兒童與成人慢性乙型肝炎患者乙型肝炎病毒Core基因區(qū)準(zhǔn)種特征及正選擇壓力差異分析
本文選題:乙型肝炎病毒 + Core基因區(qū); 參考:《遺傳》2015年05期
【摘要】:兒童與成人慢性乙型肝炎患者的臨床特征差異明顯。乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)病毒準(zhǔn)種特征與其致病特性緊密相連,HBV病毒Core基因區(qū)富含免疫表位,該區(qū)域的準(zhǔn)種特征直接反映病毒變異與病毒應(yīng)對宿主免疫壓力間的動態(tài)過程。文章通過擴(kuò)增170名兒童慢性乙型肝炎患者及121名成人慢性乙型肝炎患者病毒Core基因區(qū),按照病毒基因型以及病毒e抗原(Hepatitis B virus e antigen,HBe Ag)狀態(tài)進(jìn)行分組,使用序列復(fù)雜度、多樣性、非同義突變率(Non-synonymous substitution ratio,d N)、同義突變率(Synonymous substitution ratios,d S)等指標(biāo)衡量不同組別之間的病毒準(zhǔn)種特征;使用不同模型計算不同組別中受到正選擇壓力的位點,進(jìn)一步結(jié)合HBV Core基因區(qū)免疫表位信息,進(jìn)行正選擇位點的定位分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),兒童乙型肝炎病毒患者體內(nèi)病毒Core基因區(qū)序列復(fù)雜性和多樣性低于成人患者,且前者Core基因區(qū)正選擇位點個數(shù)顯著低于后者,這說明兒童慢性乙型肝炎患者體內(nèi)病毒受到的選擇壓力低于成人患者。在兒童及成人慢性感染病人組中,HBe Ag陽性病人體內(nèi)病毒受到的選擇壓力低于HBe Ag陰性病人。兒童及成人慢性感染患者體內(nèi)病毒存在13個正選擇位點,大多數(shù)正選擇位點位于已知的抗原表位上。本研究從分子進(jìn)化角度揭示了兒童與成人慢性乙型肝炎病例體內(nèi)病毒Core基因區(qū)序列準(zhǔn)種差異,為兩類病人顯著不同的臨床表征提供了群體遺傳學(xué)的解釋。
[Abstract]:The results showed that the sequence complexity and diversity of HBV core gene region in children and adult patients with chronic hepatitis B were lower than those in adult patients .
【作者單位】: 重慶醫(yī)科大學(xué) 感染性疾病分子生物學(xué)教育部重點實驗室;重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院檢驗科;
【基金】:十二五國家傳染病重大專項(編號:2013ZX10002002) 重慶市科委基礎(chǔ)與前沿研究計劃(編號:cstc2013jcyj C10002)資助
【分類號】:R512.62;R725.1
【共引文獻(xiàn)】
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本文編號:1837275
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