結(jié)核潛伏感染蛋白Rv2657c T細(xì)胞和B細(xì)胞表位的預(yù)測與分析
發(fā)布時間:2018-01-20 16:10
本文關(guān)鍵詞: 結(jié)核病 Rvc 表位預(yù)測 出處:《實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志》2017年01期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的:預(yù)測結(jié)核分枝桿菌Rv2657c蛋白的抗原表位,了解其免疫原性。方法:應(yīng)用DNAStar軟件預(yù)測Rv2657c蛋白的T細(xì)胞和B細(xì)胞表位;Blast方法分析該蛋白氨基酸序列與人類蛋白序列的相似性;SYFPEITHI超基序法、BIMAS量化基序法及Net CTL法預(yù)測蛋白的CTL表位;RANKPEP及SYFPEITHI超基序法遠(yuǎn)程預(yù)測Th細(xì)胞表位。結(jié)果:DNAStar軟件預(yù)測Rv2657c蛋白有5個B細(xì)胞抗原表位,6個T細(xì)胞抗原表位。SYFPEITHI超基序法、BIMAS量化基序法及Net CTL法預(yù)測該蛋白有6個CTL表位;RANKPEP及SYFPEITHI超基序法預(yù)測該蛋白有38個Th表位。結(jié)論:Rv2657c蛋白既有B細(xì)胞表位也有T細(xì)胞表位,可能成為結(jié)核病診斷抗原分子和候選疫苗抗原。
[Abstract]:Objective: to predict the antigenic epitopes of Rv2657c protein of Mycobacterium tuberculosis and to understand its immunogenicity. Methods: DNAStar software was used to predict the T and B cell epitopes of Rv2657c protein. The amino acid sequence of the protein was similar to that of human protein by Blast. SYFPEITHI hypermoticons were used to predict the CTL epitopes of proteins by quantitative motifs of BIMAS and Net CTL. RANKPEP and SYFPEITHI hypermotifs were used to predict Th cell epitopes. Results 5 B cell epitopes of Rv2657c protein were predicted by the software of SYFPEITHI Star. Six T cell epitopes. SYFPEITHI were used to predict the existence of six CTL epitopes by BIMAS quantization motifs and Net CTL methods. RANKPEP and SYFPEITHI hypermotifs were used to predict 38 Th epitopes of the protein. Conclusion: 1 Rv2657c protein has both B cell epitopes and T cell epitopes. It may be a diagnostic antigen molecule and a candidate vaccine antigen for tuberculosis.
【作者單位】: 河北北方學(xué)院;解放軍第三0九醫(yī)院全軍結(jié)核病研究所/全軍結(jié)核病防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:“十二五”國家重大科技專項(xiàng)(編號:2013ZX10003003-005) 軍隊(duì)醫(yī)學(xué)科技“十二五”重點(diǎn)項(xiàng)目(編號:BWS11J050) 北京市科技創(chuàng)新基地培育與發(fā)展工程專項(xiàng)(編號:Z141107004414021) 解放軍第309醫(yī)院重點(diǎn)課題(編號:2015ZD-004)
【分類號】:R52
【正文快照】: 結(jié)核病是全球第二大主要致死性傳染病,據(jù)報道,2014年全球新發(fā)現(xiàn)600萬結(jié)核病患者,150萬人死于結(jié)核病[1]。全球大約有1/3的人口感染了結(jié)核分枝桿菌(mycobacterium tuberculosis,Mtb)[2]。Mtb感染后被機(jī)體抑制,但是又不能完全清除,發(fā)展為結(jié)核潛伏感染(latent tuberculosis infect
【參考文獻(xiàn)】
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1 王東方;白雪娟;劉銀萍;梁艷;吳雪瓊;林明貴;;結(jié)核分枝桿菌潛伏感染相關(guān)蛋白Rv2004c的抗原表位預(yù)測[J];生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志;2016年02期
2 吳雪瓊;梁艷;王國治;;γ干擾素釋放試驗(yàn)臨床應(yīng)用的價值、問題與展望[J];中國防癆雜志;2015年07期
3 李江英;白雪娟;梁艷;張俊仙;陽幼榮;趙衛(wèi)國;吳雪瓊;;用DNAStar軟件預(yù)測Rv1410c結(jié)核分枝桿菌蛋白抗原表位[J];細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志;2015年04期
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【共引文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 楊丹;白雪娟;陽幼榮;林明貴;吳雪瓊;;結(jié)核潛伏感染蛋白Rv2657c T細(xì)胞和B細(xì)胞表位的預(yù)測與分析[J];實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志;2017年01期
2 楊妍;朱sソ,
本文編號:1448833
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