探針熔解曲線法快速檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌注射類二線藥耐藥突變
本文選題:結(jié)核分枝桿菌 切入點(diǎn):注射類二線藥 出處:《中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào)》2015年05期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的評(píng)價(jià)結(jié)核分枝桿菌注射類二線藥耐藥突變檢測(cè)試劑盒MeltPro TB/SL的分析性能以及臨床性能。方法首先使用企業(yè)參考品對(duì)試劑盒的突變檢出能力進(jìn)行考察,之后將野生型基因組DNA以10倍梯度稀釋后考察試劑盒的最低檢測(cè)限,使用野生型質(zhì)粒以及含常見(jiàn)耐藥突變的質(zhì)粒以不同突變比例混合考察試劑盒檢測(cè)不均一耐藥樣本的能力,并使用23株非結(jié)核分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株考察試劑盒的分析特異性,最后使用241份臨床分離株對(duì)試劑盒進(jìn)行臨床評(píng)價(jià)。結(jié)果該試劑盒可以將9種耐藥相關(guān)突變與1種野生型多態(tài)性與野生型進(jìn)行區(qū)分。可以檢測(cè)到低至5個(gè)拷貝的野生型基因組DNA。當(dāng)突變比例為30%或更高時(shí),試劑盒可以將其與野生型進(jìn)行區(qū)分。23種非結(jié)核分枝桿菌的結(jié)果顯示該試劑盒有良好的特異性。和比例法藥敏試驗(yàn)進(jìn)行對(duì)比,該試劑盒的臨床靈敏度為卡那霉素90.0%(9/10),阿米卡星80.0%(8/10),卷曲霉素85.7%(6/7);特異性為卡那霉素98.8%(85/86),阿米卡星98.8%(85/86),卷曲霉素96.6%(86/89)。試劑盒檢測(cè)結(jié)果與測(cè)序結(jié)果一致。結(jié)論該試劑盒靈敏度高、特異性好,可以快速、準(zhǔn)確地檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌注射類二線藥常見(jiàn)的耐藥突變,有望應(yīng)用于臨床。
[Abstract]:Objective to evaluate the analytical and clinical properties of MeltPro TB/SL kit for detection of second line drug resistance in Mycobacterium tuberculosis injection. After dilution of wild type genomic DNA with 10 times gradient, the minimum detection limit of the kit was examined. The ability of using wild type plasmids and plasmids containing common drug-resistant mutations to detect heterogeneous drug resistant samples was studied by mixing the kits with different mutation proportions. The specificity of the kit was investigated by using 23 standard strains of non-tuberculous Mycobacterium tuberculosis. Finally 241 clinical isolates were used to evaluate the kit. Results the kit could distinguish 9 drug-resistance related mutations from 1 wild type polymorphism and detect as low as 5 copies of the wild type. When the mutation ratio is 30% or higher, The results showed that the kit had good specificity and was compared with the proportional susceptibility test. The clinical sensitivity of the kit is as follows: kanamycin 90.010 / 10, amicacin 80.010 / 810, entramycin 85.7 / 875 / 7; specificity kanamycin 98.8885 / 86C, amicacin 98.88.885 / 86C, amicacin 98.88.85 / 860.The results of the kit are in agreement with the sequencing results. Conclusion this kit has high sensitivity and good specificity. It can be used for rapid and accurate detection of common drug resistance mutations in mycobacterium tuberculosis injection-like second-line drugs, which is expected to be used in clinical practice.
【作者單位】: 廈門大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院"細(xì)胞應(yīng)激生物學(xué)"國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室分子診斷教育部工程研究中心;中國(guó)食品藥品檢定研究院結(jié)核病疫苗室;
【基金】:國(guó)家“十一五”重大專項(xiàng)(No.2008ZX10003-004)資助~~
【分類號(hào)】:R446.5;R52
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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3 張s,
本文編號(hào):1622775
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