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內(nèi)蒙古布魯氏菌病流行病學調(diào)查與布魯氏菌基因分型方法的比較研究

發(fā)布時間:2018-05-19 06:08

  本文選題:布魯氏菌病 + 橫斷面調(diào)查; 參考:《中國疾病預防控制中心》2014年碩士論文


【摘要】:目的:估計內(nèi)蒙古自治區(qū)布病的血清學患病率以及布病陽性家庭所占的比例,了解家庭對布病知識的認知情況。分析引起布病感染的危險因素,為制定適合牧區(qū)人群的布病預防干預措施提供科學依據(jù)。定性和定量評價布魯氏菌的串聯(lián)重復序列和多位點序列分型方法,為我國的布魯氏菌分子流行病學研究方法的選擇提供科學依據(jù)。 方法:橫斷面調(diào)查采取多階段抽樣,首先在內(nèi)蒙古四子王旗選擇農(nóng)區(qū)和牧區(qū)兩個區(qū),每個區(qū)隨機抽取5個村,每個村隨機抽取30戶,對抽樣家庭采取入戶問卷調(diào)查。病例對照研究在察右后旗,林西縣,科右中旗疾病預防控制中心布病門診部對一定期限內(nèi)的所有就診患者進行問卷調(diào)查,并采集血樣進行實驗室檢測。通過單因素Χ2檢驗和多因素logistic回歸分析布病感染的危險因素。應用PCR技術(shù)對1953年到2013年分離自不同地區(qū)的212株布魯氏菌(包括內(nèi)蒙古)同時進行16個位點的串聯(lián)重復序列分型(MLVA)和9個位點的多位點序列分型(MLST),對2種分型結(jié)果進行聚類判別分析和進化分析,評價兩種方法的分辨能力和與傳統(tǒng)分型結(jié)果的一致性,并結(jié)合疫情分析引起我國布病疫情的菌株間的親緣關(guān)系。 結(jié)果: 1.在四子王旗共調(diào)查300戶家庭,收集594份血清,血清學患病率為9.6%(95%CI:7.2%~12.0%)。以戶為分析單位時,家庭布病陽性率為16.67%(95%CI:12.4%-20.87%)。 2.四子王旗不同年齡組的布病感染率具有統(tǒng)計學差異(Χ2=11.556,P=0.0414),且感染多集中在30-50年齡段的勞動人群。不同的地區(qū)(農(nóng)區(qū)與牧區(qū))患病率無統(tǒng)計學差異。 3.四子王旗有布病患者的家庭與無布病患者的家庭飼養(yǎng)綿羊(t Approximation P=0.027)和山羊(t Approximation P=0.0998)的數(shù)量在α=0.10水平下,差異具有統(tǒng)計學意義,且有布病患者的家庭養(yǎng)殖數(shù)高于無布病患者的家庭。 4.四子王旗家庭對布病感染途徑的知曉率低于50%,喝煮沸的奶和用煮沸的奶制作奶制品可以預防布病的知曉率分別為3.00%和2.67%。獲得布病相關(guān)防治建議的主要渠道是旗(縣)CDC,占78.33%。 5.病例對照研究的三個項目旗縣共收集調(diào)查問卷與血清樣本各872份。病例組納入156人,對照組納入585人。病例與對照人口基線情況中性別(Χ2=20.997,P0.0001)、年齡(P=0.002)、職業(yè)(Χ2=15.15,P=0.0005)具有統(tǒng)計學差異。 6.三個旗縣的病例對照研究多因素Logistic分析顯示性別(女VS男:OR=0.421,95%CI=0.287-0.618)、職業(yè)(農(nóng)民VS其他:OR=1.849,95%CI=0.974-3.509牧民VS其他:OR=1.604,95%CI=0.409-6.296)、喂養(yǎng)牲畜(不喂養(yǎng)VS喂養(yǎng):OR=0.512,95%CI=0.295-0.888)是可能的危險因素。 7.病例對照研究認知情況調(diào)查發(fā)現(xiàn)調(diào)查對象知道布病是傳染病的占19.28%,認為布病可以治愈的占40.62%。知曉率最高的預防布病的措施是在家畜接生時采取防護措施,為11.07%,其余預防措施知曉率不足10%。 8.應用MLVA和MLST分別將212株布魯氏菌分為149種MLVA型和21種ST型。兩種方法的分辨率Simpson指數(shù)分別為0.990(95%CI:0.988-0.992)與0.565(95%CI-0.485-0.644)。 9.143株羊種布魯氏菌通過MLVA分型發(fā)現(xiàn)了9種不同的Panel1型,其中42型111株,占77.6%。內(nèi)蒙古、山西和河北省羊種菌株中42型Panel1分別占78.9%,97.0%和100%。 10. MLVA最小生成樹分析將2010年和2013年海南省分離的2株豬3型布魯氏菌與20世紀60年代廣西分離的豬3型布魯氏菌聚為一簇,揭示了它們的親緣性。MLST最大簡約算法構(gòu)建的無根的系統(tǒng)發(fā)育樹揭示了羊種布魯氏菌是一種種內(nèi)變異較小的布魯氏菌,豬種和犬種布魯氏菌的親緣性較近且種內(nèi)變異相對較大。 11.通過建立Bayes判別模型,預測布魯氏菌的種別信息,以評價基因分型與傳統(tǒng)方法鑒定的布魯氏菌結(jié)果的吻合度,結(jié)果顯示MLVA預測的準確度為93.24%高于MLST的75.16%。 結(jié)論: 1.通過流行病學調(diào)查發(fā)現(xiàn)內(nèi)蒙古調(diào)查點布病真實的疫情比上報的疫情更為嚴重,漏報率約為20%。 2.養(yǎng)殖牲畜是調(diào)查旗縣布病感染的主要危險因素。具有勞動能力的青壯年人群為布病感染的高危人群,進行家畜的流產(chǎn)物的處理如埋掉、喂狗、隨意丟棄會增加布病感染的風險。 