2010-2012年北京市部分地區(qū)MSM中HIV-1急性期感染者的毒株亞型和流行狀況
本文關(guān)鍵詞: 艾滋病病毒型 男男性行為者 基因亞型 系統(tǒng)進化樹 出處:《中國艾滋病性病》2017年05期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的研究北京市男男性行為者(MSM)艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者的毒株亞型、流行現(xiàn)狀和變化規(guī)律。方法采用單純隨機抽樣的方法,抽取北京佑安醫(yī)院2010-2012年新發(fā)現(xiàn)的MSM HIV-1急性期感染者的血樣共100人份,采樣前均未進行抗病毒治療。提取外周血單核細胞(PBMC)中的脫氧核糖核酸(DNA),用巢式聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)擴增病毒env、gag和pol基因區(qū)序列,三區(qū)中如有擴增失敗,則嘗試提取血漿中的核糖核酸(RNA),反轉(zhuǎn)錄后進行巢式PCR擴增。PCR產(chǎn)物測序后進行基因亞型分析。計算pol基因區(qū)樣本間基因離散率,并做系統(tǒng)進化樹分析。結(jié)果有96份樣本的基因序列擴增成功,檢出的基因亞型有CRF01_AE、CRF07_BC、B、B′、CRF55_01B、CRF65_cpx和未知亞型,所占比例依次為42.7%、25.0%、15.6%、1.0%、1.0%、3.1%和11.5%。前3種亞型合計占83.3%。各亞型所占比例與相關(guān)文獻相比有明顯變化,表現(xiàn)為CRF07_BC亞型所占比例的快速上升和B亞型所占比例的顯著下降。發(fā)現(xiàn)了新亞型CRF65_cpx、CRF55_01B和一些未知亞型。結(jié)論 2010-2012年,北京市MSM HIV-1急性期感染者的HIV-1毒株亞型分布與相關(guān)報道相比已經(jīng)發(fā)生改變,建議對北京地區(qū)HIV-1毒株的流行和變異進行密切監(jiān)測。
[Abstract]:Objective to study the subtype, prevalence and variation of HIV 1 (HIV-1) infection in MSM (MSM) patients in Beijing. Methods A simple random sampling method was used. A total of 100 blood samples were collected from newly discovered MSM HIV-1 patients in Beijing Youan Hospital from 2010 to 2012. DNA was extracted from peripheral blood mononuclear cells (PBMC) and env was amplified by nested polymerase chain reaction (PCR). Gag and pol gene sequences, if there is a failure of amplification in the three regions, try to extract RNA RNA from the plasma. After reverse transcription, nested PCR amplification. PCR products were sequenced and gene subtypes were analyzed. The gene dispersion rate among samples of pol gene region was calculated. The results of phylogenetic tree analysis showed that 96 samples were amplified successfully, and the gene subtypes detected were CRF01AECOF07BCnBC01-CRF5501B. The proportion of CRF65_cpx and unknown subtypes was 42.7% and 25.0%, and 15.6%, 1.0% and 1.0%, respectively. The first three subtypes accounted for 83.3% of the total. The proportion of each subtype was significantly different from that of the related literature. The results showed that the proportion of CRF07_BC subtype increased rapidly and that of B subtype decreased significantly. A new subtype CRF65_cpx was found. CRF55_01B and some unknown subtypes. Conclusion 2010-2012. The distribution of HIV-1 subtypes of MSM HIV-1 infected patients in Beijing has changed compared with the related reports. It is suggested to monitor closely the prevalence and variation of HIV-1 strains in Beijing.
【作者單位】: 中國疾病預防控制中心性病艾滋病預防控制中心;首都醫(yī)科大學附屬北京佑安醫(yī)院感染中心;
【基金】:北京市醫(yī)院管理局臨床醫(yī)學發(fā)展專項經(jīng)費(ZY201401) 北京市艾滋病研究重點實驗室(BZ0089) 首都衛(wèi)生發(fā)展科研專項基金項目(首發(fā)2016-1-2182) 北京市科技計劃資助(D141100000314002,D141100000314005) 國家“十二五”科技重大專項(2012ZX10001001-001) 中美艾滋病防治合作項目(2016-2017,4.2)~~
【分類號】:R181.3;R512.91
【正文快照】: 男男性行為者(MSM)是艾滋病病毒(HIV)感染的高危人群之一。由于易發(fā)生非保護性性行為、多性伴侶以及商業(yè)性性行為等高危性行為,在HIV感染者中MSM所占比重逐年增加[1-2]。據(jù)中國疾病預防控制中心統(tǒng)計,我國新報告的HIV感染者和艾滋病病人中,MSM所占比例已從2006年的2.5%上升到20
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1 本報記者 王均珠;MSM人群“感艾”率高于全國平均水平[N];貴陽日報;2008年
,本文編號:1484757
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