本文選題：手足口病　切入點(diǎn)：人腸道病毒A組型　出處：《中國疫苗和免疫》2015年01期

【摘要】：目的對青海省2013年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD)的病原譜和人腸道病毒A組71型(Human Enterovirus Group A Type 71,HEV_(A71))的基因特征進(jìn)行分析。方法對青海省2013年送檢的HFMD標(biāo)本,用熒光定量逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法進(jìn)行篩查,對HEV_(A71)陽性標(biāo)本進(jìn)行病毒分離,對分離到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法對VP1編碼區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增及核苷酸序列測定和整理分析,并與HEV_(A71)各基因型和基因亞型的代表株序列構(gòu)建親緣關(guān)系進(jìn)化樹。結(jié)果對青海省2013年分離的62株HEV_(A71)進(jìn)行VP1編碼區(qū)核苷酸序列測定后,分析發(fā)現(xiàn)它們在VP1編碼區(qū)核苷酸水平和氨基酸水平的同源性分別為95.5%~100.0%和99.0%~100.0%。與其他各基因型和基因亞型的HEV_(A71)代表株構(gòu)建的親緣進(jìn)化樹中顯示,青海省HEV_(A71)分離株與C4亞型代表株聚為一簇,屬于C4基因亞型C_(4a)進(jìn)化分支。與2008年、2012年在青海省分離的HEV_(A71)在核苷酸和氨基酸水平的同源性分別為95.8%~97.5%和99.0%~99.7%。結(jié)論2013年,C_(4a)亞型HEV_(A71)在青海省持續(xù)傳播并占有絕對優(yōu)勢,且存在兩條傳播鏈的流行。
[Abstract]:Objective to analyze the pathogenic spectrum of hand foot and mouth disease (HFMD) in 2013 and the genetic characteristics of human Enterovirus Group A Type 71 (HEV A71A). Methods HFMD samples from Qinghai Province in 2013 were analyzed. Reverse Transcription-Polymerase Chain reaction polymerase chain reaction (reverse Transcription-Polymerase Chain RT PCR) method was used to screen the positive specimens of HEV StackA71, and to extract the nucleic acid from the virus. The coding region of VP1 was amplified by RT-PCR, and the nucleotide sequence was sequenced and analyzed. The phylogenetic tree was constructed with the representative strains of each genotype and gene subtype. Results the nucleotide sequences of the VP1 coding region of 62 HEV / A71 strains isolated in 2013 in Qinghai Province were determined. It was found that the homology of nucleotide level and amino acid level in VP1 coding region were 95.5% and 99.00.0%, respectively. In Qinghai Province, HEVSHAN A71) the isolates and C4 subtype representative strains were clustered into a cluster. The homology of HEVS A71) at nucleotide and amino acid levels was 95.87.5% and 99.00.0.Conclusion in 2013, HEVART A71), a subtype of C _ 4 gene subtype, continued to spread and had an absolute advantage in Qinghai Province, and the homology was 95.8g / 97.5% and 99.00.Conclusion in 2013, HEVS-1) subtype of C _ 4 gene subtype was continuously transmitted and had an absolute advantage in Qinghai Province. And there are two transmission chains of popularity.
【作者單位】： 中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所 衛(wèi)生部醫(yī)學(xué)病毒學(xué)和病毒病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 世界衛(wèi)生組織西太平洋區(qū)脊髓灰質(zhì)炎參比實(shí)驗(yàn)室;青海省疾病預(yù)防控制中心;
【基金】：國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃)重要病原體變異規(guī)律與致病機(jī)制研究子課題(編號:2011CB504902) 十二五國家科學(xué)技術(shù)艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治重大專項(xiàng)病毒性傳染病病原譜流行規(guī)律及變異研究課題(編號:2013ZX10004202)
【分類號】：R512.5

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：1662806