本文關(guān)鍵詞： 甲型HN流感 血凝素 分子特征 進化分析　出處：《微生物學(xué)通報》2017年02期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：【目的】為了解中國地區(qū)2009-2015年甲型H1N1流感病毒流行態(tài)勢,分析血凝素(Hemagglutinin,HA)基因的變異情況及其遺傳進化特征。【方法】匯集國家流感中心2009-2015年流感周報的流感流行數(shù)據(jù),分析甲型H1N1流感的流行病學(xué)特征;從全球共享禽流感數(shù)據(jù)倡議組織數(shù)據(jù)庫及美國國家生物技術(shù)中心數(shù)據(jù)庫下載甲型H1N1流感病毒HA基因序列,采用生物學(xué)軟件進行系統(tǒng)進化和遺傳特性的分析�！窘Y(jié)果】2009-2015年全國共發(fā)生4次甲型H1N1流感的流行高峰。2009-2015年毒株與參考毒株A/California/07/2009(H1N1)的HA基因同源性逐年降低。遺傳進化分析顯示同一年份的毒株在系統(tǒng)進化樹上基本呈現(xiàn)集中分布,2011年的毒株獨立形成2個分支。分子特征表現(xiàn)為HA基因的4個抗原決定簇氨基酸位點均有變異,其中Ca區(qū)的203位、Sa區(qū)的163位和Sb區(qū)的185位氨基酸位點逐漸替換為新的氨基酸。除2010年與2012年,其他年份的毒株通過不同模型均得到正向壓力選擇HA氨基酸位點240。【結(jié)論】甲型H1N1流感在中國地區(qū)成為主要流行的亞型之一。HA基因與其編碼的氨基酸逐年變異,未來進一步的流感監(jiān)測能力還需加強。
[Abstract]:[objective] to understand the epidemic situation of influenza A (H1N1) virus in China from 2009 to 2015, to analyze the variation of hemagglutinin A gene and its genetic and evolutionary characteristics. [methods] to collect the influenza epidemic data reported by the National Influenza Center for 2009-2015. To analyze the epidemiological characteristics of influenza A (H1N1), to download the HA gene sequence of influenza A (H1N1) virus from the database of the Initiative for Global sharing of Avian Influenza data and the database of the National Center for Biotechnology of the United States. The phylogenetic and genetic characteristics were analyzed by using biological software. [results] the HA gene homology of four influenza A (H1N1) strains occurred in China from 2009-2015 to 2009-2015 decreased year by year with reference strain A / California / 07 / 2009 H1 / N _ 1. The results showed that the virus strains of the same year showed concentrated distribution in phylogenetic trees, and in 2011 the strains formed two branches independently. The molecular characteristics showed that the amino acid loci of the four antigenic determinants of HA gene were all mutated. Among them, the amino acid sites at position 203 of Ca region and 185 of SB region were gradually replaced by new amino acids, except 2010 and 2012. In other years, HA amino acid loci were obtained by different models. [conclusion] A (H1N1) influenza has become one of the most prevalent subtypes in China. The HA gene and its encoded amino acids vary year by year. Further surveillance capacity for influenza needs to be strengthened in the future.
【作者單位】： 東南大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院;南京市疾病預(yù)防控制中心;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(No.81273143) 江蘇省“六大人才高峰”第十一批高層次人才選拔培養(yǎng)資助項目(No.2014-WSN-40) 江蘇省科技計劃(省重點研發(fā)計劃)資助項目(No.BE2015679)~~
【分類號】：R511.7

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本文編號：1551264