3.調(diào)查地區(qū)人群對布病相關(guān)知識具有一定的認知,但是認知水平較低。 4. MLVA分型結(jié)果顯示42型為內(nèi)蒙以及我國其他地區(qū)羊種菌株主要的Panel1型別,提示我國主要流行的羊種菌株可能起源于東地中?寺∪。 5.聚類分析表明我國南方豬種布魯氏菌引起的散發(fā)疫情具有一定的相關(guān)性。 6. MLST分型結(jié)果揭示引起我國布病流行的羊3型布魯氏菌主要為ST8型,且種內(nèi)變異較小。 7. MLVA分型分辨率高于MLST,適用于爆發(fā)調(diào)查和作為存在散發(fā)疫情的南方地區(qū)的分子流行病學監(jiān)測手段。MLST可以反應種群的進化關(guān)系,適用于疫情嚴重的北方地區(qū)的分子流行病監(jiān)測。
[Abstract]:Objective: to estimate the serological prevalence of the Inner Mongolia Autonomous Region's disease and the proportion of the disease positive families, to understand the knowledge of the disease and to analyze the risk factors for the infection of the disease, and to provide a scientific basis for the formulation of the prevention and intervention measures suitable for the population of the pastoral areas. Repetitive and multilocus sequence typing methods provide a scientific basis for the selection of Brucella molecular epidemiology in China.
Methods: multistage sampling was adopted in the cross-sectional survey. First, two districts were selected in the agricultural and pastoral areas in Siziwangqi, Inner Mongolia, and 5 villages were selected randomly in each area. 30 households were randomly selected in each village. A questionnaire survey was taken to sample families. Case control study was carried out in the outpatient department of the disease prevention and control center of the center for the disease prevention and control center of the central banner, Linxi County. A questionnaire survey was conducted for all patients in a certain period of time, and blood samples were collected for laboratory tests. The risk factors of infection were analyzed by single factor 2 test and multiple factor Logistic regression. 212 strains of Brucella (including Inner Mongolia) isolated from different regions from 1953 to 2013 were used at 16 sites at the same time. In tandem repeat sequence typing (MLVA) and multipoint sequence typing (MLST) of 9 loci, cluster discriminant analysis and evolutionary analysis of the 2 types of classification results were conducted to evaluate the resolution of the two methods and the consistency with the traditional typing results, and the relationship among the strains of the epidemic epidemic situation in China was analyzed by the epidemic analysis.
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本文編號:1909006

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