2013~2014年廣西風(fēng)疹病毒分子流行病學(xué)分析
本文關(guān)鍵詞: 風(fēng)疹病毒 分子流行病學(xué) 基因型 出處:《中國疫苗和免疫》2015年06期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的研究廣西風(fēng)疹病毒基因型別及特征,為預(yù)防和控制風(fēng)疹提供分子流行病學(xué)基線數(shù)據(jù)。方法對(duì)2013~2014年廣西出疹病例中風(fēng)疹病毒核酸陽性的病原學(xué)標(biāo)本,使用淋巴信號(hào)激活因子轉(zhuǎn)染的非洲綠猴腎細(xì)胞(Vero Cell Transfected to Express the Human Signaling Lymphocyte Activation Molecule,Vero/SLAM)進(jìn)行病毒分離,再應(yīng)用逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)對(duì)分離到的風(fēng)疹病毒進(jìn)行E1基因的945個(gè)核苷酸(8633~9577nt)片段擴(kuò)增,并對(duì)其PCR產(chǎn)物進(jìn)行序列測(cè)定和分析。結(jié)果從收到的148份風(fēng)疹核酸陽性咽拭子中分離培養(yǎng)出119株風(fēng)疹病毒株,其中20株為1E基因型,99株為2B基因型,來源于9個(gè)不同的地市。其中2B基因型風(fēng)疹毒株與其他省2B基因型毒株的同源性達(dá)98.77%~99.86%。所有119株風(fēng)疹分離株在N-型糖基化位點(diǎn)和抗原表位位點(diǎn)均未發(fā)生突變,6株分離株在血凝抑制位點(diǎn)和中和位點(diǎn)上發(fā)生了突變,且均為2B基因型。結(jié)論廣西2013~2014年風(fēng)疹病毒在人群中以1E基因型和2B基因型共存循環(huán),2B基因型為優(yōu)勢(shì)基因型,1E基因型可能正在逐步被2B基因型所代替。E1基因氨基酸序列雖保守,但亦有些毒株發(fā)生突變,今后應(yīng)繼續(xù)加強(qiáng)與完善廣西風(fēng)疹病原學(xué)監(jiān)測(cè)。
[Abstract]:Objective to study the gene types and characteristics of rubella virus in Guangxi, and to provide molecular epidemiological baseline data for the prevention and control of rubella. Methods the pathogenic specimens of rubella virus nucleic acid positive in Guangxi from 2003 to 2014 were collected. Vero Cell Transfected to Express the Human Signaling Lymphocyte Activation molecules were used to isolate the virus from African green monkey kidney cells transfected with lymphoid signal activator. Reverse transcription-polymerase chain reaction (reverse Transcription-Polymerase Chain reaction reverse reverse PCR) was used to amplify the 945 nucleotides of the E1 gene of the isolated rubella virus. Results 119 rubella virus strains were isolated from 148 rubella nucleic acid positive pharynx swabs, of which 20 were 1E genotypes and 99 were 2B genotypes. The homology of rubella virus strains of genotype 2B with that of other provinces was 98.777.99. 86. All 119 isolates of rubella did not mutate at N-type glycosylation sites and epitope sites. Mutation occurred at the inhibition and neutralization sites of hemagglutination. Conclusion the genotype of rubella virus in Guangxi from 2013 to 2014 may be replaced by genotype 2B instead of amino acid sequence of .E1 gene, although the genotype of 1e and coexisting circulating genotype of 2B is the dominant genotype. But there are some strains mutated, we should continue to strengthen and improve the monitoring of rubella etiology in Guangxi.
【作者單位】: 廣西壯族自治區(qū)疾病預(yù)防控制中心;
【基金】:廣西壯族自治區(qū)衛(wèi)生廳科學(xué)研究課題(合同號(hào):Z2011274、Z2011273、S201310-05)
【分類號(hào)】:R511.2
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,本文編號(hào):1521889
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