浦東新區(qū)MSM HIV-1分子流行病學的研究
本文選題:艾滋病病毒型 + 基因亞型; 參考:《中國艾滋病性病》2015年06期
【摘要】:目的了解上海市浦東新區(qū)近年來男男性行為人群(MSM)中,未經(jīng)抗病毒治療的艾滋病病毒1型(HIV-1)抗體陽性者,其HIV-1亞型分布和原發(fā)性耐藥特征,監(jiān)測該地區(qū)MSM HIV-1毒株的最新流行情況,為當前該區(qū)制定艾滋病防治策略提供科學依據(jù)。方法選取2011年至2014年4月份期間確認的MSM HIV-1感染者血漿標本70份,應用巢式反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(RT-PCR)擴增pol基因,并對擴增產(chǎn)物進行測序,用Mega 6.0軟件將測序結(jié)果與各亞型國際參考株比對,根據(jù)系統(tǒng)進化樹分析確定基因亞型及其特征以及耐藥情況。結(jié)果獲62份pol區(qū)基因全序列片段,得到CRF01-AE、CRF07_BC、01B(CRF01_AE與B重組亞型)和B四種亞型。分布顯示:CRF01-AE占58.06%(36/62),CRF07_BC占30.65%(19/62),01B占6.45%(4/62),B占4.84%(3/62)。離散率顯示:CRF01-AE亞型的平均離散率為(2.1±0.2)%(n=36),CRF07-BC亞型的平均離散率也為(2.1±0.2)%(n=19),B亞型的平均離散率為(5.7±0.6)%(n=3),01B重組亞型的平均離散率為(6.3±.0.6)%(n=4)。耐藥特征:62例中有7例分別產(chǎn)生了對核苷類反轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NRTIs)、非核苷類反轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NNRTIs)及蛋白酶類抑制劑(PIs)的耐藥突變,其中2例產(chǎn)生了低度耐藥,4例具有潛在的耐藥特點。結(jié)論上海市浦東新區(qū)2011年至2014年4月間,MSM新確證HIV-1感染者中,基因亞型呈多元化趨勢,以CRF01-AE和CRF07-BC為主,并已形成了浦東新區(qū)范圍內(nèi)的局部流行趨勢,新的01B重組毒株已在浦東新區(qū)開始出現(xiàn);HIV-1原發(fā)耐藥株的傳播尚處于低度流行水平,密切監(jiān)視其流行趨勢已顯十分必要。
[Abstract]:Objective to investigate the distribution of HIV-1 subtypes and the characteristics of primary drug resistance in MSM of men who had sex with men in Pudong New District of Shanghai in recent years. To monitor the latest epidemic situation of MSM HIV-1 strains in this area and provide scientific basis for the current HIV / AIDS prevention and control strategy in this area. Methods 70 plasma samples of MSM HIV-1 infected patients from 2011 to 2014 were selected. Nested reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) was used to amplify the pol gene, and the amplified products were sequenced. Mega 6.0 software was used to compare the sequencing results with the international reference strains of each subtype. According to phylogenetic tree analysis, the gene subtypes, their characteristics and drug resistance were determined. Results 62 full-sequence fragments of pol gene were obtained, and four subtypes of CRF01-AEEEF07C / BC01B / CRF01AE and B recombination subtypes were obtained. The distribution shows that 58.06% of the total number is 36 / 622 / 622 / 60.65 / 19 / 622 / 01B / 6.4545 / 62mb / 4.84 / 62 / 62respectively. The average dispersion rate of the subtype 1: CRF01-AE is 2.1 鹵0.2%. The average dispersion rate of the subtype CRF07-BC is 2.1 鹵0.2%. The average dispersion rate of the subtype B is 5.7 鹵0.6. The average dispersion rate of the recombination subtype 01B is 6.3 鹵.0.61.The average dispersion rate of the subtype of CRF01-AE is 2.1 鹵0.2and the average dispersion rate of the subtype B is 5.7 鹵0.61.The average dispersion rate of the recombination subtype is 6.3 鹵.0.6. Among 62 cases of drug resistance, 7 cases had mutagenesis to nucleoside reverse transcriptase inhibitor (NRT Isa), non nucleoside reverse transcriptase inhibitor (NNRT Isa) and protease inhibitor (PIsa). Among them, 2 cases had low resistance and 4 cases had potential drug resistance. Conclusion the gene subtypes of newly confirmed HIV-1 infections in Pudong New area of Shanghai from 2011 to April 2014 showed a trend of diversity, mainly CRF01-AE and CRF07-BC, and had formed a local epidemic trend in Pudong New area. The transmission of the new recombinant strain 01B has begun to appear in Pudong New area, and the transmission of HIV-1 primary drug resistant strain is still at a low epidemic level. It is necessary to monitor the epidemic trend closely.
【作者單位】: 上海市浦東新區(qū)疾病預防控制中心;上海市疾病預防控制中心;
【基金】:國家“十二五”艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治重大科技專項(2012ZX10004201)~~
【分類號】:R512.91
【共引文獻】
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【二級參考文獻】
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本文編號:1803353
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