浙江省龍泉市漢坦病毒宿主嚙齒類動(dòng)物的物種鑒定及譜系地理學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2018-01-29 01:57
本文關(guān)鍵詞: 腎綜合征出血熱 漢坦病毒 嚙齒類動(dòng)物 物種鑒定 遺傳距離 種系發(fā)育樹 譜系地理分析 出處:《湖北大學(xué)》2014年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:腎綜合征出血熱是由漢坦病毒感染引起的急性病毒性傳染病。中國是受其危害最大的國家,而龍泉市是浙江省最主要的腎綜合征出血熱疫區(qū)。 漢坦病毒是屬于布尼亞科的單股、負(fù)鏈RNA病毒。2012年國際病毒分類委員會(huì)確定有24種漢坦病毒,分屬3類宿主,分別為嚙齒目、食蟲目和翼手目。目前發(fā)現(xiàn)的能使人致病的病毒均發(fā)現(xiàn)于嚙齒類動(dòng)物。 嚙齒目(Rodentia)動(dòng)物是現(xiàn)存世界上物種種類、數(shù)量最大的哺乳動(dòng)物,包括30個(gè)科,超過2000個(gè)物種。嚙齒類動(dòng)物分布廣泛,在形態(tài)和生態(tài)上具有高度的分化,F(xiàn)研究發(fā)現(xiàn),最早的嚙齒類動(dòng)物出現(xiàn)在古新世時(shí)期,距今六千五百萬年。在自然界中,嚙齒類動(dòng)物至少攜帶60種對(duì)人類致病的病原體,包括病毒、細(xì)菌以及寄生蟲等對(duì)人類高危害的病原體。如今,嚙齒類動(dòng)物廣泛存在于居民區(qū)、農(nóng)耕區(qū)等與人類密切相關(guān)的生境,極大的危害了人類的健康安全。 形態(tài)學(xué)鑒定是傳統(tǒng)的鑒定哺乳動(dòng)物的主要手段,主要根據(jù)動(dòng)物的頭骨、牙齒、毛發(fā)等形態(tài)學(xué)上的特征進(jìn)行鑒定。但對(duì)于親緣關(guān)系比較近或形態(tài)上有損傷的動(dòng)物,形態(tài)學(xué)鑒定則往往會(huì)受到限制。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,利用分子方法結(jié)合形態(tài)學(xué)的手段對(duì)物種進(jìn)行鑒定已漸漸成為主流。 本課題組對(duì)浙江省龍泉地區(qū)的嚙齒類動(dòng)物進(jìn)行了形態(tài)學(xué)及分子生物學(xué)的物種鑒定,同時(shí)對(duì)嚙齒類動(dòng)物進(jìn)行漢坦病毒的檢測(cè)。本文報(bào)道對(duì)嚙齒類動(dòng)物的物種鑒定及種群的種系發(fā)育的研究。 目的:浙江省龍泉市自1974年起一直是腎綜合征出血熱的高發(fā)地區(qū),而這種疾病恰恰是嚙齒類動(dòng)物將病毒傳播給人所引起,因此對(duì)當(dāng)?shù)貒X類動(dòng)物進(jìn)行物種鑒定及種群調(diào)查,對(duì)疾病的預(yù)防控制有重要作用。 方法:用鼠籠對(duì)嚙齒類動(dòng)物進(jìn)行捕捉,進(jìn)行形態(tài)學(xué)鑒定。解剖后取臟器組織提取核酸,對(duì)線粒體基因Cytb、CO1、16S以及核基因IRBP進(jìn)行PCR擴(kuò)增。并對(duì)擴(kuò)增的到序列盡行核苷酸堿基組成、替代率,種群的種內(nèi)、種間遺傳距離進(jìn)行分析,同時(shí)使用最大似然法構(gòu)建種系發(fā)育樹進(jìn)行各基因片段的比較和物種的地理分布分析。 結(jié)果:2013年,我們?cè)谡憬↓埲泄膊蹲X類動(dòng)物640只,經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定,全為嚙齒類動(dòng)物。包括黑線姬鼠、巢鼠、黃胸鼠、黃毛鼠、褐家鼠、社鼠、東方田鼠。各抽取5只進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定后發(fā)現(xiàn),形態(tài)學(xué)鑒定存在錯(cuò)誤,即一個(gè)黑腹絨鼠被歸類為東方田鼠,一個(gè)食蟲目的喜馬拉雅水麝,
本文編號(hào):1472181
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