本文關(guān)鍵詞： HIV- 基因 gag 聚合酶鏈反應(yīng) 變異　出處：《中華疾病控制雜志》2015年12期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的分析新疆地區(qū)人類免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)感染者中流行的CRF07_BC亞型毒株gag基因的遺傳變異特性。方法對(duì)75例HIV-1感染者分別于間隔6個(gè)月的兩個(gè)時(shí)間點(diǎn)采集標(biāo)本。抽提標(biāo)本RNA反轉(zhuǎn)錄后用巢式聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增gag基因片段,將得到的2次序列進(jìn)行亞型、同源性、基因離散率和選擇壓力分析。結(jié)果進(jìn)化樹上同一樣本的2次序列聚集成一個(gè)小分枝,有15大簇分枝的共同特征是每枝上的幾個(gè)毒株來源的新疆下屬地區(qū)相同且同源相似性在94.2%~99.4%之間,具有這種特征的標(biāo)本超過全部標(biāo)本量的半數(shù);與首次采樣的序列相比,6個(gè)月后的樣本序列組內(nèi)基因離散率、與標(biāo)準(zhǔn)株間的組間基因離散率均呈現(xiàn)出增加的趨勢(shì);基因選擇壓力分析表明新疆地區(qū)的HIV-1毒株正受到正向選擇壓力。結(jié)論進(jìn)化樹上每簇分枝上的幾個(gè)樣本來源的地區(qū)相同和序列高度同源提示每簇上的幾例標(biāo)本很有可能是由同一株親本毒株進(jìn)化而來的;基因離散率隨流行時(shí)間的增長(zhǎng)而增加和基因選擇壓力分析結(jié)果均表明HIV-1毒株發(fā)生著連續(xù)的定向突變。
[Abstract]:Objective to analyze the genetic variation characteristics of gag gene of CRF07_BC subtype 1 in human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infected people in Xinjiang. Methods 75 cases of HIV-1 infected with HIV were collected at two time intervals of 6 months. RNA reverse transcription was used to amplify the gag gene fragment by nested polymerase chain reaction (NPCR). The subtype, homology, gene dispersion rate and selection pressure were analyzed. Results the second order sequences of the same sample in the evolutionary tree were clustered into a small branch. The common characteristic of 15 clusters of branches is the same and homologous similarity of 94.2% and 99.4% in the subordinate regions of Xinjiang from several strains on each branch, and more than half of the total samples have this characteristic. Compared with the first sampling sequence, the gene dispersion rate in the sample group after 6 months and the intergroup gene dispersion rate among the standard plants showed an increasing trend. Genetic selection pressure analysis showed that the HIV-1 strains in Xinjiang were under positive selection pressure. Conclusion the same region and high homology of several samples on each branch of the evolutionary tree suggest that several specimens on each cluster are very positive. It may have evolved from the same parent strain; The increase of gene dispersion rate with the increase of epidemic time and the analysis of gene selection pressure showed that there were continuous directional mutations in the HIV-1 strain.
【作者單位】： 新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院傳染病科;復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院暨公共衛(wèi)生安全教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;新疆維吾爾自治區(qū)疾病預(yù)防控制中心性病/艾滋病預(yù)防控制中心;上海德西門診部全科;新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院老年病科;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(81373062) 烏魯木齊市科學(xué)技術(shù)計(jì)劃項(xiàng)目(Y121320017)
【分類號(hào)】：R512.91

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1 王曉黎;抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療有效的HIV-1感染者停止預(yù)防卡氏肺孢子蟲肺炎安全嗎[J];國(guó)外醫(yī)學(xué)(寄生蟲病分冊(cè));2000年05期

2 李春元;HIV-1感染者開始高效抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療的最佳時(shí)間探討[J];國(guó)外醫(yī)學(xué)(流行病學(xué)傳染病學(xué)分冊(cè));2003年02期

3 李莉平;曾耀英;曾祥鳳;狄靜芳;林長(zhǎng)樂;肇靜嫻;;人絨毛膜促性腺激素在HIV-1感染中作用的體外研究[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2006年02期

4 劉傳新,邢輝,蘇生利,潘品良,黃濤,范秀娟,馮毅,傅繼華,趙世立,邵一鳴;山東省某些高危人群HIV-1感染者分子流行病學(xué)研究[J];中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志;2000年03期

5 薛以樂;周磊明;鄭曉虹;蓋晶;宮菊麗;寧鎮(zhèn);盧偉;鐘平;康來儀;;一起家庭內(nèi)HIV-1感染的分子流行病學(xué)研究[J];上海預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2007年07期

