北京地區(qū)37例流感患者的病毒遺傳變異及耐藥突變分析
本文關(guān)鍵詞: 流感病毒 人 金剛烷胺 神經(jīng)氨酸酶抑制劑 抗藥性 突變 出處:《解放軍醫(yī)學(xué)雜志》2016年02期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的分析2013-2014年度北京地區(qū)A型H1N1、H3N2和B型流感病毒神經(jīng)氨酸酶(NA)基因的遺傳變異情況,以及流感病毒對金剛烷胺類和NA抑制劑類(NAIs)抗病毒藥物的耐藥變異情況。方法從37例流感病毒感染患者的鼻/咽拭子樣本中提取RNA,采用熒光定量PCR檢測流感病毒的基因型/亞型;反轉(zhuǎn)錄PCR方法擴(kuò)增A型流感病毒的NA和基質(zhì)蛋白M2(M2)基因片段及B型流感病毒的NA和血凝素(HA)基因片段,直接DNA測序。采用Mega軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹分析病毒的演變情況,Vector NTI軟件分析耐藥變異情況。結(jié)果 37例患者中共檢出A型流感病毒29例,其中H1N1 23例,H3N2 6例;B型流感病毒8例。所有A型流感病毒均發(fā)生M2基因S31N金剛烷胺類藥物耐藥位點變異。A型和B型流感病毒均未發(fā)現(xiàn)NAIs耐藥位點變異。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,B型流感病毒有5例樣品NA基因和HA基因分型不一致,NA基因均為B-Victoria系,而HA基因為B-Yamagata系。結(jié)論北京地區(qū)人群A型流感病毒均對金剛烷胺類藥物耐藥,但A型和B型病毒均未檢測出NAIs耐藥變異。B型流感病毒流行株中存在B-Yamagata系和B-Victoria系重組病毒株。
[Abstract]:Objective to analyze the genetic variation of neuraminidase (neuraminidase NAA) gene of H1N1 H1H3N2 and influenza B virus in Beijing in 2013-2014. RNA was extracted from nasal / pharyngeal swab samples of 37 patients with influenza virus infection. The genotype / subtype of influenza virus was detected by fluorescence quantitative PCR. The na and matrix protein M2M2) gene fragment of influenza A virus and the na and hemagglutinin (HA) gene fragment of influenza B virus were amplified by reverse transcription PCR. Direct DNA sequencing. Using Mega software to construct phylogenetic tree to analyze the evolution of virus. Results 29 cases of influenza A virus were detected in 37 patients, including 23 cases of H1N1 and 6 cases of H3N2. 8 cases of influenza B virus. All influenza viruses of type A developed M2 gene S31N amantadine drug resistance site variation. No mutation of NAIs resistance site was found in type A and B influenza viruses. Analysis shows. In 5 cases of influenza B virus, na gene and HA gene were all B-Victoria lines. Conclusion all influenza A viruses in Beijing area are resistant to amantadine drugs. But neither type A virus nor type B virus detected the recombinant strains of B-Yamagata strain and B-Victoria strain in the NAIs resistant variant.
【作者單位】: 廣東醫(yī)學(xué)院檢驗學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究所;解放軍第302醫(yī)院臨床研究管理中心;
【基金】:北京市科委科技計劃項目(D131100005313016) 新發(fā)突發(fā)傳染病研究北京市重點實驗室資助項目(2014XFTF04) 全軍醫(yī)學(xué)科技“十二五”科研項目重點課題(BWS11J048)~~
【分類號】:R511.7
【正文快照】: 流感病毒可在全球范圍內(nèi)大流行或呈季節(jié)性流行,威脅公共衛(wèi)生安全。流感病毒屬于正黏病毒科(orthomyxoviridae),是有包膜的單股負(fù)鏈RNA病毒,共8條RNA鏈,編碼11種蛋白質(zhì),根據(jù)核衣殼蛋白抗原性的不同,分為甲(A)、乙(B)、丙(C)3型。A型流感病毒根據(jù)膜表面的糖蛋白血凝素(hemagglut
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