基于HCR技術(shù)對(duì)流感病毒H1N1新型可視化檢測(cè)方法的建立
本文選題:流感病毒H1N1 切入點(diǎn):雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng) 出處:《黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:極具感染性的流感病毒,尤其是甲型流感病毒,會(huì)引發(fā)全球范圍內(nèi)流感大規(guī)模爆發(fā),造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失,長(zhǎng)期威脅人類與動(dòng)物健康安全。因此快速、準(zhǔn)確地對(duì)流感病毒檢測(cè)是防控流感疫情的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。為了實(shí)現(xiàn)對(duì)流感病毒快速、方便的檢測(cè),我們建立了三種流感病毒H1N1的可視化檢測(cè)方法。本研究基于雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Hybridization Chain Reaction,HCR)核酸擴(kuò)增技術(shù)結(jié)合膠體金核酸試紙條信號(hào)輸出方式,實(shí)現(xiàn)對(duì)流感病毒H1N1簡(jiǎn)便、快速的可視化檢測(cè)。具體如下:1利用HCR信號(hào)放大技術(shù)結(jié)合膠體金核酸試紙條,建立對(duì)流感病毒H1N1可視化檢測(cè)方法。針對(duì)H1N1的特異性核酸片段設(shè)計(jì)了標(biāo)記6-羧基熒光素(FAM)的抓取探針CP與檢測(cè)探針DP,當(dāng)有H1N1 RNA存在時(shí),會(huì)形成標(biāo)記生物素(Biotin)的HCR產(chǎn)物與標(biāo)記FAM-CP的核酸復(fù)合產(chǎn)物,結(jié)合試紙條加樣檢測(cè),會(huì)被檢測(cè)線上的anti-FAM抓住,并通過鏈霉親和素(SA)與生物素(Biotin)之間的特異性親和力,將包被鏈霉親和素(SA)的紅色膠體金粒子(Au NPs)固定到檢測(cè)線上,顯示出紅色條帶,實(shí)現(xiàn)對(duì)H1N1的可視化檢測(cè),可達(dá)到2.96 p M的檢測(cè)限。2分子信標(biāo)(Molecular beacons,MBs)核酸探針技術(shù)與HCR信號(hào)放大技術(shù)結(jié)合,實(shí)現(xiàn)信號(hào)雙重放大。當(dāng)存在檢測(cè)靶標(biāo)H1N1 RNA時(shí),H1N1 RNA會(huì)與MBs結(jié)合,使MBs構(gòu)象發(fā)生改變,進(jìn)而引發(fā)兩段輔助探針Helper A、Helper B與MBs雜交,形成新的DNA雙鏈,將靶標(biāo)H1N1替換下來,H1N1 RNA循環(huán)結(jié)合其他MBs,實(shí)現(xiàn)信號(hào)一重放大。暴露出的MBs莖部設(shè)計(jì)有與檢測(cè)探針DP的互補(bǔ)序列,能夠與標(biāo)記Biotin的HCR產(chǎn)物有效結(jié)合,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)信號(hào)的再次放大。結(jié)合試紙條傳感器實(shí)現(xiàn)流感病毒H1N1的可視化檢測(cè),可達(dá)到21.9 f M的檢測(cè)限。3將雙鏈特異性核酸酶(DSN)與HCR信號(hào)放大技術(shù)相結(jié)合,設(shè)計(jì)了同時(shí)標(biāo)記生物素(Biotin)與6-羧基熒光素(FAM)的抓取探針CP,當(dāng)存在H1N1 RNA時(shí),CP與H1N1 RNA形成雜交雙鏈,由于DSN酶的特性,酶切DNA-RNA雜合雙鏈中的互補(bǔ)DNA,RNA可以循環(huán)利用,結(jié)合其他CP,實(shí)現(xiàn)信號(hào)一重放大。由CP釋放出的DNA短鏈與標(biāo)記Biotin的H1、H2引發(fā)HCR反應(yīng),實(shí)現(xiàn)信號(hào)雙重放大。結(jié)合試紙條傳感器實(shí)現(xiàn)流感病毒H1N1的可視化檢測(cè),可達(dá)到3.12 f M的檢測(cè)限。綜上所述,本研究建立的三種對(duì)流感病毒H1N1的可視化檢測(cè)方法,能夠?qū)崿F(xiàn)方便、快速的靶標(biāo)檢測(cè),節(jié)省檢測(cè)時(shí)間與成本,對(duì)流感病毒的基層大規(guī)模篩檢與疫情防控具有應(yīng)用價(jià)值。
[Abstract]:Highly infectious influenza viruses, especially influenza A viruses, can cause large-scale outbreaks of influenza worldwide, causing huge economic losses and long-term threats to human and animal health and safety. Accurate detection of influenza viruses is a key link in the prevention and control of influenza outbreaks. In order to achieve rapid and convenient detection of influenza viruses, We have established three visual detection methods for influenza virus H1N1. This study is based on hybrid chain reaction (hybridization Chain reaction) nucleic acid amplification technique combined with the method of colloidal gold nucleic acid test strip signal output to realize a simple and convenient method for influenza virus H1N1. Rapid visual detection. Specific as follows: 1 using HCR signal amplification technology combined with colloidal gold nucleic acid test paper, A visual detection method for influenza virus H1N1 was established. The grab probe CP and the detection probe DPDP RNA were designed for the specific nucleic acid fragment of H1N1. When there was H1N1 RNA, the grab probe CP and the detection probe were designed. The HCR product labeled biotinin and the nucleic acid compound product labeled FAM-CP, combined with the test strip to add sample detection, will be caught by the anti-FAM on the detection line, and the specific affinity between the HCR product and biotinin can be obtained by using streptavidin) and biotinin. The red colloidal gold particle (au NPs) coated with streptavidin (SAA) was immobilized on the detection line, and the red band was displayed to realize the visual detection of H1N1. The detection limit of 2.96 pm can be achieved by combining the molecular beaconsm nucleic acid probe technique with the HCR signal amplification technique to realize the double amplification of the signal. When the detection target H1N1 RNA exists, the H 1 N 1 RNA will combine with the MBs, and the conformation of MBs will change. Then the two-segment auxiliary probe Helper Agna Helper B was hybridized with MBs to form a new double strand of DNA. The target H1N1 was replaced by the H1N1 RNA cycle and combined with other MBs to realize signal amplification. The exposed stem of MBs was designed with complementary sequence to detect the probe DP. It can effectively combine with the HCR products labeled with Biotin, and then realize the signal re-amplification. In combination with the test strip sensor, the visual detection of influenza virus H1N1 can be realized. The detection limit of 21.9 FM can be reached by combining double-strand specific nuclease (DSNs) with HCR signal amplification technique. A grab probe, CP-labeled biotinin) and 6-carboxyfluorescein (FAM), was designed. When there was H1N1 RNA, CP and H1N1 RNA formed hybrid double strands. Because of the characteristic of DSN enzyme, the complementary DNA-RNA RNA in the DNA-RNA heterozygous double strand can be recycled and combined with other CPs to amplify the signal. The short DNA strand released by CP induces HCR reaction with the labeled Biotin H _ (1) O _ (2). Realize double amplification of signal. Realize the visual detection of influenza virus H1N1 with test strip sensor, can reach the detection limit of 3.12 FM. To sum up, the three visual detection methods of influenza virus H1N1 established in this study can be realized conveniently. Rapid target detection saves detection time and cost and is valuable for mass screening of influenza virus and prevention and control of influenza virus.
【學(xué)位授予單位】:黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R440;R511.7
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