離株HN和P基因分子進(jìn)化及其相關(guān)研究[J];病毒學(xué)報(bào);2008年05期

8 王永霞;段招軍;李宇寧;;人星狀病毒研究進(jìn)展[J];病毒學(xué)報(bào);2012年04期

9 曹祥榮,束峰玨,張錫然,畢春明,李朝軍,胡均,方箋陽(yáng);毛冠鹿與3種麂屬動(dòng)物的線粒體細(xì)胞色素b的系統(tǒng)進(jìn)化分析[J];動(dòng)物學(xué)報(bào);2002年01期

10 李明,饒剛,魏輔文,方盛國(guó),湯純香,玉手英利;小熊貓種群遺傳結(jié)構(gòu)和地理分化[J];動(dòng)物學(xué)報(bào);2002年04期

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1 薛夢(mèng)林;;冬棗采后黑斑病拮抗菌的篩選與鑒定[A];微生物實(shí)用技術(shù)生態(tài)環(huán)境應(yīng)用學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年

2 蘇智慧;;大步甲蟲亞科的平行進(jìn)化和快速形態(tài)分化(英文)[A];生命科學(xué)與生物技術(shù)：中國(guó)科協(xié)第三屆青年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];1998年

3 ;Species Discrimination of Four Crabs (Genus Scylla) by Mitochondrial COI Gene[A];經(jīng)濟(jì)發(fā)展方式轉(zhuǎn)變與自主創(chuàng)新——第十二屆中國(guó)科學(xué)技術(shù)協(xié)會(huì)年會(huì)（第三卷）[C];2010年

4 蔡旭;方偉武;;基于極大似然估計(jì)的分子序列修正Kimura雙參數(shù)距離[A];中國(guó)運(yùn)籌學(xué)會(huì)第七屆學(xué)術(shù)交流會(huì)論文集（中卷）[C];2004年

5 ;A simple method for constructing phylogenetic tree[A];大連理工大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)術(shù)論文集（第2卷）[C];2005年

6 ;Molecular evolution of Clupeidae fishes ( Osteichthyes:Clupeiformes) :information obtained from Genbank database[A];生物技術(shù)對(duì)水產(chǎn)業(yè)的促進(jìn)作用——2005水產(chǎn)科技論壇論文集[C];2005年

7 黃族豪;劉忷發(fā);張立勛;張旭;;兩種錦雞線粒體控制區(qū)基因序列分析及其分類討論[A];第八屆中國(guó)動(dòng)物學(xué)會(huì)鳥類學(xué)分會(huì)全國(guó)代表大會(huì)暨第六屆海峽兩岸鳥類學(xué)研討會(huì)論文集[C];2005年

8 晁志;廖婧;梁鎮(zhèn)標(biāo);張亮;李軍德;黃璐琦;;金錢白花蛇及其混偽品的DNA條形碼鑒定(英文)[A];第十一屆全國(guó)青年藥學(xué)工作者最新科研成果交流會(huì)論文集[C];2012年

9 HOU Dianyun;SONG Jingyuan;YAO Hui;HAN Jianping;PANG Xiaohui;SHI Linchun;YANG Pei;WANG Xiaochen;CHEN Shilin;;Molecular Identification of Corni Fructus Using DNA Barcoding[A];第十五屆中國(guó)科協(xié)年會(huì)第21分會(huì)場(chǎng)：中藥與天然藥物現(xiàn)代研究學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2013年

10 Jirimutu;P.Cui;F.Ding;J.Geng;H.Gao;H.Zhang;J.Yu;S.Hu;H.Meng;;Monophyletic origin of domestic bactrian camel (Camelus bactrianus) and its evolutionary relationship with the extant wild camel (Camelus bactrianus ferus)[A];2012中國(guó)駝業(yè)進(jìn)展[C];2012年

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1 郭雪江;睪丸蛋白表達(dá)譜的研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2009年

2 張成玲;煙草脈帶花葉病毒、蕪菁花葉病毒和馬鈴薯Y病毒的遺傳結(jié)構(gòu)分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

3 于紅;牡蠣良種選育的遺傳學(xué)基礎(chǔ)研究[D];中國(guó)海洋大學(xué);2010年

4 伊珍珍;旋唇綱、寡膜綱和前口綱纖毛蟲原生動(dòng)物研究[D];中國(guó)海洋大學(xué);2009年

5 李敏;異翅亞目DNA條形碼，譜系生物地理學(xué)及花蝽科（狹義）分子系統(tǒng)發(fā)育研究[D];南開大學(xué);2010年

6 曹軼;深海微生物多樣性和嗜鹽古菌乙醇代謝相關(guān)酶基因研究[D];浙江大學(xué);2010年

7 高兆明;紅樹林纖維素降解菌和菌群及其相關(guān)酶類的研究[D];山東大學(xué);2011年

8 劉志勇;蜜蜂性等位基因csd多態(tài)性研究[D];江西農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

