本文選題：HIV-1 + 亞型�。� 參考：《浙江大學》2013年碩士論文

【摘要】：為了解浙江省HIV-1毒株的亞型分布、傳播特征和流行趨勢,我們在2004-2011年間募集部分HIV-1抗體陽性病例,采集靜脈抗凝全血,提取前病毒DNA或病毒RNA,通過基因擴增、序列測定,獲得HIV-1gag和pol基因片段。運用Mega等軟件構(gòu)建Neighbor-Joining系統(tǒng)進化樹,分析基因亞型和遺傳多樣性;運用Simplot和RIP等軟件分析新發(fā)重組毒株的重組斷點；運用Bayesian系統(tǒng)進化分析并結(jié)合流行病學資料,探討浙江省CRF01_AE毒株的起源、傳播和流行趨勢。 研究表明,流行早期,HIV-1通過異性性接觸途徑傳播進入浙江,進而播散流行,從高危人群向一般人群擴散；近幾年,男男性行為人群中的HIV-1播散快速,成為浙江省最主要受累群體。浙江省內(nèi)流行毒株亞型多樣,來源復雜,主要毒株類型為CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC和B’(B),約占93%。但也存在C, G. CRF02_AG, CRF06_CPX等其他類型以及01B新發(fā)重組毒株(3個病例)和CRF07_BC/08_BC再重組毒株(5個病例),表明浙江HIV流行毒株類型復雜,疫情活躍,感染不同毒株的高危人群間存在交叉現(xiàn)象。這些特征符合浙江省艾滋病疫情多種途徑、多種來源、以性接觸傳播為主的傳播流行方式。從基因距離和Neighbor-Joining系統(tǒng)進化樹判斷,B亞型最早進入浙江,然后是B'、CRF01_AE、 CRF08_BC、CRF07_BC。Bayesian系統(tǒng)進化分析顯示,CRF01_AE毒株1998年前后傳播進入浙江,通過異性性接觸和男男性行為進行廣泛播散,并逐步成為浙江省的優(yōu)勢毒株。系統(tǒng)進化分析提示浙江與廣西、江西和安徽等省病例具有直接或間接流行病學關(guān)聯(lián)性。 動態(tài)分析表明浙江省HIV疫情活躍,流行毒株復雜。浙江應加強與江西、安徽等周邊省份聯(lián)系,制定針對重點人群的預防和干預措施,提高防控效率,控制疫情蔓延。
[Abstract]:In order to understand the subtype distribution, transmission characteristics and epidemic trend of HIV-1 strains in Zhejiang Province, we collected some cases of HIV-1 antibody positive from 2004 to 2011, collected whole blood from vein anticoagulant, extracted DNA or viral RNAs from previrus, amplified them by gene amplification, and sequenced them.HIV-1gag and pol gene fragments were obtained.Neighbor-Joining phylogenetic tree was constructed by using Mega and other software to analyze gene subtypes and genetic diversity; Simplot and RIP were used to analyze the recombination breakpoints of new recombinant strains; Bayesian phylogenetic analysis and epidemiological data were used.To study the origin, transmission and epidemic trend of CRF01_AE strain in Zhejiang Province.Studies have shown that in the early stage of the epidemic, HIV-1 spread into Zhejiang through heterosexual contact and spread from high-risk groups to the general population. In recent years, HIV-1 has spread rapidly among men who have sex with men.To become the main affected groups in Zhejiang Province.In Zhejiang province, the subtypes of epidemic strains are various and the sources are complex. The main types of strains are CRF01- AEF07BCCO-CRF08-BC-BC0and BC0F08B, which account for 933% of the total number of strains in Zhejiang province.But there are other types such as C, GCRF02AG, CRF06_CPX, and new recombined strain 01B (3 cases) and recombination strain of CRF07_BC/08_BC (5 cases), which indicate that the prevalent strains of HIV in Zhejiang Province are complex in type and active in epidemic situation, and there is a cross phenomenon among the high risk population infected with different strains.These characteristics are consistent with the multiple ways and sources of AIDS epidemic in Zhejiang Province.Judging from the genetic distance and Neighbor-Joining phylogenetic tree, the subtype B first entered Zhejiang, and then it was BF01AE. CRF08BC07BC.Bayesian phylogenetic analysis showed that the strain of CRF01AE spread into Zhejiang province around 1998, and spread widely through heterosexual contact and male sex.And gradually become the dominant strain of Zhejiang Province.Phylogenetic analysis suggested that Zhejiang had direct or indirect epidemiological correlation with Guangxi, Jiangxi and Anhui provinces.Dynamic analysis showed that the epidemic situation of HIV in Zhejiang Province was active and the epidemic strains were complicated.Zhejiang should strengthen contact with neighboring provinces such as Jiangxi and Anhui, formulate prevention and intervention measures for key people, improve the efficiency of prevention and control, and control the spread of the epidemic.
【學位授予單位】：浙江大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2013
【分類號】：R512.91

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本文編號：1771919