云南省2012-2014年HIV-1流行毒株亞型分布特征
本文選題:艾滋病病毒- 切入點:流行毒株 出處:《中國艾滋病性病》2016年03期
【摘要】:目的研究云南省目前艾滋病病毒1型(HIV-1)流行毒株的亞型分布特點。方法收集2012-2014年云南省14個地市731例在定點醫(yī)院隨訪的HIV感染者或艾滋病患者的血樣及流行病學調查信息,采用反轉錄聚合酶鏈反應(RT-PCR)擴增HIV-1的3′半分子約4.5kb(包含env基因全長),序列校對后用Genotyping、MEGA6.06和BLAST工具軟件確定毒株亞型,分析云南省HIV-1的地區(qū)和人群分布特征。結果共獲得731例樣本的224條半分子序列,各亞型HIV-1毒株及其所占的比例分別為CRF08_BC 58.0%,CRF01_AE 18.3%,CRF07_BC11.6%,未知重組8.0%,B(B′)亞型2.7%和C亞型1.3%。在德宏州和西雙版納主要以CRF01_AE為主,其余地州以CRF08_BC為主,在臨滄、紅河、玉溪、曲靖CRF08_BC占絕對優(yōu)勢(70%)。以上6種亞型的人口學特征(性別、年齡、婚姻狀況、民族)及感染途徑分布差異均無統(tǒng)計學意義(P0.05),B(B′)或C與CRF01_AE、B與C兩種未知型重組在傳播途徑上的分布差異亦無統(tǒng)計學意義。結論運用3′半分子來確定病毒亞型,和前期2008-2009年的研究比較,云南省的HIV-1毒株在地域、人口學、傳播途徑等特征的分布上較之前有變化,仍有新型重組毒株出現(xiàn),應密切監(jiān)測流行趨勢變化。
[Abstract]:Objective to study the subtype distribution of HIV-1 (HIV 1) in Yunnan Province. Methods Blood samples and epidemiological information of 731 patients with HIV infection or AIDS were collected in 14 cities of Yunnan Province from 2012 to 2014. Reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) was used to amplify the 3 '-half molecule of HIV-1 (including the full length of env gene). The subtype of the virus was identified by genotype typing software MEGA6.06 and BLAST software. The regional and population distribution characteristics of HIV-1 in Yunnan Province were analyzed. The subtypes of HIV-1 virus strains and their proportions were CRF08_BC 58.0 and ARF01ACTF01ACTF01ACTF01AE18.33ACTF07A BC11.6, with an unknown recombination of 8.0% and 1.3%. In Dehong and Xishuangbanna, CRF01_AE was the main type, while the rest in Lincang, Honghe, Yuxi, Yuci, and Yuci, the rest of the states were CRF08_BC, ROC, Honghe, Yuxi, Xishuangbanna, Xishuangbanna, Xishuangbanna, and Lincang, Honghe, Yuxi, Qujing CRF08_BC is the dominant factor. Demographic characteristics of the above 6 subtypes (sex, age, marital status, etc.). There was no significant difference in the distribution of the two unknown types of recombination between C and CRF01AEB and C in the route of transmission. Conclusion the subtype of the virus is determined by using the 3 '-half molecule, and there is no significant difference in the distribution of the infection pathway between the two groups (P0.05) or CRF01AEB / C (P < 0.05) or CRF01AEB / C, respectively. Compared with the previous studies in 2008- 2009, the distribution of HIV-1 strains in Yunnan Province has changed in geographical, demographic and transmission characteristics, and there are still new recombinant strains, which should be closely monitored for the change of epidemic trend.
【作者單位】: 云南省傳染病?漆t(yī)院艾滋病關愛中心;中國軍事醫(yī)學科學院微生物流行病研究所;
【基金】:云南省科技廳應用基礎研究計劃自籌項目(2013FZ217) 國家“十二五”傳染病科技重大專項(2012ZX10001-002)~~
【分類號】:R512.91;R181.3
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,本文編號:1689160
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