9 劉紅;版納病毒全基因組序列特征及其分子進(jìn)化研究[D];中國(guó)疾病預(yù)防控制中心;2011年

10 高珊;寡毛類等5個(gè)重要纖毛蟲類群的分子系統(tǒng)學(xué)研究[D];中國(guó)海洋大學(xué);2011年

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1 胡佳;鱘形目部分種類基于線粒體COⅠ基因的分子進(jìn)化研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

2 李悅;中國(guó)萵苣屬及其近緣屬植物系統(tǒng)學(xué)關(guān)系的初步研究[D];鄭州大學(xué);2010年

3 陶娟;基于線粒體基因序列探討廣義花臭蛙種群遺傳結(jié)構(gòu)[D];河南師范大學(xué);2010年

4 張雪兵;醉馬草內(nèi)生菌殺蟲活性及其多樣性研究[D];新疆農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

5 顏剛;長(zhǎng)翅目蝎蛉科昆蟲分子系統(tǒng)發(fā)育及單角蝎蛉物種分子界定[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2010年

6 匡葉葉;麋鹿AFLP分子標(biāo)記系統(tǒng)的建立及其遺傳多樣性評(píng)估[D];浙江大學(xué);2011年

7 方海環(huán);天目山土壤產(chǎn)抗芽孢桿菌的分離篩選及其系統(tǒng)發(fā)育分析[D];浙江大學(xué);2010年

8 楊金玲;中國(guó)異蚤蠅屬部分種類分子系統(tǒng)發(fā)育分析[D];沈陽(yáng)大學(xué);2011年

9 吳立夢(mèng);人星狀病毒1型衣殼蛋白的序列分析、克隆表達(dá)及多克隆抗體制備[D];東華大學(xué);2011年

10 陳超;新疆七角井鹽湖可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性及其功能酶篩選[D];塔里木大學(xué);2011年

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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1 方肇寅,章菁,趙章華,馬莉,李永華,楊輝,S.Monroe,R.Glass;我國(guó)河南與北京腹瀉患兒中的星狀病毒感染[J];病毒學(xué)報(bào);2000年02期

2 方肇寅;謝華萍;呂紅霞;劉娜;章青;段招軍;Duncan Steele;Baoming Jiang;Xi Jiang;;1999~2005年我國(guó)嬰幼兒人杯狀病毒腹瀉研究[J];病毒學(xué)報(bào);2007年01期

3 段招軍;李丹地;章青;劉娜;鄭麗舒;唐景裕;王忠山;方肇寅;;在中國(guó)盧龍縣發(fā)現(xiàn)G5型人A組輪狀病毒[J];病毒學(xué)報(bào);2007年02期

4 劉艷;徐子乾;李金松;靳淼;程衛(wèi)霞;鞏勛;李慧瑩;楊晚竹;楊夢(mèng)婕;胡秀梅;馬學(xué)軍;段招軍;;建立新型的常見腹瀉相關(guān)病毒的多重檢測(cè)方法[J];病毒學(xué)報(bào);2011年03期

5 聶波麗;張林;尤燦;郭寬鵬;莫麗亞;;長(zhǎng)沙地區(qū)嬰幼兒A群輪狀病毒腹瀉的流行病學(xué)特征[J];中國(guó)感染控制雜志;2008年06期

6 謝華萍,方肇寅;人類杯狀病毒的流行病學(xué)研究進(jìn)展[J];國(guó)外醫(yī)學(xué).病毒學(xué)分冊(cè);2000年06期

7 孫亞萍;方肇寅;姬振周;章青;謝華萍;;鄭州兒童醫(yī)院住院腹瀉患兒中星狀病毒、杯狀病毒的感染分析[J];黑龍江醫(yī)藥科學(xué);2006年02期

8 盛偉松;于寶生;蔣敏;甘衛(wèi)華;張愛青;;嬰幼兒腹瀉的病毒學(xué)檢測(cè)分析[J];南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2008年03期

9 于秋麗;劉立;劉京生;唐景裕;;2006年河北省病毒性腹瀉的病原學(xué)監(jiān)測(cè)分析[J];中國(guó)全科醫(yī)學(xué);2008年06期

10 王路;楊維娜;寧沛雯;;西安市兒童醫(yī)院2006年住院腹瀉患兒輪狀病毒、腸道腺病毒病原學(xué)檢測(cè)[J];實(shí)用醫(yī)技雜志;2008年22期

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1 楊建軍;甘肅省腹瀉病流行特征和經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)研究[D];中國(guó)疾病預(yù)防控制中心;2008年