6 徐小元,陳力,斯崇文,王勤環(huán),Jean Claude Chermann;HIV-1感染者外周血單個(gè)核細(xì)胞缺損病毒基因的研究[J];北京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2000年04期

7 張靜,于修平,李盛長(zhǎng),宋長(zhǎng)芹,傅繼華,尤向東;HIV-1感染者及其密切接觸者HIV-1抗性基因的研究[J];山東大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2004年01期

8 李軍;;原發(fā)性HIV-1感染中不自溶細(xì)胞CD_8T細(xì)胞抗HIV反應(yīng)[J];傳染病信息;1995年01期

9 褚福亮;徐東平;金磊;高福;王福生;;應(yīng)用四聚體酶聯(lián)免疫斑點(diǎn)法和細(xì)胞內(nèi)細(xì)胞因子染色法檢測(cè)HIV-1感染者體內(nèi)特異性細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞的研究[J];中國(guó)艾滋病性病;2007年01期

10 王劍虹;2種重組HIV-1包膜疫苗在HIV-1感染婦女的新生兒中的安全性[J];國(guó)外醫(yī)學(xué).預(yù)防.診斷.治療用生物制品分冊(cè);2001年06期

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1 何艷;鄭煜煌;周華英;張春迎;李慧;諶資;劉猛;劉純;;高效抗逆轉(zhuǎn)錄病毒療法治療HIV-1感染者的免疫重建和免疫激活標(biāo)志變化研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)全國(guó)第九次感染病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2006年

2 陳偉烈;唐小平;唐漾波;魏紹靜;朱托夫;;長(zhǎng)期不進(jìn)展HIV-1感染者HIV-1準(zhǔn)種膜蛋白V3環(huán)氨基酸特點(diǎn)分析[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第四次全國(guó)艾滋病、病毒性丙型肝炎暨全國(guó)熱帶病學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2009年

3 趙秀英;吳昊;鄭伯健;;趨化因子SDF-1α在外周血淋巴細(xì)胞中轉(zhuǎn)錄與HIV-1感染的相關(guān)研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第四次全國(guó)艾滋病、病毒性丙型肝炎暨全國(guó)熱帶病學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2009年

4 張瑞;張鵬宇;;夏枯草多糖對(duì)HIV-1感染者PBMC的免疫調(diào)節(jié)作用[A];21世紀(jì)男科學(xué)——中華醫(yī)學(xué)會(huì)第五次全國(guó)男科學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2004年

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1 張 瑞;夏枯草多糖 能提高HIV-1感染者低下的IL-2水平[N];中國(guó)中醫(yī)藥報(bào);2005年

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1 范雪莉;HIV-1感染的PCR定量方法研究及HIV核心蛋白基因的結(jié)構(gòu)分析和克隆[D];中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué);1996年

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1 徐娜;吸毒人群包皮環(huán)切與HIV-1感染關(guān)系的病例對(duì)照研究及其包皮HIV-1生物易感性的探討[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2013年

2 張仁芳;HIV-1感染者對(duì)重組乙型肝炎疫苗免疫應(yīng)答的研究[D];復(fù)旦大學(xué);2009年

3 金鑫;中國(guó)HIV-1感染者NKT細(xì)胞與疾病進(jìn)展的相關(guān)性研究[D];中國(guó)醫(yī)科大學(xué);2008年

4 馬力;MiR-1236抑制VprBP翻譯調(diào)節(jié)HIV-1復(fù)制研究及HIV-1感染后長(zhǎng)期不發(fā)病中國(guó)人群基因多態(tài)性分析[D];蘇州大學(xué);2014年

5 師玲玲;HIV-1感染相關(guān)基因DC-SIGN/DC-SIGNR多態(tài)性及流行病學(xué)因素初步分析[D];暨南大學(xué);2005年

6 汪靜;中國(guó)部分地區(qū)HIV-1感染嬰兒基因型耐藥及亞型研究[D];中國(guó)疾病預(yù)防控制中心;2013年

7 吳還梅;干擾素刺激基因15在HIV-1感染中的作用研究[D];復(fù)旦大學(xué);2013年

8 賀梅;NKG2D受體和配體的表達(dá)及在HIV-1感染中的臨床意義[D];中南大學(xué);2013年

9 張海蘭;西安市MSM人群HIV-1感染特征及分子流行病學(xué)研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2014年

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本文編號(hào)：1497369