2 柴程良;腹瀉病流行特征與經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)研究[D];浙江大學(xué);2010年

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1 孫亞萍;方肇寅;姬振周;章青;謝華萍;;鄭州兒童醫(yī)院住院腹瀉患兒中星狀病毒、杯狀病毒的感染分析[J];黑龍江醫(yī)藥科學(xué);2006年02期

2 朱冰;鐘家禹;李瀟;陳翊;林濤;吳灶和;周榮;龔四堂;;廣州檢出星狀病毒4型的全基因組序列測(cè)定及分析[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2006年10期

3 朱琳;段招軍;祁紅梅;程衛(wèi)霞;李金松;章青;唐景裕;;河北盧龍縣嬰幼兒星狀病毒腹瀉分子流行病學(xué)研究[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2010年18期

4 田登;劉桂香;易虎;趙生倉(cāng);;西寧地區(qū)2010年嬰幼兒星狀病毒流行情況分析[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2012年10期

5 夏文;倪賢生;吳越;樊國(guó)印;周顯鳳;賀鳳蘭;;一起星狀病毒引起暴發(fā)流行的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2013年04期

6 徐惠芳;;在志愿者體內(nèi)的星狀病毒感染[J];中南醫(yī)學(xué)科學(xué)雜志;1981年01期

7 胥愛源;龐其方;丘福禧;;秋季嬰兒胃腸炎患兒糞便中發(fā)現(xiàn)星狀病毒[J];醫(yī)學(xué)研究通訊;1981年06期

8 劉亞誼,喬海平,徐云鶴;163例住院腹瀉患兒糞便標(biāo)本星狀病毒檢測(cè)[J];中國(guó)兒童保健雜志;1999年03期

9 邊興艷;劉英華;周力音;王海漣;;大連市5歲以下住院腹瀉患兒星狀病毒和輪狀病毒的感染情況分析[J];中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志;2009年12期

10 譚冬梅;劉巍;鄧麗麗;唐振柱;楊哲;黃兆勇;謝鎮(zhèn)國(guó);方志鋒;卓家同;;南寧市散發(fā)性腹瀉病例中星狀病毒的檢測(cè)分析[J];中國(guó)疫苗和免疫;2010年05期

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1 盧麗娟;徐錦;鐘華清;蘇犁云;曹凌峰;徐夢(mèng)華;;住院和門診腹瀉兒童中星狀病毒的分子流行病學(xué)特點(diǎn)比較[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十七次全國(guó)兒科學(xué)術(shù)大會(huì)論文匯編（上冊(cè)）[C];2012年

2 馬莉;李貴;方肇寅;;北京地區(qū)兒童杯狀病毒和星狀病毒腹瀉的研究[A];中西醫(yī)結(jié)合第九次全國(guó)兒科學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2000年

3 廖勤豐;張冬冬;張大丙;;水禽源星狀病毒的檢測(cè)[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)禽病學(xué)分會(huì)第十六次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2012年

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1 廖勤豐;新發(fā)現(xiàn)的水禽星狀病毒、微RNA病毒和嵌杯病毒的分子檢測(cè)與鑒定[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

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1 張俊;上海地區(qū)腹瀉兒童星狀病毒攜帶情況調(diào)查[D];上海交通大學(xué);2011年

2 姜盛;吉林、蘭州地區(qū)嬰幼兒星狀病毒腹瀉分子流行病學(xué)研究[D];安徽理工大學(xué);2011年

3 NIYOKWISHIMIRA Alfred（艾佛德）;廣西牛星狀病毒分子流行病學(xué)調(diào)查與全基因克隆及序列分析[D];廣西大學(xué);2014年

4 商曉桂;豬星狀病毒的分離鑒定和熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

5 肖建鵬;湘瓊兩地蝙蝠攜帶星狀病毒與諾如病毒的調(diào)查研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2011年

6 劉歡;豬星狀病毒分離鑒定及其全基因組序列分析和衣殼蛋白原核表達(dá)[D];廣西大學(xué);2014年

7 王永霞;2010-2011年蘭州地區(qū)嬰幼兒病毒性腹瀉流行病學(xué)研究[D];蘭州大學(xué);2012年

8 鄧建軍;逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（RT-PCR）法檢測(cè)住院患兒腸道星狀病毒[D];四川大學(xué);2004年

9 朱愛玲;犬星狀病毒（Canineastrovirus，，CaAstv）半巢式RT-PCR檢測(cè)方法的建立及基因序列分析[D];上海交通大學(xué);2012年

10 郭翠平;鴨星狀病毒1型WF1202株全基因組序列的測(cè)定與單因子血清的制備[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

本文編號(hào)：1914020